Programa de Pós-Graduação em Microbiologia Agropecuária

Alessandro de Mello Varani

Pesquisador (nível II) da Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Câmpus de Jaboticabal - UNESP - FCAV. Trabalho desenvolvendo diversas linhas de pesquisa nas áreas de (meta)-genômica e bioinformática de micro-organismos e plantas. Estudo o genoma de plantas carnívoras pertencentes a família das Lentibulariaceae, e também outras espécies de plantas de nossa biodiversidade, em particular Cupuaçu, Maracujá, e as plantas usadas no preparo da Ayahuasca, uma bebida enteógena produzida a partir da combinação da Banisteriopsis caapi com Psychotria viridis. No mundo procariótico, estudo o genoma de fitopatógenos, principalmente relacionado com o gênero Xanthomonas. Também estudo genomas de Cianobactérias e outras bactérias de interesse biomédico, ambiental e agronômico; assim como metagenômica aplicada a bactérias ambientais de interesse biotecnológico (consórcios bacterianos). Recentemente começei a trabalhar com genômica de bactérias ácido láticas relacionadas a produção de compostos probióticos e suas possíveis aplicações na Agropecuária. Tenho o interesse particular em estudar os mecanismos que regem a evolução e estrutura de genomas. Neste sentido, no decorrer de minha formação me especializei no papel que Elementos Transponíveis (TEs) podem desempenhar na evolução e estrutura genômica de bactérias (procariotos) e plantas. Para este fim, desenvolvi (e continuo desenvolvendo) diversas abordagens computacionais para prospectar, classificar, catalogar e analisar estes TEs, com base nos conhecimentos de seus mecanismos biológicos de mobilização revelados experimentalmente. Maiores informações na minha página pessoal: https://www.fcav.unesp.br/genomics (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/9429712259649346 (30/12/2024)

Rótulo/Grupo: Professor

Bolsa CNPq: Nível 1D

Período de análise: 2013-HOJE

Endereço: Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias de Jaboticabal, Departamento de Tecnologia. Via de Acesso Prof.Paulo Donato Castellane s/n Vila Industrial 14884000 - Jaboticabal, SP - Brasil Telefone: (16) 32097407 URL da Homepage: http://www.fcav.unesp.br/genomics

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Biologia Geral

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (91)
1. ALVES, RAFAEL MOYSÉS ; DE ABREU, VINICIUS A C ; OLIVEIRA, RAFAELY PANTOJA ; ALMEIDA, JOÃO VICTOR DOS ANJOS ; DE OLIVEIRA, MAURO DE MEDEIROS ; SILVA, SAURA R ; PASCHOAL, ALEXANDRE R ; DE ALMEIDA, SINTIA S ; DE SOUZA, PEDRO A F ; FERRO, JESUS A ; MIRANDA, VITOR F O ; FIGUEIRA, ANTONIO ; DOMINGUES, DOUGLAS S ; Varani, Alessandro M. Genomic decoding of (cupuassu) at chromosomal scale: evolutionary insights for horticultural innovation. GigaScience. v. 13, p. 1, issn: 2047-217X, 2024. Qualis: A1
2. CHAVARRO-MESA, EDISSON ; ALMEIDA, JOÃO VICTOR DOS ANJOS ; SILVA, SAURA R. ; LOPES, SIMONE SANTOS ; BARBOSA, JOSE BEETHOVEN FIGUEIREDO ; OLIVEIRA, DANILO ; CORRÊA, MARIA ALICE ; MORAES, ANA PAULA ; MIRANDA, VITOR F.O. ; PROSDOCIMI, FRANCISCO ; Varani, Alessandro M.. The mitogenomic landscape of Banisteriopsis caapi (Malpighiaceae), the sacred liana used for ayahuasca preparation. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION). v. 3, p. 1, issn: 1678-4685, 2024. Qualis: A4
3. CASTELLANE, TEREZA CRISTINA L. ; FERNANDES, CAMILA C. ; PINHEIRO, DANIEL G. ; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO ; Varani, Alessandro M.. Exploratory comparative transcriptomic analysis reveals potential gene targets associated with Cry1A.105 and Cry2Ab2 resistance in fall armyworm (Spodoptera frugiperda). FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS. v. 24, p. 129, issn: 1438-793X, 2024. Qualis: A2
4. DE MATOS, JÉSSICA PEREIRA ; RIBEIRO, DILSON FAGUNDES ; DA SILVA, ANA KARLA ; DE PAULA, CAMILA HENRIQUES ; CORDEIRO, ISABELLA FERREIRA ; LEMES, CAMILA GRACYELLE DE CARVALHO ; SANCHEZ, ANGÉLICA BIANCHINI ; ROCHA, LORRANA CACHUITE MENDES ; GARCIA, CAMILA CARRIÃO MACHADO ; ALMEIDA, NALVO F. ; ALVES, RAFAEL MOYSES ; DE ABREU, VINICIUS A. C. ; Varani, Alessandro M. ; MOREIRA, LEANDRO MARCIO. Diversity and potential functional role of phyllosphere-associated actinomycetota isolated from cupuassu (Theobroma grandiflorum) leaves: implications for ecosystem dynamics and plant defense strategies. MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS. v. 299, p. 73, issn: 1617-4615, 2024. Qualis: A4
5. RIBEIRO, DILSON FAGUNDES ; DE MATOS, JÉSSICA PEREIRA ; ROCHA, LORRANA CACHUITE MENDES ; DA SILVA, ANA KARLA ; DE PAULA, CAMILA HENRIQUES ; CORDEIRO, ISABELLA FERREIRA ; DE CARVALHO LEMES, CAMILA GRACYELLE ; SANCHEZ, ANGÉLICA BIANCHINI ; GARCIA, CAMILA CARRIÃO MACHADO ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; DE SOUZA, ROBSON FRANCISCO ; de Mello Varani, Alessandro ; ALMEIDA, NALVO FRANCO ; MOREIRA, LEANDRO MARCIO. From cactus to crop: genomic insights of a beneficial and non-pathogenic Curtobacterium flaccumfaciens strain and the evolution of its pathosystem. MOLECULAR GENETICS AND GENOMICS. v. 299, p. 105, issn: 1617-4615, 2024. Qualis: A4
6. SOUZA-BORGES, CAROLINA HELOISA ; UTSUNOMIA, RICARDO ; Varani, Alessandro M ; ULIANO-SILVA, MARCELA ; LIRA, LIESCHEN VALERIA G ; BUTZGE, ARNO J ; GOMEZ AGUDELO, JOHN F ; MANSO, SHISLEY ; FREITAS, MILENA V ; ARIEDE, RAQUEL B ; MASTROCHIRICO-FILHO, VITO A ; PENALOZA, CAROLINA ; BARRIA, AGUSTÍN ; PORTO-FORESTI, FÁBIO ; FORESTI, FAUSTO ; HATTORI, RICARDO ; GUIGUEN, YANN ; HOUSTON, ROSS D ; HASHIMOTO, DIOGO TERUO. assembly and characterization of a highly degenerated ZW sex chromosome in the fish. GigaScience. v. 13, p. 1, issn: 2047-217X, 2024. Qualis: A1
7. SILVA, SAURA R. ; F. O. MIRANDA, VITOR ; MICHAEL, TODD P. ; P'ACHNO, BARTOSZ J. ; MATOS, RAMON G. ; ADAMEC, LUBOMIR ; L. K. POND, SERGEI ; LUCACI, ALEXANDER G. ; PINHEIRO, DANIEL G. ; Varani, Alessandro M.. The phylogenomics and evolutionary dynamics of the organellar genomes in carnivorous Utricularia and Genlisea species (Lentibulariaceae). MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION. v. 1, p. 107711, issn: 1055-7903, 2023. Qualis: A1
8. MENDONÇA, CARLOS M.N. ; OLIVEIRA, RODRIGO C. ; PIZAURO, LUCAS J.L. ; PEREIRA, WELLISON A. ; ABBOUD, KAHLILE ; ALMEIDA, SONIA ; WATANABE, II-SEI ; Varani, Alessandro M. ; DOMÍNGUEZ, JOSÉ M. ; CORREA, BENEDITO ; VENEMA, KOEN ; AZEVEDO, PAMELA O.S. ; OLIVEIRA, RICARDO P.S.. Tracking new insights into antifungal and anti-mycotoxigenic properties of a biofilm forming Pediococcus pentosaceus strain isolated from grain silage. INTERNATIONAL JOURNAL OF FOOD MICROBIOLOGY. v. 1, p. 110337, issn: 0168-1605, 2023. Qualis: A1
9. DE ABREU, CARLOS GODINHO ; WURDIG ROESCH, LUIZ FERNANDO ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; SILVA, SAURA RODRIGUES ; JUNQUEIRA DE MORAES, TATIANA SILVEIRA ; ZIED, DIEGO CUNHA ; DE SIQUEIRA, FÉLIX GONÇALVES ; DIAS, EUSTÁQUIO SOUZA ; Varani, Alessandro M. ; PYLRO, VICTOR SATLER. Decoding the chromosome-scale genome of the nutrient-rich Agaricus subrufescens: A Resource for fungal biology and biotechnology. RESEARCH IN MICROBIOLOGY. v. 1, p. 104116, issn: 0923-2508, 2023. Qualis: A4
10. Chandler, Mick ; ROSS, KAREN ; Varani, Alessandro M.. The insertion sequence excision enhancer: A PrimPol-based primer invasion system for immobilizing transposon-transmitted antibiotic resistance genes. MOLECULAR MICROBIOLOGY. v. 1, p. 1, issn: 0950-382X, 2023. Qualis: A2
11. DE ABREU, VINICIUS A.C. ; MOYSÉS ALVES, RAFAEL ; SILVA, SAURA R. ; FERRO, JESUS A. ; DOMINGUES, DOUGLAS S. ; MIRANDA, VITOR F.O. ; Varani, Alessandro M.. Comparative analyses of Theobroma cacao and T. grandiflorum mitogenomes reveal conserved gene content embedded within complex and plastic structures. GENE. v. 849, p. 146904, issn: 0378-1119, 2023. Qualis: A4
12. LORENZI, ADRIANA STURION ; BONATELLI, MARIA LETÍCIA ; Varani, Alessandro M. ; QUECINE, MARIA CAROLINA ; BITTENCOURT-OLIVEIRA, MARIA DO CARMO. Draft genome sequence of the cyanobacterium Sphaerospermopsis aphanizomenoides BCCUSP55 from the Brazilian semiarid region reveals potential for anti-cancer applications. ARCHIVES OF MICROBIOLOGY. v. 204, p. 4, issn: 0302-8933, 2022. Qualis: B2
13. VARANI, ALESSANDRO; HE, SUSU ; Siguier, Patricia ; ROSS, KAREN ; Chandler, Michael. Response from Varani et al. to -Comment on `the IS6 family, a clinically important group of insertion sequences including IS26? by Ruth M. Hall-. Mobile DNA. v. 13, p. 2, issn: 1759-8753, 2022. Qualis: A1
14. DO AMARAL, RENAN BRESSIANINI ; CARDOZO, MARITA VEDOVELLI ; Varani, Alessandro de Mello ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; FURQUIM, MARIA EDUARDA CHIARADIA ; DIAS, CLARA MORATO ; SANTANA, MATHEUS DE SOUZA ; DE ASSIS, WILLIAM OLIVEIRA ; DA SILVA, ALANDERSON RODRIGUES ; HERRERA, HEITOR MIRAGLIA ; ANDRÉ, MARCOS ROGÉRIO. Bartonella machadoae sp. nov. isolated from wild rodents in the Pantanal wetland. ACTA TROPICA. v. 1, p. 106368, issn: 0001-706X, 2022. Qualis: A1
15. PATANÉ, JOSÉ S.L. ; MOREIRA, LEANDRO M. ; DE MELO TEIXEIRA, MARCUS ; MARTINS, JOAQUIM ; Setubal, João C. ; Varani, Alessandro M.. New insights into Plant natriuretic peptide evolution: From the lysogenic conversion in Xanthomonas to the lateral transfer to the whitefly Bemisia tabaci. GENE. v. 1, p. 146326, issn: 0378-1119, 2022. Qualis: A4
16. GUEDES MATOS, RAMON ; RODRIGUES DA SILVA, SAURA ; JAN P'ACHNO, BARTOSZ ; ADAMEC, LUBOMÍR ; MICHAEL, TODD P. ; de Mello Varani, Alessandro ; MIRANDA, VITOR F.O.. The complete mitochondrial genome of carnivorous Genlisea tuberosa (Lentibulariaceae): structure and evolutionary aspects. GENE. v. 1, p. 146391, issn: 0378-1119, 2022. Qualis: A4
17. DE OLIVEIRA, AMANDA C. P. ; FERREIRA, RAFAEL M. ; FERRO, MARIA INÊS T. ; FERRO, JESUS A. ; ZAMUNER, CAIO ; FERREIRA, HENRIQUE ; Varani, Alessandro M.. XAC4296 Is a Multifunctional and Exclusive Xanthomonadaceae Gene Containing a Fusion of Lytic Transglycosylase and Epimerase Domains. Microorganisms. v. 10, p. 1008, issn: 2076-2607, 2022. Qualis: B1
18. SARAIVA, MAURO DE MESQUITA SOUSA ; BENEVIDES, VALDINETE PEREIRA ; SILVA, NÚBIA MICHELLE VIEIRA DA ; Varani, Alessandro de Mello ; FREITAS NETO, OLIVEIRO CAETANO DE ; BERCHIERI, ÂNGELO ; DELGADO-SUÁREZ, ENRIQUE JESÚS ; ROCHA, ALAN DOUGLAS DE LIMA ; EGUALE, TADESSE ; MUNYALO, JANET AGNES ; KARIUKI, SAMUEL ; GEBREYES, WONDWOSSEN ABEBE ; OLIVEIRA, CELSO JOSÉ BRUNO DE. Genomic and Evolutionary Analysis of Salmonella enterica Serovar Kentucky Sequence Type 198 Isolated From Livestock In East Africa. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. v. 12, p. 1, issn: 2235-2988, 2022. Qualis: A1
19. LARA, VIRGINIA M. ; MENDONÇA, CARLOS M.N. ; SILVA, FRANCISCO V.S. ; MARGUET, EMILIO R. ; VALLEJO, MARISOL ; CONVERTI, ATTILIO ; Varani, Alessandro M. ; GLIEMMO, MARÍA F. ; CAMPOS RESOURCE, CARMEN A. ; OLIVEIRA, RICARDO P.S.. Characterization of Lactiplantibacillus plantarum Tw226 strain and its use for the production of a new membrane-bound biosurfactant. JOURNAL OF MOLECULAR LIQUIDS. v. 1, p. 119889, issn: 0167-7322, 2022. Qualis: A1
20. DO AMARAL, RENAN BRESSIANINI ; CARDOZO, MARITA VEDOVELLI ; Varani, Alessandro de Mello ; FURQUIM, MARIA EDUARDA CHIARADIA ; DIAS, CLARA MORATO ; ASSIS, WILLIAM OLIVEIRA DE ; DA SILVA, ALANDERSON RODRIGUES ; HERRERA, HEITOR MIRAGLIA ; MACHADO, ROSANGELA ZACARIAS ; ANDRÉ, MARCOS ROGÉRIO. First Report of Bartonella spp. in Marsupials from Brazil, with a Description of Bartonella harrusi sp. nov. and a New Proposal for the Taxonomic Reclassification of Species of the Genus Bartonella. Microorganisms. v. 10, p. 1609, issn: 2076-2607, 2022. Qualis: B1
21. DE LIMA FERREIRA, JULIE KENNYA ; de Mello Varani, Alessandro ; TÓTOLA, MARCOS ROGÉRIO ; FERNANDES ALMEIDA, MICHELLE ; DE SOUSA MELO, DIRCEU ; FERREIRA SILVA E BATISTA, CRISTINA ; CHALFUN-JUNIOR, ANTONIO ; PIMENTA DE OLIVEIRA, KELLEN KAUANNE ; WURDIG ROESCH, LUIZ FERNANDO ; SATLER PYLRO, VICTOR. Phylogenomic characterization and pangenomic insights into the surfactin-producing bacteria Bacillus subtilis strain RI4914. BRAZILIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY. v. 1, p. 1-0, issn: 1517-8382, 2022. Qualis: B1
22. RODRIGUES BLANCO, IAGO ; JOSÉ LUDUVERIO PIZAURO, LUCAS ; VICTOR DOS ANJOS ALMEIDA, JOÃO ; MIGUEL NÓBREGA MENDONÇA, CARLOS ; de Mello Varani, Alessandro ; PINHEIRO DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO. Pan-genomic and comparative analysis of Pediococcus pentosaceus focused on the in silico assessment of pediocin-like bacteriocins. COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL. v. 1, p. 1, issn: 2001-0370, 2022. Qualis: Não identificado (COMPUTATIONAL AND STRUCTURAL BIOTECHNOLOGY JOURNAL)
23. Varani, Alessandro M.; SILVA, SAURA R. ; LOPES, SIMONE ; BARBOSA, JOSE BEETHOVEN FIGUEIREDO ; OLIVEIRA, DANILO ; CORRÊA, MARIA ALICE ; MORAES, ANA PAULA ; MIRANDA, VITOR F.O. ; PROSDOCIMI, FRANCISCO. The complete organellar genomes of the entheogenic plant Psychotria viridis (Rubiaceae), a main component of the ayahuasca brew. PeerJ. v. 10, p. e14114, issn: 2167-8359, 2022. Qualis: A2
24. RODRIGUES, ROMÁRIO ALVES ; PIZAURO, LUCAS JOSÉ LUDUVERIO ; Varani, Alessandro de Mello ; DE ALMEIDA, CAMILA CHIODA ; SILVA, SAURA RODRIGUES ; CARDOZO, MARITA VEDOVELLI ; MACINNES, JANET I. ; KROPINSKI, ANDREW M. ; MELO, POLIANA DE CASTRO ; ÁVILA, FERNANDO ANTONIO. Comparative genomics study of Staphylococcus aureus isolated from cattle and humans reveals virulence patterns exclusively associated with bovine clinical mastitis strains. Frontiers in Microbiology. v. 13, p. 1, issn: 1664-302X, 2022. Qualis: A1
25. GALETTI, RENATA ; PENHA FILHO, R. A. C. ; FERREIRA, JOSEANE CRISTINA ; Varani, Alessandro M. ; SAZINAS, P. ; JELSBAKC, L. ; DARINI, ANA LÚCIA COSTA. The plasmidome of multidrug-resistant emergent Salmonella serovars isolated from poultry. INFECTION GENETICS AND EVOLUTION. v. 1, p. 104716, issn: 1567-1348, 2021. Qualis: A2
26. BUENO, DANILO ; PEDROLLI, DANIELLE B. ; MARTINS, PAULA M. M. ; BOCCHINI, DANIELA A. ; MORAES, KAREN C. M. ; FACINCANI, AGDA P. ; FERRO, JESUS A. ; Varani, Alessandro M. ; PENA, MICHELLE M. ; FERREIRA, HENRIQUE. Riboswitch theo/metE as a Transcription Regulation Tool for Xanthomonas citri subsp. citri. Microorganisms. v. 9, p. 329, issn: 2076-2607, 2021. Qualis: B1
27. VARANI, ALESSANDRO; HE, SUSU ; Siguier, Patricia ; ROSS, KAREN ; Chandler, Michael. The IS6 family, a clinically important group of insertion sequences including IS26. Mobile DNA. v. 12, p. 11, issn: 1759-8753, 2021. Qualis: A1
28. WEISS, BRUNO ; SOUZA, ANNA CAROLINA OLIVEIRA ; CONSTANCIO, MILENA TAVARES LIMA ; ALVARENGA, DANILLO OLIVEIRA ; PYLRO, VICTOR S. ; ALVES, LUCIA M. CARARETO ; Varani, Alessandro M.. Unraveling a Lignocellulose-Decomposing Bacterial Consortium from Soil Associated with Dry Sugarcane Straw by Genomic-Centered Metagenomics. Microorganisms. v. 9, p. 995, issn: 2076-2607, 2021. Qualis: B1
29. ALVARENGA, DANILLO OLIVEIRA ; ANDREOTE, ANA PAULA DINI ; BRANCO, LUIS HENRIQUE ZANINI ; DELBAJE, ENDREWS ; CRUZ, RENATA BEATRIZ ; Varani, Alessandro de Mello ; FIORE, MARLI FÁTIMA. Amazonocrinis nigriterrae gen. nov., sp. nov., Atlanticothrix silvestris gen. nov., sp. nov. and Dendronalium phyllosphericum gen. nov., sp. nov., nostocacean cyanobacteria from Brazilian environments. INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY. v. 71, p. 1, issn: 1466-5026, 2021. Qualis: A2
30. ASSIS, RENATA DE A.B. ; Varani, Alessandro M. ; SAGAWA, CINTIA H.D. ; PATANÉ, JOSÉ S.L. ; SETUBAL, JOÃO CARLOS ; UCEDA-CAMPOS, GUILLERMO ; DA SILVA, ALINE MARIA ; ZAINI, PAULO A. ; ALMEIDA, NALVO F. ; MOREIRA, LEANDRO MARCIO ; DANDEKAR, ABHAYA M.. A comparative genomic analysis of Xanthomonas arboricola pv. juglandis strains reveal hallmarks of mobile genetic elements in the adaptation and accelerated evolution of virulence. GENOMICS. v. 1, p. 1, issn: 0888-7543, 2021. Qualis: A3
31. MAYUMI KUNIYOSHI, TAÍS ; MIGUEL NÓBREGA MENDONÇA, CARLOS ; BORGES VIEIRA, VIVIANE ; ROBL, DIOGO ; DORA GOMBOSSY DE MELO FRANCO, BERNADETTE ; DIMITROV TODOROV, SVETOSLAV ; TOMÉ, ELISABETTA ; MARY O'CONNOR, PAULA ; CONVERTI, ATTILIO ; LUIZ ARAUJO, WELINGTON ; PAULA SILVA PALMEIRAS VASCONCELLOS, LÍVIA ; de Mello Varani, Alessandro ; DAVID COTTER, PAUL ; CÂNDIDA RABELO, SARITA ; PINHEIRO DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO. Pediocin PA-1 production by Pediococcus pentosaceus ET34 using non-detoxified hemicellulose hydrolysate obtained from hydrothermal pretreatment of sugarcane bagasse. BIORESOURCE TECHNOLOGY. v. 1, p. 125565, issn: 0960-8524, 2021. Qualis: A1
32. COSTA, ZIRLANE PORTUGAL ; VARANI, ALESSANDRO MELLO ; CAUZ'SANTOS, LUIZ AUGUSTO ; SADER, MARIELA ANALÍA ; GIOPATTO, HELENA AUGUSTO ; ZIRPOLI, BRUNA ; CALLOT, CAROLINE ; CAUET, STEPHANE ; MARANDE, WILLIAN ; SOUZA CARDOSO, JESSICA LUANA ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; KITAJIMA, JOÃO PAULO ; DORNELAS, MARCELO CARNIER ; HARAND, ANDREA PEDROSA ; BERGES, HELENE ; MONTEIRO'VITORELLO, CLAUDIA BARROS ; CARNEIRO VIEIRA, MARIA LUCIA. A genome sequence resource for the genus , the genome of the wild diploid species. Plant Genome. v. 1, p. 1, issn: 1940-3372, 2021. Qualis: A1
33. PIZAURO, LUCAS JOSÉ LUDUVERIO ; DE ALMEIDA, CAMILA CHIODA ; SILVA, SAURA RODRIGUES ; MACINNES, JANET I. ; KROPINSKI, ANDREW M. ; ZAFALON, LUIZ FRANCISCO ; DE AVILA, FERNANDO ANTÔNIO ; de Mello Varani, Alessandro. Genomic comparisons and phylogenetic analysis of mastitis-related staphylococci with a focus on adhesion, biofilm, and related regulatory genes. Scientific Reports. v. 11, p. 17392, issn: 2045-2322, 2021. Qualis: A2
34. ROSS, KAREN ; Varani, Alessandro M. ; SNESRUD, ERIK ; HUANG, HONGZHAN ; ALVARENGA, DANILLO OLIVEIRA ; ZHANG, JIAN ; WU, CATHY ; MCGANN, PATRICK ; Chandler, Mick. TnCentral: a Prokaryotic Transposable Element Database and Web Portal for Transposon Analysis. mBio. v. 1, p. 1, issn: 2150-7511, 2021. Qualis: A1
35. PEDRO, DANIEL LONGHI FERNANDES ; AMORIM, THARCISIO SOARES ; VARANI, ALESSANDRO ; GUYOT, ROMAIN ; DOMINGUES, DOUGLAS SILVA ; PASCHOAL, ALEXANDRE ROSSI. An Atlas of Plant Transposable Elements. F1000RESEARCH. v. 10, p. 1194, issn: 2046-1402, 2021. Qualis: A4
36. SILVA, SAURA R. ; MORAES, ANA PAULA ; PENHA, HELEN A. ; JULIÃO, MARIA H. M. ; DOMINGUES, DOUGLAS S. ; MICHAEL, TODD P. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; Varani, Alessandro M.. The Terrestrial Carnivorous Plant Utricularia reniformis Sheds Light on Environmental and Life-Form Genome Plasticity. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 21, p. 3, issn: 1422-0067, 2020. Qualis: A2
37. LIMA-MENDEZ, GIPSI ; Oliveira Alvarenga, Danillo ; ROSS, KAREN ; HALLET, BERNARD ; VAN MELDEREN, LAURENCE ; Varani, Alessandro M. ; Chandler, Michael. Toxin-Antitoxin Gene Pairs Found in Tn 3 Family Transposons Appear To Be an Integral Part of the Transposition Module. mBio. v. 11, p. 1, issn: 2150-7511, 2020. Qualis: A1
38. ALVARENGA, DANILLO O. ; FRANCO, MAIONE W. ; SIVONEN, KAARINA ; FIORE, MARLI F. ; Varani, Alessandro M.. Evaluating Eucalyptus leaf colonization by Brasilonema octagenarum (Cyanobacteria, Scytonemataceae) using in planta experiments and genomics. PeerJ. v. 8, p. e9158, issn: 2167-8359, 2020. Qualis: A2
39. JULIÃO, MARIA H. M. ; SILVA, SAURA R. ; FERRO, JESUS A. ; Varani, Alessandro M.. A Genomic and Transcriptomic Overview of MATE, ABC, and MFS Transporters in Citrus sinensis Interaction with Xanthomonas citri subsp. citri. PLANTS. v. 9, p. 794, issn: 2223-7747, 2020. Qualis: A2
40. CONSTANCIO, MILENA TAVARES LIMA ; SACCO, LAÍS POSTAI ; CAMPANHARO, JOÃO CARLOS ; CASTELLANE, TEREZA CRISTINA LUQUE ; DE OLIVEIRA SOUZA, ANNA CAROLINA ; WEISS, BRUNO ; de Mello Varani, Alessandro ; ALVES, LÚCIA MARIA CARARETO. Exploring the Potential of Two Bacterial Consortia to Degrade Cellulosic Biomass for Biotechnological Applications. CURRENT MICROBIOLOGY. v. 1, p. 1, issn: 0343-8651, 2020. Qualis: B1
41. FELESTRINO, ÉRICA BARBOSA ; SANCHEZ, ANGÉLICA BIANCHINI ; CANESCHI, WASHINGTON LUIZ ; LEMES, CAMILA GRACYELLE DE CARVALHO ; ASSIS, RENATA DE ALMEIDA BARBOSA ; CORDEIRO, ISABELLA FERREIRA ; FONSECA, NATASHA PEIXOTO ; VILLA, MORGHANA MARINA ; VIEIRA, IZADORA TABUSO ; KAMINO, LUCIANA HIROMI YOSHINO ; DO CARMO, FLÁVIO FONSECA ; DA SILVA, ALINE MARIA ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; PATANÉ, JOSÉ SALVATORE LEISTER ; FERREIRA, FERNANDA CARLA ; DE FREITAS, LEANDRO GRASSI ; Varani, Alessandro de Mello ; FERRO, JESUS APARECIDO ; SILVA, ROBSON SOARES ; ALMEIDA, NALVO FRANCO ; et.al. Complete genome sequence and analysis of Alcaligenes faecalis strain Mc250, a new potential plant bioinoculant. PLoS One. v. 15, p. e0241546, issn: 1932-6203, 2020. Qualis: A1
42. FERRASA, ADRIANO ; MURATA, MAYARA M ; COFRE, TERESA D C G ; CAVALLINI, JULIANA S ; PERON, GUSTAVO ; JULIÃO, MARIA H M ; BELASQUE, JOSÉ ; FERREIRA, HENRIQUE ; FERRO, MARIA INÊS T ; LEITE, RUI P ; PENHA, HELEN A ; CARVALHO, FLÁVIA M S ; Varani, Alessandro M ; HERAI, ROBERTO H ; FERRO, JESUS A. CitrusKB: a comprehensive knowledge base for transcriptome and interactome of spp. infected by subsp. at different infection stages. Database-The Journal of Biological Databases and Curation. v. 2020, p. 1, issn: 1758-0463, 2020. Qualis: A1
43. PYLRO, VICTOR SATLER ; DIAS, ARMANDO CAVALCANTE FRANCO ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; Varani, Alessandro de Mello ; LEITE, LAURA RABELO ; ANDREOTE, CRISTIANE CIPOLLA FASANELLA ; BERNARDO, EDUARDO ROBERTO DE ALMEIDA ; MARTINS, THALES FACANALI. Closed Genome Sequence of Bacillus paralicheniformis Strain CBMAI 1303, a Bacterium Applied for Phytopathogen Biocontrol. Microbiology Resource Announcements. v. 8, p. 1, issn: 2576-098X, 2019. Qualis: C
44. GALETTI, RENATA ; NEVES ANDRADE, LEONARDO ; VARANI, A. M. ; DARINI, A. L. C.. SPM-1-producing Pseudomonas aeruginosa ST277 carries a chromosomal pack of acquired resistance genes: An example of high-risk clone associated with `intrinsic resistome?. Journal of Global Antimicrobial Resistance. v. 16, p. 183-186, issn: 2213-7165, 2019. Qualis: B1
45. GALETTI, RENATA ; ANDRADE, LEONARDO NEVES ; Varani, Alessandro M. ; DARINI, ANA LÚCIA COSTA. A Phage-Like Plasmid Carrying blaKPC-2 Gene in Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa. Frontiers in Microbiology. v. 10, p. 1, issn: 1664-302X, 2019. Qualis: A1
46. GALETTI, RENATA ; ANTONIO CASARIN PENHA FILHO, RAFAEL ; FERREIRA, JOSEANE CRISTINA ; M. VARANI, ALESSANDRO ; COSTA DARINI, ANA LÚCIA. Antibiotic resistance and heavy metal tolerance plasmids: the antimicrobial bulletproof properties of Escherichia fergusonii isolated from poultry
  . Infection and Drug Resistance. v. Volume 12, p. 1029-1033, issn: 1178-6973, 2019. Qualis: A1
47. SILVA, EDVALDO APARECIDO AMARAL DA ; ACENCIO, MARCIO LUIS ; BOVOLENTA, LUIZ AUGUSTO ; LEMKE, NEY ; Varani, Alessandro de Mello ; BRAVO, JULIANA PEREIRA ; HOSHINO-BEZERRA, ANDREA AKEMI ; LEMOS, ELIANA GERTRUDES MACEDO. Gene expression during the germination of coffee seed. JOURNAL OF SEED SCIENCE. v. 41, p. 168-179, issn: 2317-1537, 2019. Qualis: B1
48. LEMOS, LEANDRO N. ; MEDEIROS, JULLIANE D. ; DINI'ANDREOTE, FRANCISCO ; FERNANDES, GABRIEL R. ; Varani, Alessandro M. ; OLIVEIRA, GUILHERME ; PYLRO, VICTOR S.. Genomic signatures and co-occurrence patterns of the ultra-small Saccharimonadia ( /Patescibacteria phylum) suggest a symbiotic lifestyle. MOLECULAR ECOLOGY. v. 1, p. mec.15208, issn: 0962-1083, 2019. Qualis: A1
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Livros publicados/organizados ou edições (1)
1. VARANI, A. M.; RODRIGUES, J. D. B. (Org.). Tópicos especiais em genética aplicada - Volume 8. 1 ed. Jaboticabal, SP: Fundação de Apoio à Pesquisa, Ensino e Extensão - Funep, 2023. v. 1, p. 154.
Capítulos de livros publicados (9)
1. ROSS, KAREN ; Zerillo, Marcelo Marques ; Chandler, Mick ; Varani, Alessandro M.. Annotation and Comparative Genomics of Prokaryotic Transposable Elements. Em: Setubal, J.C., Stadler, P.F., Stoye, J. (eds) Comparative Genomics.. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed. : Springer US. 2024.v. 2, p. 189-213.
2. Varani, Alessandro M.; ROSS, Karen E. ; Chandler, Mick. Prokaryotic Transposable Elements. Transposable Elements and Genome Evolution. 1ed. Em: . : Wiley. 2024.p. 21-60.
3. VIEIRA, M. L. C. ; COSTA, Z. P. ; Varani, A.M. ; SADER, MARIELA ANALÍA ; CAUZ-SANTOS, LUIZ AUGUSTO ; GIOPATTO, HELENA AUGUSTO ; REÁTEGUI, ALINA CARMEN EGOÁVIL ; BERGES, HÉLÈNE ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B. ; DORNELAS, MARCELO CARNIER ; HARAND, ANDREA PEDROSA. The Passion Fruit Genome. Em: Chapman, M.A. (eds). (Org.). Underutilised Crop Genomes. Compendium of Plant Genomes.. 1ed. : Springer, Cham. 2022.v. 1, p. 8.
4. Oliveira Alvarenga, Danillo ; MOREIRA, LEANDRO M. ; Chandler, Mick ; Varani, Alessandro M.. A Practical Guide for Comparative Genomics of Mobile Genetic Elements in Prokaryotic Genomes. Methods in Molecular Biology. 1ed. Em: . : Springer New York. 2018.p. 213-242.
5. MOREIRA, LEANDRO M. ; Varani, A.M.. Plasticidade e fluxo gênico. Em: Leandro Marcio Moreira. (Org.). Ciências Genômicas: Fundamentos e Aplicações. 1ed.Ribeirão Preto. : Sociedade Brasileira de Genética. 2016.v. 1, p. 101-116.
6. Siguier, Patricia ; GOURBEYRE, E. ; Varani, A.M. ; TON-HOANG, B. ; Chandler, Michael. Everyman's Guide to Bacterial Insertion Sequences. Em: Nancy L. Craig, Michael Chandler, Martin Gellert, Alan M. Lambowitz, Phoebe A. Rice, Suzanne B. Sandmeyer. (Org.). Mobile DNA III. 1ed.Washington DC. : American Society for Microbiology. 2015.v. 3, p. 555-590.
7. Varani, A.M.; BRANCO, L. C. ; Zerillo, Marcelo M. ; MONTEIRO-VITORELLO, C. B.. Elementos de Transposição: Classificação e Mecanismos de Mobilização. Em: Claudia Marcia Aparecida Carareto; Claudia Barros Monteiro-Vitorello; Marie-Anne Van Sluys. (Org.). Elementos de transposição: diversidade, evolução, aplicações e impacto nos genomas dos seres vivos.. 1ed.Fiocruz. : Rio de Janeiro. 2015.v. 1, p. 1-31.
8. Marcondes de Souza, Jackson Antônio ; Carrareto Alves, Lucia Maria ; de Mello Varani, Alessandro ; de Macedo Lemos, Eliana Gertrudes. The Family Bradyrhizobiaceae. The Prokaryotes. 4ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2014.p. 135-154.
9. Carrareto Alves, Lucia Maria ; de Souza, Jackson Antônio Marcondes ; Varani, Alessandro de Mello ; Lemos, Eliana Gertrudes de Macedo. The Family Rhizobiaceae. The Prokaryotes. 4ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2014.p. 419-437.
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (3)
1. MENEGHINE, A. K. ; Varani, A.M. ; ALVES, L. M. C.. DIVERSIDADE DE CIANOBACTÉRIAS EM AMOSTRAS DE ÁGUA DOCE USADA EM IRRIGAÇÃO. Em: 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, 2016. Qualis: Não identificado (1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária)
2. SACCO, L. P. ; LIMA, M. T. ; MENEGHINE, A. K. ; Varani, A.M. ; CARARETO-ALVES, L.. Potencial Biotecnológico de Bactérias na Agroindústria. Em: X Curso de Inverno em Genética, v. 1, p. 43-52, 2014.Qualis: Não identificado (X Curso de Inverno em Genética)
3. CANCELADO, S. V. ; CEPEDA, J. C. C. ; FERNANDEZ, C. C. ; VARANI, A. M. ; ALVES, L. M. CARARETO. Microbiological quality assessment of a compost produced from animal waste and vegetables. Em: SUSTAINABLE CITY 2014, p. 1469, 2014. Qualis: Não identificado (SUSTAINABLE CITY 2014)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (2)
1. AMISTA, L. C. ; PENHA, HELEN A. ; FERRASA, A. ; MURATA, M. ; CAVALINI, J. ; BELASQUE, JOSÉ ; VARANI, A. M. ; HERAI, R. ; FERRO, J. A.. EXPRESSÃO EM CITRUS DE GENES QUE CODIFICAM MEMBROS DA FAMÍLIA PR-9 DE PROTEÍNAS RELACIONADAS À PATOGÊNESE EM RESPOSTA À INFECÇÃO POR XANTHOMONAS CITRI SUBSP. CITRI. Em: Simpósio de Tecnologia Ambiental e de Biocombustíveis, 2019, Jaboticabal. Simpósio de Tecnologia Ambiental e de Biocombustíveis. Jaboticabal, 2019. Qualis: Não identificado (SIMPÓSIO DE TECNOLOGIA AMBIENTAL E DE BIOCOMBUSTÍVEIS, 2019, JABOTICABAL. SIMPÓSIO DE TECNOLOGIA AMBIENTAL E DE BIOCOMBUSTÍVEIS. JABOTICABAL)
2. PINTO, A. S. ; PEDRINHO, E. A. N. ; VARANI, A. M.. Diversidade de transposases em amostra de solo com cultivo de cana-de-açucar e solo de floresta. Em: XVII Simpósio de Genética, 2014, São José do Rio Preto. XVII Simpósio de Genética. São José do Rio Preto, v. 1, 2014. Qualis: Não identificado (XVII SIMPÓSIO DE GENÉTICA, 2014, SÃO JOSÉ DO RIO PRETO. XVII SIMPÓSIO DE GENÉTICA. SÃO JOSÉ DO RIO PRETO)
Resumos publicados em anais de congressos (111)
1. Varani, A.M.; TRINCA, V. ; SILVA, SAURA R ; MORAES, A. P. ; MIRANDA, V. F. O. ; PROSDOCIMI, F.. Toward Complete Genome Assembly of the Hexaploid and Highly Heterozygous Entheogenic Plant Psychotria viridis Using PacBio HiFi and Hi-C Technologies. Em: 20º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2024, 2024, Salvador/BA. 20º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2024, v. 1, 2024.
2. ALMEIDA, J. V. A. ; OLIVEIRA, M. M. ; MAYUMI KUNIYOSHI, TAÍS ; BLANCO, I. R. ; OLIVEIRA, RICARDO P.S. ; Varani, A.M.. Identification of Genes for Plant Polysaccharide Degradation and Vitamin Synthesis in the Microbiota of Production Animals. Em: 20º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2024, 2024, Salvador/BA. 20º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2024. Sao Paulo: AB3C, v. 1, p. 1, 2024.
3. OLIVEIRA, M. M. ; MAYUMI KUNIYOSHI, TAÍS ; BLANCO, I. R. ; ALMEIDA, J. V. A. ; PINHEIRO DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO ; Varani, A.M.. High-Resolution Bacterial Genomes through PacBio REVIO Sequencing of Pooled DNA. Em: 20º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2024, 2024, Salvador/BA. 20º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2024. Sao Paulo: AB3C, v. 1, p. 1, 2024.
4. BLANES, A. L. M. ; SOUSA, I. P. ; ALMEIDA, J. V. A. ; Varani, A.M. ; PINHEIRO DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO ; JOSÉ LUDUVERIO PIZAURO, LUCAS. Análise de genômica comparativa de bacteriocinas em Bacillus velezensis. Em: 43º Congresso Brasileiro da Anclivepa, 2024, Belo Horizonte. 43º Congresso Brasileiro da Anclivepa. Belo Horizonte, 2023.
5. CABRERA, J. M. ; PINHEIRO DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO ; Varani, A.M.. Unraveling the Dynamics of Intestinal Microbiota in Commercial Poultry: Creating a Comprehensive Metagenomic Dataset to Guide Sustainable Production Practices and Reveal Evolutionary Insights. Em: International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG, 2024, Campos de Jordão. International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG. Ribeirão Preto: SBG, 2024.
6. TRINCA, V. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, V. F. O. ; MACEDO, J. V. ; CARNAVAL, T. K. ; ARAUJO, D. B. ; PROSDOCIMI, FRANCISCO ; Varani, A.M.. Exploring the Organellar Genomes of the Entheogenic Plant Mimosa tenuiflora: Phylogenetic Analysis and Genomic Landscape. Em: International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG, 2024, Campos de Jordão. International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG. Ribeirão Preto: SBG, 2024.
7. BALLABEN, A. S. ; OLIVEIRA, F. S. ; ROSS, K. ; SETUBAL, JOAO C. ; Chandler, Michael ; Varani, A.M.. TnCentral 2.0: An Enhanced Database for High-Quality Analysis and Annotation of Prokaryotic Transposable Elements and Their Impact on Antimicrobial Resistance and Genome Evolution. Em: International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG, 2024, Campos de Jordão. International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG. Ribeirão Preto: SBG, 2024.
8. FANCONY, A. P. ; VARANI, A. M. ; PINHEIRO, D. G. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, V. F. O.. Phylogeny of Genlisea-Utricularia (Lentibulariaceae) based on alcohol dehydrogenase gene. Em: International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG, 2024, Campos de Jordão. 69º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA. Campos de Jordão: SBG, 2024.
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10. BALLABEN, A. S. ; RAMOS, C. A. ; FERREIRA, J. ; Chandler M ; Varani, A.M. ; DARINI, ANA LÚCIA COSTA ; CABRAL, S.. PLASMIDOMA DE Pseudescherichia vulneris MULTIRRESISTENTE ISOLADO DE GATO. Em: Simpósio INPRA (Instituto Nacional de Pesquisa em Resistência Antimicrobiana), 2024, 100% online. Simpósio INPRA (Instituto Nacional de Pesquisa em Resistência Antimicrobiana). Porto Alegre/RS: INPRA - INSTITUTO NACIONAL DE PEQUISA EM RESISTÊNCIA ANTIMICROBIANA, 2024.
11. RAMOS, C. A. ; CABRAL, S. ; BALLABEN, A. S. ; FERREIRA, J. ; Varani, A.M. ; DARINI, A. L. C.. CARACTERIZAÇÃO DO RESISTOMA DE Klebsiella pneumoniae ST11 ISOLADO EM AVE DE VIDA LIVRE. Em: Simpósio INPRA (Instituto Nacional de Pesquisa em Resistência Antimicrobiana), 2024, 100% online. Simpósio INPRA (Instituto Nacional de Pesquisa em Resistência Antimicrobiana), 2023.
12. AECYO, P. ; TAVARES, M. M. ; MATTOS, J. S. ; VARANI, A. M. ; PINHEIRO, F. ; CHAVES, C. J. N. ; BOMBARELY, A. ; RIANO-PACHON, D. M. ; SILVA, C. P.. GENOMIC OF LOCAL ADAPTATION OF A BROMELIAD SPECIES TO AN ELEVATION GRADIENT IN THE BRAZILIAN ATLANTIC RAINFOREST. Em: I Congresso Brasileiro de Biologia Evolutiva, 2024, Curitiba. I Congresso Brasileiro de Biologia Evolutiva, v. 1, p. 1, 2024.
13. OLIVEIRA, R. P. ; ALMEIDA, J. V. A. ; Varani, A.M.. Characterization and Phylogenetic Analysis of COBRA-Like Genes in Amazonian Malvaceae: Implications for Agricultural and Environmental Sustainability. Em: International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG, 2024, Campos de Jordão. International Congress of the Brazilian Genetics Society - 69ºCBG. Ribeirão Preto: SBG, 2024.
14. OBERTI, H. ; AECYO, P. ; OLIVEIRA, R. P. ; ALMEIDA, J. V. A. ; PROSDOCIMI, FRANCISCO ; VARANI, A. M.. Benchmarking and Improving Plant Genome Annotation Through an Combination of Bioinformatics Tools. Em: X-Meeting / BSB 2023, 2023, Curitiba , PR. X-Meeting / BSB 2023, 2023.
15. ALMEIDA, J. V. A. ; PIZAURO, LUCAS J. L. ; PINHEIRO DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO ; VARANI, A. M.. Comparative Genomic Study of Bacteriocin Genes in Ligilactobacillus salivarius. Em: 52nd Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2023, Águas de Lindoia. 52nd Annual Meeting of the Brazilian Society of Biochemistry and Molecular Biology (SBBq), 2023.
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44. COSTA, Z. P. ; CAUZ-SANTOS, LUIZ A. ; MUNHOZ, CARLA F. ; VARANI, A. M. ; Sluys, Marie-Anne Van ; RAGAGNIN, G. T. ; BERGÈS, HÉLÈNE ; VIEIRA, M. L. C.. Identification and characterization of LTR retrotransposons at lineage level from a gene-rich fraction of the Passiflora edulis (Passifloraceae) genome. Em: 2018 International Congress of Genetics, 2018, Foz do Iguaçu. 2018 International Congress of Genetics, 2018.
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105. NUNES, F. ; TANIGUTI, L. M. ; KMIT, C. P. ; VARANI, A. M. ; KITAJIMA, J. P. ; VITORELLO, C. B. M.. Complete mitochondrial genome sequence of the basideomycete Sporisorium scitamineum and evidences of a mitochondrial plasmid. Em: 59 Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindoia. Resumos do 59 o Congresso Brasileiro de Genética ? 16 a 19 de setembro de 2013, 2013.
106. SCHAKER, P. D. C. ; HOFF-RISSETI, C. ; ALVARENGA, D. O. ; Varani, A.M. ; FIORE, M. F.. Genetic evidences of cylindrospermopsin genes loss in Brazilian Cylindrospermopsis raciborskii strains. Em: 59 Congresso Brasileiro de Genética, 2013, Águas de Lindoia. Resumos do 59 o Congresso Brasileiro de Genética ? 16 a 19 de setembro de 2013, 2013.
107. FIORE, M. F. ; ALVARENGA, D. O. ; VARANI, A. M. ; HOFF-RISSETI, C. ; CRESPIM, E. ; RAMOS, R. T. J. ; SILVA, A. ; SCHAKER, P. D. C. ; HECK, K. ; SCHNEIDER, M. P. C.. Draft Genome Sequence of the Brazilian Toxic Bloom-Forming Cyanobacterium Microcystis aeruginosa Strain SPC777. Em: The 19 symposium of the international society for Cyanophyte Reseach, 2013, Cleveland, Ohio. The 19 symposium of the international society for Cyanophyte Reseach. Cleveland, Ohio, 2013.
108. SILVEIRA, P. S. ; SILVA, E. ; VARANI, A. M. ; LEMOS, E. G. M. ; TOORROP, P. ; HILHORST, H.. Análise de Transcriptoma (RNAseq) durante a superação de dormência morfofisiológica de sementes de Annona Crassiflora. Em: XVIII Congresso Brasileiro de Sementes, 2013, Florianópolis. XVIII Congresso Brasileiro de Sementes. Florianópolis, 2013.
109. FERNANDES, C. C. ; VARANI, A. M. ; SILVA, K. R. ; SANTOS, S. S. ; MONTASSIER, M. F. S.. COMPLETE GENOME OF THE PATHOGENIC STRAIN OF THE NEWCASTLE DISEASE VIRUS ISOLATED IN BRAZIL IN THE 1970?S. Em: Simpósio Internacional de Medicina Veterinária Preventiva, 2013, Jaboticabal. Ars Veterinaria. Jaboticabal: Ars Veterinaria (Ars Vet), v. 29, 2013.
110. PIRES, R. H. ; VARANI, A. M. ; ALMEIDA, A. M. F. ; GIANNINI, M. J. S. M.. DIFERENTES NÍVEIS DE EXPRESSÃO E PROTEÍNAS ESPECÍFICAS ASSOCIAM-SE AO METABOLISMO DE CARBOIDRATOS EM BIOFILMES DE CANDIDA ORTHOPSILOSIS. Em: 27° Congresso Brasileiro de Microbiologia, 2013, Natal. 27° Congresso Brasileiro de Microbiologia. Natal, 2013.
111. VARANI, A. M.; PEDRINHO, E. A. N. ; FERNANDES, C. C. ; LEMOS, E. G. M.. Exploring the prokaryotic insertion sequence abundance and diversity of brazilian sugar-cane cultivated soils. Em: 2nd Thünen Symposium on Soil Metagenomics, 2013, Braunschweig (Germany). 2nd Thünen Symposium on Soil Metagenomics. Braunschweig (Germany): 2nd Thünen Symposium on Soil Metagenomics, v. 1, p. 71-71, 2013.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (6)
1. VARANI, A. M. Insertion Sequence Excision Enhancer (IEE): a PrimPl-based system for immobilizing transposon-transmited antibiotic genes ?. 2023. Apresentação de Trabalho/Seminário
2. VARANI, A. M. Genomics of the Brazilian Biodiversity. 2023. Apresentação de Trabalho/Seminário
3. Varani, A.M. Bioinformática Aplicada ao estudo de genomas: Revelando os mistérios do mundo das bactérias e plantas. 2015. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. Varani, A.M. Genômica de Sequencias de Inserção (ISs). 2015. Apresentação de Trabalho/Seminário
5. VARANI, A. M.; MARINI, R.. ISXax2: Um transposons do tipo Tn3 relacionados com a patogenicidade e virulência de Xanthomonas citri. 2014. Apresentação de Trabalho/Seminário
6. VARANI, A. M. Introdução a bioinformática e Biologia computacional. 2013. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
Demais tipos de produção bibliográfica (0)

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (2)
1. VARANI, A. M.; ALVARENGA, D. O.. recogniZing gEnomic seqUences in metagenomic aSSemblies (ZEUSS). 2017.
2. VARANI, A. M.; ALVARENGA, D. O.. Mobile Genetic Elements Coordinates Extractor (MoGECE). 2016.
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (62)
1. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Nucleic Acids Research. 2024.
2. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Nature Microbiology. 2024.
3. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Scientific Reports. 2024.
4. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Mobile DNA. 2024.
5. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Nucleic Acids Research. 2024.
6. VARANI, A. M. Parecer de artigo submetido para a revista Nucleic Acids Research. 2023.
7. Varani, A. Parecer de artigo submetido para a revista Communications Biology. 2023.
8. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Frontiers in Bioinformatics. 2022.
9. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido a NAR Genomics and Bioinformatics. 2022.
10. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido a Plant Science. 2022.
11. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Genomics. 2022.
12. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Critical Reviews in Microbiology. 2022.
13. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Mitochondrial DNA Part B: Resources. 2021.
14. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Mitochondrial DNA Part B: Resources. 2021.
15. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista G3: Genes Genomes Genetics. 2021.
16. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Horticulture Research. 2021.
17. VARANI, A. M. Parecer de artigo submetido a Genetics and Molecular Biology (GMB). 2021.
18. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido a Mobile DNA. 2021.
19. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido a Genomics. 2021.
20. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido a Frontiers in Microbiology. 2021.
21. Varani, A.M. Parecer de artigo revista Microbial Genomics. 2020.
22. Varani, A.M. Parecer de artigo revista Scientific Reports. 2020.
23. Varani, A.M. Parecer de artigo revista Brazilian Journal of Microbiology. 2020.
24. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido a revista Mobile DNA. 2020.
25. Varani, A.M. Parecer de artigo revista Brazilian Journal of Botany. 2020.
26. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista BMC Research Note. 2020.
27. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Plants. 2020.
28. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Nucleic Acids Research. 2020.
29. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista BMC Genomics. 2020.
30. Varani, A.M. Parecer de artigo enviado para a revista Plants. 2020.
31. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Genomics. 2020.
32. VARANI, A. M. Parecer de artigo submetido para a revista PeerJ. 2019.
33. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Frontiers in Genetics. 2019.
34. VARANI, A. M. Parecer de artigo submetido para a revista PeerJ. 2019.
35. VARANI, A. M. Pareceres para 8a Edição do Prêmio Tese Destaque USP. 2019.
36. Varani, A.M. Pareceres para 7e Edição do Prêmio Tese Destaque USP. 2018.
37. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Frontiers in Microbiology. 2018.
38. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Frontiers in Genetics. 2018.
39. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Frontiers in Genetics. 2018.
40. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista PeerJ. 2018.
41. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Scientific Reports. 2018.
42. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Brazilian Journal of Microbiology. 2018.
43. VARANI, A. M. Parecer de artigo submetido para a revista Brazilian Journal of Microbiology. 2018.
44. VARANI, A. M. Parecer de artigo submetido para a revista Brazilian Journal of Microbiology. 2018.
45. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Scientific Reports. 2017.
46. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Molecular Plant Pathology. 2017.
47. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Bioinformatics. 2016.
48. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista BMC ioinformatics. 2016.
49. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Critical Reviews in Microbiology. 2016.
50. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista BMC Genomics. 2016.
51. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Molecular Ecology. 2016.
52. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Bioinformatics. 2015.
53. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista BMC Microbiology. 2015.
54. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Plant Pathology. 2015.
55. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Brasileira de Fruticultura. 2014.
56. Varani, A.M. Parecer de artigo submetido para a revista Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. 2014.
57. MIRANDA, VITOR F. O. ; SILVA, S. R. ; VARANI, A. M.. Carnivoria em miniatura. 2018. (Programa de rádio ou. 2018.
58. VARANI, A. M.; MIRANDA, VITOR F. O. ; SILVA, S. R. ; TUNES, S.. Colonização pela água. 2018. (Programa de rádio ou. 2018.
59. COMUNICACOES, 4. T. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, A. M.. Estudo da origem de plantas carnívoras é destaque pela Fapesp.. 2018. (Programa de rádio ou. 2018.
60. COMUNICACOES, 4. T. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, A. M.. Aluna do IB apresenta 1º genoma mitocondrial em planta do Brasil. 2017. (Programa de rádio ou. 2017.
61. MOON, P. ; SILVA, S. R. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, A. M.. Planta carnívora tem genoma mitocondrial sequenciado.. 2017. (Programa de rádio ou. 2017.
62. MIRANDA, VITOR F. O. ; SILVA, S. R. ; VARANI, A. M.. Publicado primeiro genoma mitocondrial de planta brasileira.. 2017. (Programa de rádio ou. 2017.
Demais tipos de produção técnica (3)
1. VARANI, A. M.; Nakaya I.H. ; DARINI, A. L. C.. Bioinformática para Microbiologistas. 2014. Curso de curta duração ministrado/Extensão
2. VARANI, A. M.; MENEGHINE, A. K. ; LIMA, M. T. ; ALVES, L. M. C. ; SACCO, L. P.. Extração de DNA e testes Bioquímicos de bactérias. 2014. Curso de curta duração ministrado/Extensão
3. VARANI, A. M. Biologia Computacional Aplicada ao Estudo de Elementos Genéticos Móveis em Genomas de Procariotos. 2013. Curso de curta duração ministrado/Extensão

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (3)
1. Vitor Trinca. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2024.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
2. Anelise Stella Ballaben. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2024.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
3. Mauro de Medeiros de Oliveira. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo.. Início: 2023.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Tese de doutorado (3)
1. Julia Memrava Cabrera. Análise Metagenômica da Microbiota Intestinal em Aves Comerciais: Explorando Potencial Probiótico, Genes de Multiresistência e Transferência Genética Horizontal. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. Início: 2023.
  Orientador: Alessandro de Mello Varani.
2. Rafaely Pantoja Oliveira. GENÔMICA COMPARATIVA ENTRE Theobroma grandiflorum e Theobroma cacao, COM ENFOQUE EM GENES RELACIONADOS NAS QUALIDADES DOS FRUTOS. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2021.
  Orientador: Alessandro de Mello Varani.
3. Iago Rodrigues Blanco. ANÁLISE GENÔMICA IN SILICO DE BACTERIOCINAS DE TIPO PEDIOCINA POR Pediococcus pentosaceus. Tese (Doutorado em TECNOLOGIA BIOQUÍMICO-FARMACÊUTICA) - Universidade de São Paulo, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. (Coorientador).. Início: 2020.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Dissertação de mestrado (1)
1. João Victor dos Anjos Almeida. Mapeamento do Potencial Probiótico e para Degradação de Polissacarídeos Vegetais em Isolados da Microbiota de Animais de Produção. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
  Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (8)
1. Edisson Chavarro Mesa. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2023.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
2. Lucas José Luduverio Pizauro. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2021.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
3. Julie Anne Espindola Amorim. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
4. Saura Rodrigues Silva. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2018.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
5. Lucas José Luduverio Pizauro. . Universidade Estadual Paulista Julio De Mesquita F, . 2018.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
6. Rafael Marini Ferreira. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
7. Danillo Oliveira de Alvarenga. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2016.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
8. Rafael Marini Ferreira. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2014.
  Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Tese de doutorado (6)

Amanda Carolina Paulino de Oliveira. Estudo genômico, evolutivo e funcional de transglicosilases líticas de mureína em Xanthomonas. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Bruno Weiss. Metagenômica aplicada ao estudo do potencial metabólico de um consórcio bacteriano degradador de lignocelulose cultivado e enriquecido in vitro. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Saura Rodrigues da Silva. Sistemática de Utricularia L. (Lentibulariaceae): a abordagem de supermatrizes para resoluções filogenéticas. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2014.
Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Julie Anne Espindola Amorin. GENES DO METABOLISMO DO NITROGÊNIO E SUAS IMPLICAÇÕES NA PATOGENICIDADE E VIRULÊNCIA DA Xanthomonas citri subsp. citri. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2014.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Rafael Marini Ferreira. Estudo do gene mlt e mltB na patogenicidade de Xanthomonas citri. Tese (Doutorado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2014.
Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Aylan Kener Meneghine. Diversidade de microrganismos e prospecção gênica em águas residuais de áreas de mineração.. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2013.
Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Dissertação de mestrado (8)

Romário Alves Rodrigues. USO DE GENÔMICA COMPARATIVA E ENSAIOS FILOGENÉTICOS PARA ANÁLISE DE LINHAGENS DE Staphylococcus aureus EM BOVINOS E HUMANOS EM BUSCA DE PADRÕES DE VIRULÊNCIA ESPECÍFICOS E MARCADORES DA MASTITE. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2019.
Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Maria Heloisa Moreno Julião. Genomic identification of mate, ABC, and MFS transporters in Citrus sinensis and expression analysis of Citrus species interacting with Xanthomonas citri subsp. citri. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Jéssica Alcimari Ferreira Mello. O papel do sistema de dois componentes na regulação do sistema de secreção tipo III em Xanthomonas citri. Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
AMANDA CAROLINA PAULINO DE OLIVEIRA. Caracterização de transglicosilases líticas de mureína associadas ao elemento TnXax1 em Xanthomonas citri subsp. citri 306 sugerem relação com o fitness e atraso no desenvolvimento do cancro cítrico.. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Joana Gabriela Desiderato. Metagenômica e Bioinformática Aplicada à Bioernegia: Explorando um Consórcio Bacteriano Degradador da Biomassa. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2014.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Natália dos Santos Pinto. Prospecção in-silico de genes cry de Bacillus thuringiensis a partir de bibblioteca metagenômica proveniente de solo com cultivo de cana-de-açucar e solo de floresta. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2013.
Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Alessandra dos Santos Pinto. Estudo do Mobile Metagenome de solos cultivados com cana de açúcar. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2013.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Michelle Mendonça Pena. DNA "BARCODING" EM Utricularia (Lentibulariaceae). Dissertação (Mestrado em Agronomia (Genética e Melhoramento de Plantas)) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2013.
Supervisor: Alessandro de Mello Varani.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (4)

João Victor dos Anjos Almeida. .Caracterização Genômica e Potencial Antimicrobiano de Bacteriocinas em Ligilactobacillus salivarius: Uma Análise Pangenômica e Estrutural.. (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2023.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
LUAN AFFONSO MONTANDON POMPEU. ANÁLISE GENÔMICA COMPARATIVA DE TRANSPORTADORES ABC ENTRE CLONES DE Theobroma grandiflorum E Theobroma cacao. (Graduação em Agronomia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2023.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
DANYEL FERNANDES CONTILIANI. Estudo da expressão espacial e temporal de genes flagelares de Xanthomonas citri subsp. citri em diferentes genótipos de Citrus sp. através da abordagem de RNA-Seq. (Graduação em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2017.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Guilherme Malheiros Gião Filho. Genômica de Xanthomonadales. (Graduação em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2013.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Iniciação científica (7)

João Victor dos Anjos Almeida. Estudo de genômica comparativa de genes codificadores de bacteriocina em Ligilactobacillus salivarius. (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2022.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Luan Affonso Montandon Pompeu. ANÁLISE GENÔMICA COMPARATIVA DE TRANSPORTADORES ABC ENTRE CLONES DE Theobroma grandiflorum E Theobroma cacao. (Graduando em Agronomia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2022.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
DANYEL FERNANDES CONTILIANI. Estudo de genes relacionados ao flagelo de Xanthomonas citri através da análise por RNAseq. (Graduando em Abi - Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2016.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Iashilei Cassieli Pasquini. Produção e análise in planta de uma biblioteca de mutantes de Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii tipo C (XauC). (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Pesquisa (PROPe) - UNESP. 2015.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
ARIADNE COSTA SANCHES. Desvendando os mecanismos moleculares do agente etiológico do cancro cítrico: Investigação de genes relacionados a interação planta-patógeno entre Citrus aurantifolia (Lima Ácida Galego) e Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii Tipo C (XauC). (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2015.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
DANYEL FERNANDES CONTILIANI. Identificação de genes relacionados a patogenicidade e virulência em Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii Tipo C (XauC) através da análise in-vivo de mutantes em folhas de Citrus limonia Osbeck (Limoeiro-Cravo). (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2015.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Estêvão Henrique Cangussu de Souza. Bioinformatica Aplicada a Montagem do Genoma de Utricularia reniformis. (Graduando em Ciências Biológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Pró-Reitoria de Pesquisa (PROPe) - UNESP. 2014.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.
Orientações de outra natureza (1)

Francislon Silva de Oliveira. Desenvolvimento do Banco de Dados TnCentral v2.0. Orientação de outra natureza - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2023.
Orientador: Alessandro de Mello Varani.

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (10)

2021-Atual. O genoma das plantas sagradas utilizadas no preparo da Ayahuasca (Psychotria viridis e Banisteropsis caapi)
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Francisco Prosdocimi - Integrante / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante / Saura Rodrigues da Silva - Integrante / Ana Paula de Moraes - Integrante / Simone Silva dos Santos Lopes - Integrante / José Beethoven Figueiredo Barbosa - Integrante / Danilo Ribeiro de Oliveira - Integrante / Maria Alice Correa - Integrante. Financiador(es): FAPERJ - Bolsa.
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2020-Atual. Genoma e transcriptoma do Theobroma grandiflorum (cupuaçu): uma abordagem comparativa, evolutiva e funcional.
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (2) Doutorado: (1) . Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Jesus Ap. ferro - Integrante / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante / Saura Rodrigues da Silva - Integrante / Vinicius A. C. Abreu - Integrante / DOMINGUES, DOUGLAS S. - Integrante / Rafael Moyses - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Fundação Amazônia Paraense de Amparo à Pesquisa - Auxílio financeiro.
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2019-Atual. Bioprospecção de bactérias probióticas bacteriocinogênicas: da otimização do cultivo à aplicação em sistemas de produção animal
Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (3) / Mestrado acadêmico: (5) / Doutorado: (6) . Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / PINHEIRO DE SOUZA OLIVEIRA, RICARDO - Coordenador. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 1 / Número de orientações: 1
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2018-Atual. ISfinder_Tn - A Platform for Identification and Analysis of the Prokaryotic Mobilome
Descrição: TnCentral is a Web-resource for prokaryotic transposons, their passenger genes, and their host organisms. It provides a variety of Search functions, BLAST functions for TnCentral and other related databases and a summary page with detailed annotation and a descriptive graphic for each transposon. It also makes available stand-alone scripts for identifying different transposons in genomic sequence data.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Chandler, Michael - Coordenador / ALVARENGA, D. O. - Integrante / Karen Ross - Integrante / Cathy H. Wu - Integrante / Leslie Arminski - Integrante / Hongzhan Huang - Integrante / Jian Zhang - Integrante. Financiador(es): U.S. Department of Defense - Auxílio financeiro.
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2015-2017. Produção e análise in planta de uma biblioteca de mutantes de Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii tipo C (XauC)
Descrição: O citros é uma cultura de reconhecida importância sendo inexistentes variedades melhoradas resistentes às suas pragas, a qual se destaca o cancro cítrico. Uma das bactérias causadoras desta doença é a X. f. subsp. aurantifolii tipo C (XauC). Esta bactéria restringe a sua patogenicidade à Citrus aurantifolia, e apresenta uma reação de hipersensibilidade (HR) nos demais citros. Esta resposta é responsável pela contenção do patógeno no sítio inicial de infecção, conferindo, dessa maneira, resistência ao patógeno. Este tipo de resposta é determinado por pares de genes complementares denominados de gene de resistência (R), presente no hospedeiro, e de gene de avirulência (avr), presente no patógeno. Se o gene avr de XauC for identificado, seria possível descobrir, nos citros que resistem à doença, a proteína produto do gene R (gene de resistência). Esse conhecimento poderá levar ao desenvolvimento de um método efetivo de controle do cancro cítrico causado pela XauC.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Jesus Ap. ferro - Integrante / Helen Alves Penha - Integrante.
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2014-2022. Genômica e transcriptoma de Utricularia reniformis (Lentibulariaceae): uma abordagem funcional e evolutiva
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (1) / Doutorado: (1) . Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante / Michelle Mendonça Pena - Integrante / Saura Rodrigues da Silva - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2014-2020. Biodiversity of cyanobacteria and their bioactive compounds from under-explored Brazilian habitats
Descrição: Cyanobacteria are interesting ancient diverse organisms with a great future in biotechnology. They produce a large number of biomedically interesting bioactive compounds as well as have good prospects in bioenergy field. In this project, we will investigate molecular and cultivable cyanobacterial biodiversity from diverse habitats in Brazil. We will isolate strains to form a biobank and utilize cyanobacterial strains to screen and identify new bioactive compounds, their biosynthetic genes and enzymes. The Brazilian and Finnish teams have complementary expertise and will join forces to reveal cyanobacterial, bioactive compound and biosynthetic gene diversity in the state of São Paulo. The outcomes of the project will be taxonomically new cyanobacteria, information on the biodiversity of cyanobacteria from diverse environments, novel bioactive compounds for drug leads and cell reagents, new biosynthetic pathways and novel enzymes, database products of LC-MS fragmentation patters of the compounds, which can be used to exclude the known compounds and focus novelty in the future research. The biobank of cyanobacteria is a natural resource which could be utilized for the benefit of the country for years to come. One of the major ecosystem services provided by the cyanobacteria is the production of new bioactive compounds, drug leads for combatting serious human diseases. We will map the environments likely to yield to highest diversity of cyanobacteria and their metabolites for benefit of future targeted searches for novel natural products.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Marli de Fatima Fiori - Coordenador / Augusto Etchegaray - Integrante / David P. Fewer - Integrante / Jouni Jokela - Integrante / Kaarina Sivonen - Integrante / Ernani Pinto - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro / Academy of Finland - Auxílio financeiro.
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2014-2020. Estudos de patogenicidade e diversidade genômica e funcional de Xanthomonas citri
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (2) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Setubal, JoÃ£o C. - Coordenador / Jesus Aparecido Ferro - Integrante / Luciano Antonio Digiampietri - Integrante / José Belasque Junior - Integrante / Fabricio Jaciani - Integrante / Leandro Moreira - Integrante / Nalvo Almeida Jr - Integrante / Marcelo Laia - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Auxílio financeiro.
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2013-2022. Metagenômica e Bioinformática Aplicada à Bioernegia: Explorando um Consórcio Bacteriano Degradador da Biomassa
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (1) Doutorado: (2) . Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Coordenador / Lucia Maria Carareto Alves - Integrante / Milena Tavares de Lima - Integrante / Aylan Kener Meneghine - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Alessandro de Mello Varani.
2013-2016. ADUBO ORGÂNICO: INFLUÊNCIA AMBIENTAL E USO BIOTECNOLÓGICO
Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado profissional: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Alessandro de Mello Varani - Integrante / Lucia Maria Carareto Alves - Coordenador / Luciana Maria Saran - Integrante / Eliana G. M. Lemos - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Alessandro de Mello Varani.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

Total de participação em eventos (40)

20º Congresso Brasileiro de Bioinformática: X-Meeting 2024. Toward Complete Genome Assembly of the Hexaploid and Highly Heterozygous Entheogenic Plant Psychotria viridis Using PacBio HiFi and Hi-C Technologies. 2024. (Congresso).
69º CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA. Exploring the Organellar Genomes of the Entheogenic Plant Mimosa tenuiflora: Phylogenetic Analysis and Genomic Landscape. 2024. (Congresso).
Genotropics Workshop 2024 - Colaborações igualitárias para o futuro da Genômica da Biodiversidade.Geração de dados genômicos no exterior. 2024. (Encontro).
Workshop de Atualização sobre HLB. 2024. (Simpósio).
XXVIII International Symposium on Genetics and Plant Breeding.Sequenciamento Genômico de Plantas Utilizando as Últimas Tecnologias: PacBio HiFi, ONT e Hi-C. 2024. (Simpósio).
GCCRC FROM GENE TO TRAIT 2023 - GENOMICS FOR CLIMATE CHANGE RESEARCH CENTER.Genomics of the Brazilian Biodiversity: The Cupuaçu (Theobroma grandiflorum) and Ayahuasca (Psychotria viridis and Banisteriopsis caapi) genomes project Towards phased chromosome-scale and high-quality annotated genomes. 2023. (Encontro).
I Curso de inverno em Biociências e Biotecnologia.Transposons e seu impacto na multirresistência. 2023. (Outra).
I Escola de Verão em Microbiologia Agropecuária.Prospecção de novos compostos probióticos e genômica de bactérias bacteriocinogênicas. 2023. (Encontro).
II Natal Bioinformatics Forum.Genomics of the Brazilian Biodiversity: The Cupuaçu and Ayahuasca genome projects.. 2023. (Encontro).
X-Meeting / BSB 2023. Benchmarking and Improving Plant Genome Annotation Through an Combination of Bioinformatics Tools. 2023. (Congresso).
XVII Curso de Inverno em Genética.Organização. 2023. (Outra).
67th Brazilian Congress of Genetics. The chromosome-scale genome sequence of Theobroma grandiflorum for evolutionary, biotechnology, and horticulture research.. 2022. (Congresso).
Fórum de Internacionalização 2022 da Unesp. 2022. (Outra).
II Simpósio de Biologia Vegetal da Unicamp (II SBVU).O que aprendemos sequenciando dezenas de genomas de plantas carnívoras?. 2022. (Simpósio).
XVI Curso de Inverno em Genética - UNESP/FCAV.A importância da Genômica Comparativa. 2022. (Encontro).
1st Franco-Latinoamerican Workshop in Omics and Bioinformatics: Transposable Elements.TnCentral: a prokaryotic transposable element database and web portal for transposon analysis. 2021. (Simpósio).
66º Congresso Brasileiro de Genética. The Utricularia genomes are in a dynamic state of evolution. 2021. (Congresso).
IV Workshop Python para Dados Biológicos. 2021. (Seminário).
I Workshop on Genetics and Plant Breeding.PLANT GENOME SEQUENCING: NEW TECHNOLOGIES AND CHALLENGES (How to build a near complete plant genome?). 2021. (Simpósio).
VI Curso de Verão em Bioinformática.Montagem de Sequências Genômicas e Metagenômicas. 2019. (Outra).
"III Curso de Verão em Bioinformática".Montagem de Sequências Genômicas e Metagenômicas. 2018. (Outra).
2nd São Paulo XanthoMeeting 2018.The role of the murein lytic transglycosylases in Xanthomonas citri subsp. citri 306 virulence and fitness. 2018. (Encontro).
II Seminário sobre Métodos Analíticos Avançados em Microbiologia.Utilizando ferramentas genômicas e de bioinformática para a investigação da emergência da virulência em fitopatógenos. 2018. (Seminário).
III Simpósio de Microbiologia Agrícola.22 anos de sequenciamento genômico. Qual o futuro da genômica ?. 2017. (Simpósio).
1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. Relação entre bacteriófagos, transposons e plasmídeos com evolução genômica, emergência de virulência e patogenicidade em fitopatógenos de interesse agronômico?. 2016. (Congresso).
1st International Workshop on Cyanobacterial Natural Products. Assembling and annotating Cyanobacterial genomes: Tips and tricks. 2016. (Congresso).
62 Brazilian-International Congress of Genetics. UNRAVELING THE GENOME SEQUENCE OF THE UTRICULARIA RENIFORMIS A.ST.-HIL. (LENTIBULARIACEAE): INSIGHTS INTO THE EVOLUTION OF A TERRESTRIAL CARNIVOROUS PLANT.. 2016. (Congresso).
VIII Simpósio de Microbiologia.Bioinformática. 2016. (Simpósio).
XII Curso de Inverno de Genética.Montagem e Anotação de Genomas. 2016. (Encontro).
11th International Plant Molecular Biology Congress. The complete chloroplast genome of a brazilian carnivorous plant Utricularia reniformis (Lentibulariaceae). 2015. (Congresso).
Workshop de Bioernergia - UNESP. 2015. (Seminário).
Xanthomeeting.Mobile Genetics elements impact in Xanthomonas genomes. 2015. (Encontro).
X-Meeting 2015 - 11th International Conference of th AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics. The complete mitochondrial genome of a brazilian carnivorous plant Utricularia reniformis (Lentibulariaceae): Insights into the evolution of an organellar genome of a specialized plant.. 2015. (Congresso).
10 Edição do Fórum de Microbiologia Agropecuária.Genômica aplicada ao estudo de transpsons e vírus de bactérias de interesse agronômico. 2014. (Outra).
60º Congresso Nacional de Genética. Identification and Characterization of ISXax2, a Tn3-like transposable element potentially related with the virulence and pathogenicity of Xanthomonas citri subsp. citri. 2014. (Congresso).
Workshop Meta-Omics and Bioinformatics in Microbial Ecology.Exploring the bacteriual transposases diversity from metagenomic data with ISsaga. 2014. (Simpósio).
XIV Congresso Brasileiro de Biomedicina e II Congresso Internacional de Biomedicina. Bioinformática para Microbiologistas. 2014. (Congresso).
2nd Thünen Symposium on Soil Metagenomics.Exploring the prokaryotic insertion sequence abundance and diversity of brazilian sugar-cane cultivated soils. 2013. (Simpósio).
IX Curso de Inverno de Genética.Aplicações da Bioinformática na microbiologia. 2013. (Encontro).
V Simpósio de Microbiologia IBILCE/UNESP.Aplicações da Bioinformática na microbiologia. 2013. (Simpósio).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (11)

Varani, A.M.; RODRIGUES, J. D. B.. XVII Curso de Inverno de Genética. 2023. Outro
Varani, A.M.; PINHEIRO, A. L. M. ; BATISTA, U. S. ; BIZARRIA JUNIOR, R. ; SANTOS, R. A. C. ; FERRAZ, R. S. ; MARTINS, P. M. ; GRAF-GRACHET, N. ; FARIA, L. Z. ; MALAQUIAS, J. B. ; FERREIRA, J. G. R. N. ; FRAJACOMO, H. C. ; CRESTANA, G. S. ; MARAGARIDO, G. A. ; WINCK, F. V. ; CORRER, F. H. ; THOMAZ, A. T.. IV WORKSHOP DE PYTHON PARA DADOS BIOLÓGICOS. 2021. Outro
PINHEIRO, D. G. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, A. M.. "III Curso de Verão em Bioinformática". 2018. Outro
PINHEIRO, D. G. ; MIRANDA, V. F. O. ; Varani, A.M.. I Curso de Verão em Bioinformática (Metagenômica: conceitos e aplicações). 2016. Outro
OLIVEIRA, R. A. ; FERRO, M. I. T. ; PENHA, H. A. ; MONTASSIER, H. J. ; SOUZA, J. A. M. ; VANTINI, J. S. ; CARDOZO, M. V. ; PENA, M. M. ; BORZI, M. M. ; COZENTINO, N. C. B. ; DUDA, R. M. ; CASTELLANE, T. C. L. ; MARIGUELA, V. C. ; CARVALHO, F. M. S. ; MOCHI, D. A. ; PINHEIRO, D. G. ; DAQUILA, E. M. T. ; GIMENEZ, D. J. ; PAVANI, C. D. ; VARANI, A. M. ; et.al. 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. 2016. Congresso
FERRO, J. A. ; TEZZA, R. I. D. ; FACINCANI, A. P. ; VARANI, A. M. ; BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T.. Seminários CREBIO 5° Ciclo. 2016. Outro
FERRO, J. A. ; TEZZA, R. D. ; FACINCANI, A. P. ; VARANI, A. M. ; BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T.. Seminários CREBIO 6° Ciclo. 2016. Outro
Varani, A.M.; BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T. ; TEZZA, R. D. ; FERRO, J. A.. Seminários CREBIO ? 3° Ciclo. 2015. Outro
Varani, A.M.; FERRO, J. A. ; BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T. ; TEZZA, R. I. D. ; FACINCANI, A. P.. Seminários CREBIO ? 4° Ciclo. 2015. Outro
VARANI, A. M.; OLIVEIRA, M. T. ; BALBUENA, T. S. ; TEZZA, R. I. D.. Seminários CREBIO ? 1° Ciclo. 2014. Outro
BALBUENA, T. S. ; OLIVEIRA, M. T. ; VARANI, A. M. ; TEZZA, R. I. D.. Seminários CREBIO ? 2° Ciclo. 2014. Outro

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (14)

Alessandro de Mello Varani ⇔ Jesus Aparecido Ferro (20.0)
DE ABREU, VINICIUS A.C. ; MOYSÉS ALVES, RAFAEL ; SILVA, SAURA R. ; Ferro, Jesus A. ; DOMINGUES, DOUGLAS S. ; MIRANDA, VITOR F.O. ; VARANI, ALESSANDRO M.. Comparative analyses of Theobroma cacao and T. grandiflorum mitogenomes reveal conserved gene content embedded within complex and plastic structures. GENE. v. 849, p. 146904, issn: 0378-1119, 2023. Qualis: A4
DE OLIVEIRA, AMANDA C. P. ; FERREIRA, RAFAEL M. ; FERRO, MARIA INÊS T. ; FERRO, JESUS A. ; ZAMUNER, CAIO ; FERREIRA, HENRIQUE ; Varani, Alessandro M.. XAC4296 Is a Multifunctional and Exclusive Xanthomonadaceae Gene Containing a Fusion of Lytic Transglycosylase and Epimerase Domains. Microorganisms. v. 10, p. 1008, issn: 2076-2607, 2022. Qualis: B1
BUENO, DANILO ; PEDROLLI, DANIELLE B. ; MARTINS, PAULA M. M. ; BOCCHINI, DANIELA A. ; MORAES, KAREN C. M. ; FACINCANI, AGDA P. ; FERRO, JESUS A. ; Varani, Alessandro M. ; PENA, MICHELLE M. ; FERREIRA, HENRIQUE. Riboswitch theo/metE as a Transcription Regulation Tool for Xanthomonas citri subsp. citri. Microorganisms. v. 9, p. 329, issn: 2076-2607, 2021. Qualis: B1
JULIÃO, MARIA H. M. ; SILVA, SAURA R. ; FERRO, JESUS A. ; Varani, Alessandro M.. A Genomic and Transcriptomic Overview of MATE, ABC, and MFS Transporters in Citrus sinensis Interaction with Xanthomonas citri subsp. citri. PLANTS. v. 9, p. 794, issn: 2223-7747, 2020. Qualis: A2
FELESTRINO, ÉRICA BARBOSA ; SANCHEZ, ANGÉLICA BIANCHINI ; CANESCHI, WASHINGTON LUIZ ; LEMES, CAMILA GRACYELLE DE CARVALHO ; ASSIS, RENATA DE ALMEIDA BARBOSA ; CORDEIRO, ISABELLA FERREIRA ; FONSECA, NATASHA PEIXOTO ; VILLA, MORGHANA MARINA ; VIEIRA, IZADORA TABUSO ; KAMINO, LUCIANA HIROMI YOSHINO ; DO CARMO, FLÁVIO FONSECA ; DA SILVA, ALINE MARIA ; THOMAS, ANDREW MALTEZ ; PATANÉ, JOSÉ SALVATORE LEISTER ; FERREIRA, FERNANDA CARLA ; DE FREITAS, LEANDRO GRASSI ; Varani, Alessandro de Mello ; FERRO, JESUS APARECIDO ; SILVA, ROBSON SOARES ; ALMEIDA, NALVO FRANCO ; et.al. Complete genome sequence and analysis of Alcaligenes faecalis strain Mc250, a new potential plant bioinoculant. PLoS One. v. 15, p. e0241546, issn: 1932-6203, 2020. Qualis: A1
PATANÉ, JOSÉ S. L. ; MARTINS, JOAQUIM ; RANGEL, LUIZ THIBERIO ; BELASQUE, JOSÉ ; DIGIAMPIETRI, LUCIANO A. ; FACINCANI, Agda Paula ; FERREIRA, Rafael Marini ; JACIANI, FABRÍCIO JOSÉ ; ZHANG, YUNZENG ; VARANI, ALESSANDRO M. ; ALMEIDA, NALVO F. ; WANG, NIAN ; Ferro, Jesus A. ; MOREIRA, LEANDRO M. ; SETUBAL, JOÃO C.. Origin and diversification of Xanthomonas citri subsp. citri pathotypes revealed by inclusive phylogenomic, dating, and biogeographic analyses. BMC GENOMICS. v. 20, p. 20:700, issn: 1471-2164, 2019. Qualis: A2
FONSECA, NATASHA P. ; FELESTRINO, ÉRICA B. ; CANESCHI, WASHINGTON L. ; SANCHEZ, ANGÉLICA B. ; CORDEIRO, ISABELLA F. ; LEMES, CAMILA G.C. ; ASSIS, RENATA A.B. ; CARVALHO, FLÁVIA M.S. ; FERRO, JESUS A. ; Varani, Alessandro M. ; BELASQUE, JOSÉ ; SETUBAL, JOAO C. ; TELLES, GUILHERME P. ; AGUENA, DEIVISTON S. ; ALMEIDA, NALVO F. ; MOREIRA, LEANDRO M.. Detection and identification of Xanthomonas pathotypes associated with citrus diseases using comparative genomics and multiplex PCR. PeerJ. v. 7, p. e7676, issn: 2167-8359, 2019. Qualis: A2
FONSECA, NATASHA PEIXOTO ; PATANÉ, JOSÉ S. L. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; FELESTRINO, ÉRICA BARBOSA ; CANESCHI, WASHINGTON LUIZ ; SANCHEZ, ANGÉLICA BIANCHINI ; CORDEIRO, ISABELLA FERREIRA ; LEMES, CAMILA GRACYELLE DE CARVALHO ; ASSIS, RENATA DE ALMEIDA BARBOSA ; GARCIA, CAMILA CARRIÃO MACHADO ; BELASQUE JR., JOSÉ ; MARTINS JR., JOAQUIM ; FACINCANI, Agda Paula ; FERREIRA, Rafael Marini ; JACIANI, FABRÍCIO JOSÉ ; ALMEIDA, NALVO FRANCO DE ; Ferro, Jesus Aparecido ; MOREIRA, LEANDRO MARCIO ; SETUBAL, JOÃO C.. Analyses of Seven New Genomes of Xanthomonas citri pv. aurantifolii Strains, Causative Agents of Citrus Canker B and C, Show a Reduced Repertoire of Pathogenicity-Related Genes. Frontiers in Microbiology. v. 10, p. 2361, issn: 1664-302X, 2019. Qualis: A1
CANESCHI, WASHINGTON LUIZ ; SANCHEZ, ANGÉLICA BIANCHINI ; FELESTRINO, ÉRICA BARBOSA ; LEMES, CAMILA GRACYELLE DE CARVALHO ; CORDEIRO, ISABELLA FERREIRA ; FONSECA, NATASHA PEIXOTO ; VILLA, MORGHANA MARINA ; VIEIRA, IZADORA TABUSO ; MORAES, LAURO ÂNGELO GONÇALVES ; ASSIS, RENATA DE ALMEIDA BARBOSA ; DO CARMO, FLÁVIO FONSECA ; KAMINO, LUCIANA HIROMI YOSHINO ; SILVA, ROBSON SOARES ; FERRO, JESUS APARECIDO ; Ferro, Maria Inês Tiraboschi ; FERREIRA, Rafael Marini ; SANTOS, VERA LÚCIA ; SILVA, UBIANA DE CÁSSIA MOURÃO ; ALMEIDA, NALVO FRANCO ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; et.al. Serratia liquefaciens FG3 isolated from a metallophyte plant sheds light on the evolution and mechanisms of adaptive traits in extreme environments. Scientific Reports. v. 9, p. 18006, issn: 2045-2322, 2019. Qualis: A2
OLIVEIRA, AMANDA C.P. ; FERREIRA, RAFAEL M. ; FERRO, MARIA INÊS T. ; Ferro, Jesus A. ; CHANDLER, MICK ; VARANI, ALESSANDRO M.. Transposons and pathogenicity in Xanthomonas : acquisition of murein lytic transglycosylases by Tn Xax1 enhances Xanthomonas citri subsp. citri 306 virulence and fitness. PeerJ. v. 6, p. e6111, issn: 2167-8359, 2018. Qualis: A2
FERREIRA, Rafael Marini ; DE OLIVEIRA, AMANDA CAROLINA P. ; MOREIRA, LEANDRO M. ; BELASQUE, JOSÉ ; GOURBEYRE, EDITH ; SIGUIER, PATRICIA ; Ferro, Maria Inês T. ; Ferro, Jesus A. ; CHANDLER, MICHAEL ; VARANI, ALESSANDRO M.. A TALE of Transposition: Tn -Like Transposons Play a Major Role in the Spread of Pathogenicity Determinants of Xanthomonas citri and Other Xanthomonads. mBio (Online). v. 6, p. e02505-14, issn: 2150-7511, 2015. Qualis: A1
AMORIM, J. A. E. ; CALVACA, L.B. ; FERRO, J. A. ; FERREIRA, H. ; MENDOZA, E. F. R. ; CARVALHO, F. M. S. ; VARANI, A. M.. The ntrB and ntrC genes are implicated in the Citrus Canker development in Xanthomonas citri subsp. citri 306. Em: 47 th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology, 2018, Joinville. 47 th Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology. SBBq: SBBq, v. 1, p. 225-225, 2018.
CONTILIANI, D. F. ; PENHA, HELEN A. ; FERRO, J. A. ; VARANI, A. M.. Spatial and temporal expression of flagellar genes of Xanthomonas citri subsp. citri in different genotypes of Citrus sp. revealed by RNAseq approach. Em: GENÉTICA 2017 - Brazilian-International Congress of Genetics, 2017, Águas de Lindóia. GENÉTICA 2017 - Brazilian-International Congress of Genetics. Águas de Lindóia: SBG, p. 38467, 2017.
PASQUINI, I. C. ; MELLO, J. A. F. ; SOUZA, E. H. C. ; FERRO, J. A. ; VARANI, A. M. ; PENHA, HELEN A.. Identification of Citrus-Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii pathosystem genes. Em: GENÉTICA 2017 - Brazilian-International Congress of Genetics, 2017, Águas de Lindóia. GENÉTICA 2017 - Brazilian-International Congress of Genetics, p. 38672, 2017.
SANCHES, A. C. ; MELLO, J. A. F. ; PASQUINI, I. C. ; SOUZA, E. H. C. ; CONTILIANI, D. F. ; Varani, A.M. ; PENHA, H. A. ; FERRO, JESUS A.. Identificação e análise in silico de genes de Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii tipo C implicados na patogênese. Em: 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, 2016, Jaboticabal. 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. Jaboticabal: Revista Ciência & Tecnologia, v. 8, 2016.
DE OLIVEIRA, AMANDA CAROLINA P. ; FERREIRA, Rafael Marini ; Ferro, J. A. ; VARANI, A. ; FERRO, M.I.T.. Papel das proteínas de rearranjo de membranas (Transglicosilases) na virulência da bactéria causadora do cancro cítrico. Em: 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, 2016, Jaboticabal. 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. Jaboticabal: revista Ciência & Tecnologia, v. 8, 2016.
AMORIM, J. A. E. ; MENDOZA, E. F. R. ; FERRO, JESUS A. ; Varani, A.M.. DESVENDANDO O TRANSPORTE DO FERRO EM Xanthomonas citri subsp. citri PELO ESTUDO DO TRANSCRIPTOMA. Em: 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, 2016, Jaboticabal. 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. Jaboticabal: Revista Ciência & Tecnologia, v. 8, 2016.
PENHA, H. A. ; PASQUINI, I. C. ; MELLO, J. A. F. ; SOUZA, E. H. C. ; CONTILIANI, D. F. ; VARANI, A. M. ; FERRO, J. A.. Identification of virulence candidates in Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii type C by a mutant library approach. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.
COFRE, T. ; MURATA, M. ; CAVALLINI, J. ; HERAI, R. ; FERRAZA, A. ; TEZZA, R. I. D. ; VARANI, A. ; FERNANDES, C C ; Maria Inês T. Ferro ; BELASQUE JR., JOSE ; Ferro, Jesus A. ; FERREIRA, H.. Sweet Orange Valência Transcriptional Profiling (RNA-Seq) after infection by Xanthomonas citri subsp. Citri. Em: XLII Reunião Anual da SBBq, 2013, Foz do Iguaçu. XLII Reunião Anual da SBBq, 2013.
MURATA, M. ; CAVALLINI, J. ; COFRE, T. ; HERAI, R. ; FERRASA, A. ; TEZZA, R. I. D. ; VARANI, A. ; FERNANDES, C C ; BELASQUE JR., JOSE ; LEITE JR, R. P. ; Maria Inês T. Ferro ; Ferro, Jesus A.. Transcriptional Profiling of Canker-Resistant Satsuma Mandarin (Citrus unshiu) by RNA-Seq. Em: XLII Reunião Anual da SBBq, 2013, Foz do Iguaçu. XLII Reunião Anual da SBBq, 2013.

Alessandro de Mello Varani ⇔ Daniel Guariz Pinheiro (11.0)
CASTELLANE, TEREZA CRISTINA L. ; FERNANDES, CAMILA C. ; Pinheiro, Daniel G. ; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO ; VARANI, ALESSANDRO M.. Exploratory comparative transcriptomic analysis reveals potential gene targets associated with Cry1A.105 and Cry2Ab2 resistance in fall armyworm (Spodoptera frugiperda). FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS. v. 24, p. 129, issn: 1438-793X, 2024. Qualis: A2
SILVA, SAURA R. ; F. O. MIRANDA, VITOR ; MICHAEL, TODD P. ; P'ACHNO, BARTOSZ J. ; MATOS, RAMON G. ; ADAMEC, LUBOMIR ; L. K. POND, SERGEI ; LUCACI, ALEXANDER G. ; PINHEIRO, DANIEL G. ; Varani, Alessandro M.. The phylogenomics and evolutionary dynamics of the organellar genomes in carnivorous Utricularia and Genlisea species (Lentibulariaceae). MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION. v. 181, p. 107711, issn: 1055-7903, 2023. Qualis: A1
SILVA, SAURA R. ; Pinheiro, Daniel G. ; PENHA, HELEN A. ; P'ACHNO, BARTOSZ J. ; MICHAEL, TODD P. ; MEER, ELLIOTT J. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, ALESSANDRO M.. Intraspecific Variation within the Utricularia amethystina Species Morphotypes Based on Chloroplast Genomes. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 20, p. 6130, issn: 1422-0067, 2019. Qualis: A2
SILVA, SAURA R. ; MICHAEL, TODD P. ; MEER, ELLIOTT J. ; Pinheiro, Daniel G. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; MIRANDA, VITOR F. O.. Comparative genomic analysis of Genlisea (corkscrew plants-Lentibulariaceae) chloroplast genomes reveals an increasing loss of the ndh genes. PLoS One. v. 13, p. e0190321, issn: 1932-6203, 2018. Qualis: A1
SILVA, SAURA R. ; ALVARENGA, DANILLO O. ; ARANGUREN, YANI ; PENHA, HELEN A. ; FERNANDES, CAMILA C. ; Pinheiro, Daniel G. ; OLIVEIRA, MARCOS T. ; MICHAEL, TODD P. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, ALESSANDRO M.. The mitochondrial genome of the terrestrial carnivorous plant Utricularia reniformis (Lentibulariaceae): Structure, comparative analysis and evolutionary landmarks. PLoS One. v. 12, p. e0180484, issn: 1932-6203, 2017. Qualis: A1
SILVA, SAURA R. ; DIAZ, YANI C. A. ; PENHA, HELEN ALVES ; Pinheiro, Daniel G. ; FERNANDES, CAMILA C. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; MICHAEL, TODD P. ; VARANI, ALESSANDRO M.. The Chloroplast Genome of Utricularia reniformis Sheds Light on the Evolution of the ndh Gene Complex of Terrestrial Carnivorous Plants from the Lentibulariaceae Family. Plos One. v. 11, p. e0165176, issn: 1932-6203, 2016. Qualis: A1
SILVA, SAURA R. ; Pinheiro, Daniel G. ; MEER, ELLIOTT J. ; MICHAEL, TODD P. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; MIRANDA, VITOR F. O.. The complete chloroplast genome sequence of the leafy bladderwort, Utricularia foliosa L. (Lentibulariaceae). Conservation Genetics Resources (Online). v. ?, p. 1-4, issn: 1877-7260, 2016. Qualis: B2
SILVA, S. R. ; ARANGUREN, Y. ; Varani, Alessandro M. ; JAN P'ACHNO, BARTOSZ ; PINHEIRO, D. G. ; SIERRA, E. M. ; MATOS, R. G. ; MICHAEL, T. P. ; MIRANDA, V. F. O.. Phylogenomics of Utricularia (sect. Utricularia: Lentibulariaceae): a possible tale of reticulation of a complex carnivorous plant group. Em: 67th Brazilian Congress of Genetics, 2022, Natal/RN. 67th Brazilian Congress of Genetics, 2022.
SILVA, SAURA R. ; MIRANDA, V. F. O. ; PINHEIRO, D. G. ; MICHAEL, TODD P. ; M. VARANI, ALESSANDRO. Evolution of expansin gene family in carnivorous plants Genlisea and Utricularia. Em: 66º Congresso Brasileiro de Genética, 2021, Online. 66º Congresso Brasileiro de Genética, v. 1, p. 481, 2021.
SILVA, S. R. ; ARANGUREN, Y. ; PENHA, H. A. ; PINHEIRO, D. G. ; FERNANDES, CAMILA C. ; MORAES, A. P. ; DE MIRANDA, VITOR FERNANDES O. ; MICHAEL, T. P. ; VARANI, A. M.. Unraveling the genome sequence of the Utricularia reniformis a.st.-hil. (Lentibulariaceae): insights into the evolution of a terrestrial carnivorous plant. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.
Pinheiro, D.G. ; SILVA, S. R. ; MENEZES, C. G. ; PENHA, H. A. ; de Souza, Jackson Antônio Marcondes ; DESIDERIO, J. A. ; CARVALHO, R. F. ; VARANI, A. M. ; MIRANDA, V. F. O.. De novo transcriptome assembly and gene expression for anthocyanin pathway in Utricularia flower variants. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.

Alessandro de Mello Varani ⇔ Lúcia Maria Carareto Alves (9.0)
WEISS, BRUNO ; SOUZA, ANNA CAROLINA OLIVEIRA ; CONSTANCIO, MILENA TAVARES LIMA ; ALVARENGA, DANILLO OLIVEIRA ; PYLRO, VICTOR S. ; ALVES, LUCIA M. CARARETO ; Varani, Alessandro M.. Unraveling a Lignocellulose-Decomposing Bacterial Consortium from Soil Associated with Dry Sugarcane Straw by Genomic-Centered Metagenomics. Microorganisms. v. 9, p. 995, issn: 2076-2607, 2021. Qualis: B1
CONSTANCIO, MILENA TAVARES LIMA ; SACCO, LAÍS POSTAI ; CAMPANHARO, João Carlos ; CASTELLANE, TEREZA CRISTINA LUQUE ; DE OLIVEIRA SOUZA, ANNA CAROLINA ; WEISS, BRUNO ; de Mello Varani, Alessandro ; Alves, Lúcia Maria Carareto. Exploring the Potential of Two Bacterial Consortia to Degrade Cellulosic Biomass for Biotechnological Applications. CURRENT MICROBIOLOGY. v. 77, p. 3114-3124, issn: 0343-8651, 2020. Qualis: B1
DESIDERATO, JOANA G. ; ALVARENGA, DANILLO O. ; CONSTANCIO, MILENA T.L. ; ALVES, LUCIA M.C. ; VARANI, ALESSANDRO M.. The genome sequence of Dyella jiangningensis FCAV SCS01 from a lignocellulose-decomposing microbial consortium metagenome reveals potential for biotechnological applications. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION). v. 41, p. 507-513, issn: 1678-4685, 2018. Qualis: A4
MENEGHINE, AYLAN K. ; NIELSEN, SHAUN ; Varani, Alessandro M. ; THOMAS, TORSTEN ; CARARETO ALVES, LUCIA MARIA. Metagenomic analysis of soil and freshwater from zoo agricultural area with organic fertilization. PLoS One. v. 12, p. e0190178, issn: 1932-6203, 2017. Qualis: A1
Marcondes de Souza, Jackson Antônio ; Carrareto Alves, Lucia Maria ; de Mello Varani, Alessandro ; de Macedo Lemos, Eliana Gertrudes. The Family Bradyrhizobiaceae. The Prokaryotes. 4ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2014.p. 135-154.
Carrareto Alves, Lucia Maria ; de Souza, Jackson Antônio Marcondes ; Varani, Alessandro de Mello ; Lemos, Eliana Gertrudes de Macedo. The Family Rhizobiaceae. The Prokaryotes. 4ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2014.p. 419-437.
CANCELADO, S. V. ; CEPEDA, J. C. C. ; FERNANDEZ, C. C. ; VARANI, A. M. ; ALVES, L. M. CARARETO. Microbiological quality assessment of a compost produced from animal waste and vegetables. Em: SUSTAINABLE CITY 2014, v. 191, p. 1469-1479, 2014. Qualis: Não identificado (SUSTAINABLE CITY 2014)
Carareto Alves, Lúcia M. ; TOLEDO, B. F. B. DE ; Varani, Alessandro de Mello ; FERNANDES, C. C. ; KISHI, L. T. ; Lemos EGM. Unravelling the functional bacterial diversity from different soils supplemented with organic fertilizer from a Brazilian Zoo Park. Em: 13th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology (BAGECO), 2015, Milan (Italy). 13th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology (BAGECO). Milan (Italy), v. Psoil, p. 145-145, 2015.
FIGUEIREDO, B. P. ; VARANI, A. M. ; FERNANDES, C. C. ; LEMOS, E.G.M. ; CARARETO ALVES, L. M.. Influência Do Uso De Composto Orgânico Na Diversidade Bacteriana Do Solo De Uma Fazenda Da Fundação Parque Zoológico De São Paulo. Em: XIV Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental - ENAMA, 2014, João Pessoa, PB. XIV Encontro Nacional de Microbiologia Ambiental - ENAMA. João Pessoa, PB, v. 1, p. R0166-1, 2014.

Alessandro de Mello Varani ⇔ Eliana Gertrudes de Macedo Lemos (6.0)
SILVA, EDVALDO APARECIDO AMARAL DA ; ACENCIO, MARCIO LUIS ; BOVOLENTA, LUIZ AUGUSTO ; LEMKE, NEY ; Varani, Alessandro de Mello ; BRAVO, JULIANA PEREIRA ; HOSHINO-BEZERRA, ANDREA AKEMI ; LEMOS, ELIANA GERTRUDES MACEDO. Gene expression during the germination of coffee seed. Journal of Seed Sciences (antiga Revista Brasileira de Sementes). v. 41, p. 168-179, issn: 2317-1545, 2019. Qualis: B1
Fernandes, Camila C. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; LEMOS, ELIANA G.M. ; DE MIRANDA, VITOR FERNANDES O. ; SILVA, KETHERSON R. ; FERNANDO, FILIPE S. ; MONTASSIER, MARIA F.S. ; Montassier, Helio J.. Molecular and phylogenetic characterization based on the complete genome of a virulent pathotype of Newcastle disease virus isolated in the 1970s in Brazil. Infection, Genetics and Evolution (Print). v. 26, p. 160-167, issn: 1567-1348, 2014. Qualis: A2
VARANI, A. M. ; LEMOS, M. V. F. ; FERNANDES, C. C. ; LEMOS, E. G. M. ; ALVES, E. C. C. ; DESIDERIO, J. A.. Draft Genome Sequence of Bacillus thuringiensis var. thuringiensis Strain T01-328, a Brazilian Isolate That Produces a Soluble Pesticide Protein, Cry1Ia. Genome Announcements. v. 1, p. e00817-13-e00817-13, issn: 2169-8287, 2013. Qualis: B3
Marcondes de Souza, Jackson Antônio ; Carrareto Alves, Lucia Maria ; de Mello Varani, Alessandro ; de Macedo Lemos, Eliana Gertrudes. The Family Bradyrhizobiaceae. The Prokaryotes. 4ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2014.p. 135-154.
Carrareto Alves, Lucia Maria ; de Souza, Jackson Antônio Marcondes ; Varani, Alessandro de Mello ; Lemos, Eliana Gertrudes de Macedo. The Family Rhizobiaceae. The Prokaryotes. 4ed. Em: . : Springer Berlin Heidelberg. 2014.p. 419-437.
Carareto Alves, Lúcia M. ; TOLEDO, B. F. B. DE ; Varani, Alessandro de Mello ; FERNANDES, C. C. ; KISHI, L. T. ; Lemos EGM. Unravelling the functional bacterial diversity from different soils supplemented with organic fertilizer from a Brazilian Zoo Park. Em: 13th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology (BAGECO), 2015, Milan (Italy). 13th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology (BAGECO). Milan (Italy), v. Psoil, p. 145-145, 2015.

Alessandro de Mello Varani ⇔ Marcos Rogério André (6.0)
DO AMARAL, RENAN BRESSIANINI ; CARDOZO, MARITA VEDOVELLI ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; FURQUIM, MARIA EDUARDA CHIARADIA ; DIAS, CLARA MORATO ; SANTANA, MATHEUS DE SOUZA ; DE ASSIS, WILLIAM OLIVEIRA ; DA SILVA, ALANDERSON RODRIGUES ; HERRERA, HEITOR MIRAGLIA ; André, Marcos Rogério. Bartonella machadoae sp. nov. isolated from wild rodents in the Pantanal wetland. ACTA TROPICA. v. 229, p. 106368, issn: 0001-706X, 2022. Qualis: A1
DO AMARAL, RENAN BRESSIANINI ; CARDOZO, MARITA VEDOVELLI ; Varani, Alessandro de Mello ; FURQUIM, MARIA EDUARDA CHIARADIA ; DIAS, CLARA MORATO ; ASSIS, WILLIAM OLIVEIRA DE ; DA SILVA, ALANDERSON RODRIGUES ; HERRERA, HEITOR MIRAGLIA ; MACHADO, ROSANGELA ZACARIAS ; ANDRÉ, MARCOS ROGÉRIO. First Report of Bartonella spp. in Marsupials from Brazil, with a Description of Bartonella harrusi sp. nov. and a New Proposal for the Taxonomic Reclassification of Species of the Genus Bartonella. Microorganisms. v. 10, p. 1609, issn: 2076-2607, 2022. Qualis: B1
BOUER, ANDRÉA ; ANDRÉ, Marcos Rogério ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; LUZZI, MAYARA DE CÁSSIA ; OLIVEIRA, JULIANA PAULA DE ; RODRIGUES, ADRIANA CARLOS ; VARANI, ALESSANDRO DE MELO ; MIRANDA, VITOR FERNANDES OLIVEIRA DE ; PERLES, LÍVIA ; WERTHER, Karin ; Machado, Rosangela Zacarias. Hepatozoon caimani in Caiman crocodilus yacare (Crocodylia, Alligatoridae) from North Pantanal, Brazil. REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINARIA. v. 26, p. 352-358, issn: 1984-2961, 2017. Qualis: A2 (REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA)
SILVA, JENEVALDO BARBOSA ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; ANDRÉ, Marcos Rogério ; Machado, Rosangela Zacarias. Genetic diversity and molecular phylogeny of Anaplasma marginale studied longitudinally under natural transmission conditions in Rio de Janeiro, Brazil. Ticks and Tick-borne Diseases. v. 6, p. 499-507, issn: 1877-959X, 2015. Qualis: A1
MACHADO, R. Z.; TEIXEIRA, MARTA MG ; FUSATO, A. C. R. ; BARBOSA DA SILVA, JENEVALDO ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; André, Marcos R. ; VARANI, A. M.. Molecular detection of tick-borne agents in Affrican buffalos (Syncerus catffer) in Marromeu National Park, Mozambique. Em: 12th Biennial Conference of the Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM) and the VIII International Conference on Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8), 2014, Cape Town. Joint 8th International Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8) and 12th Biennial Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM) Conference. Cape Town, v. 1, p. 68-68, 2014.
BARBOSA DA SILVA, JENEVALDO ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; André, Marcos R. ; VARANI, A. M. ; Machado, R.Z.. Genetic diversity and multiple infections with Anaplasma marginale in naturally infected cattle in Rio de Janeiro state, Brazil. Em: 12th Biennial Conference of the Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM) and the VIII International Conference on Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8), 2014, Cape Town. Joint 8th International Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8) and 12th Biennial Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM) Conference. Cape Town, v. 1, p. 93-93, 2014.

Alessandro de Mello Varani ⇔ Maria Ines Tiraboschi Ferro (6.0)
CANESCHI, WASHINGTON LUIZ ; SANCHEZ, ANGÉLICA BIANCHINI ; FELESTRINO, ÉRICA BARBOSA ; LEMES, CAMILA GRACYELLE DE CARVALHO ; CORDEIRO, ISABELLA FERREIRA ; FONSECA, NATASHA PEIXOTO ; VILLA, MORGHANA MARINA ; VIEIRA, IZADORA TABUSO ; MORAES, LAURO ÂNGELO GONÇALVES ; ASSIS, RENATA DE ALMEIDA BARBOSA ; DO CARMO, FLÁVIO FONSECA ; KAMINO, LUCIANA HIROMI YOSHINO ; SILVA, ROBSON SOARES ; FERRO, JESUS APARECIDO ; Ferro, Maria Inês Tiraboschi ; FERREIRA, Rafael Marini ; SANTOS, VERA LÚCIA ; SILVA, UBIANA DE CÁSSIA MOURÃO ; ALMEIDA, NALVO FRANCO ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; et.al. Serratia liquefaciens FG3 isolated from a metallophyte plant sheds light on the evolution and mechanisms of adaptive traits in extreme environments. Scientific Reports. v. 9, p. 18006, issn: 2045-2322, 2019. Qualis: A2
OLIVEIRA, AMANDA C.P. ; FERREIRA, RAFAEL M. ; FERRO, MARIA INÊS T. ; Ferro, Jesus A. ; CHANDLER, MICK ; VARANI, ALESSANDRO M.. Transposons and pathogenicity in Xanthomonas : acquisition of murein lytic transglycosylases by Tn Xax1 enhances Xanthomonas citri subsp. citri 306 virulence and fitness. PeerJ. v. 6, p. e6111, issn: 2167-8359, 2018. Qualis: A2
DUDA, Rose Maria ; VANTINI, JULIANA DA SILVA ; MARTINS, LARISSA SCATTOLIN ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO ; FERRO, MARIA INÊS TIRABOSCHI ; OLIVEIRA, ROBERTO ALVES DE. A balanced microbiota efficiently produces methane in a novel high-rate horizontal anaerobic reactor for the treatment of swine wastewater. Bioresource Technology. v. 197, p. 152-160, issn: 0960-8524, 2015. Qualis: A1
DE OLIVEIRA, AMANDA CAROLINA P. ; FERREIRA, Rafael Marini ; Ferro, J. A. ; VARANI, A. ; FERRO, M.I.T.. Papel das proteínas de rearranjo de membranas (Transglicosilases) na virulência da bactéria causadora do cancro cítrico. Em: 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, 2016, Jaboticabal. 1 Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. Jaboticabal: revista Ciência & Tecnologia, v. 8, 2016.
COFRE, T. ; MURATA, M. ; CAVALLINI, J. ; HERAI, R. ; FERRAZA, A. ; TEZZA, R. I. D. ; VARANI, A. ; FERNANDES, C C ; Maria Inês T. Ferro ; BELASQUE JR., JOSE ; Ferro, Jesus A. ; FERREIRA, H.. Sweet Orange Valência Transcriptional Profiling (RNA-Seq) after infection by Xanthomonas citri subsp. Citri. Em: XLII Reunião Anual da SBBq, 2013, Foz do Iguaçu. XLII Reunião Anual da SBBq, 2013.
MURATA, M. ; CAVALLINI, J. ; COFRE, T. ; HERAI, R. ; FERRASA, A. ; TEZZA, R. I. D. ; VARANI, A. ; FERNANDES, C C ; BELASQUE JR., JOSE ; LEITE JR, R. P. ; Maria Inês T. Ferro ; Ferro, Jesus A.. Transcriptional Profiling of Canker-Resistant Satsuma Mandarin (Citrus unshiu) by RNA-Seq. Em: XLII Reunião Anual da SBBq, 2013, Foz do Iguaçu. XLII Reunião Anual da SBBq, 2013.

Alessandro de Mello Varani ⇔ Rosangela Zacarias Machado (5.0)
DO AMARAL, RENAN BRESSIANINI ; CARDOZO, MARITA VEDOVELLI ; Varani, Alessandro de Mello ; FURQUIM, MARIA EDUARDA CHIARADIA ; DIAS, CLARA MORATO ; ASSIS, WILLIAM OLIVEIRA DE ; DA SILVA, ALANDERSON RODRIGUES ; HERRERA, HEITOR MIRAGLIA ; MACHADO, ROSANGELA ZACARIAS ; ANDRÉ, MARCOS ROGÉRIO. First Report of Bartonella spp. in Marsupials from Brazil, with a Description of Bartonella harrusi sp. nov. and a New Proposal for the Taxonomic Reclassification of Species of the Genus Bartonella. Microorganisms. v. 10, p. 1609, issn: 2076-2607, 2022. Qualis: B1
BOUER, ANDRÉA ; ANDRÉ, Marcos Rogério ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; LUZZI, MAYARA DE CÁSSIA ; OLIVEIRA, JULIANA PAULA DE ; RODRIGUES, ADRIANA CARLOS ; VARANI, ALESSANDRO DE MELO ; MIRANDA, VITOR FERNANDES OLIVEIRA DE ; PERLES, LÍVIA ; WERTHER, Karin ; Machado, Rosangela Zacarias. Hepatozoon caimani in Caiman crocodilus yacare (Crocodylia, Alligatoridae) from North Pantanal, Brazil. REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINARIA. v. 26, p. 352-358, issn: 1984-2961, 2017. Qualis: A2 (REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA)
SILVA, JENEVALDO BARBOSA ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; ANDRÉ, Marcos Rogério ; Machado, Rosangela Zacarias. Genetic diversity and molecular phylogeny of Anaplasma marginale studied longitudinally under natural transmission conditions in Rio de Janeiro, Brazil. Ticks and Tick-borne Diseases. v. 6, p. 499-507, issn: 1877-959X, 2015. Qualis: A1
MACHADO, R. Z.; TEIXEIRA, MARTA MG ; FUSATO, A. C. R. ; BARBOSA DA SILVA, JENEVALDO ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; André, Marcos R. ; VARANI, A. M.. Molecular detection of tick-borne agents in Affrican buffalos (Syncerus catffer) in Marromeu National Park, Mozambique. Em: 12th Biennial Conference of the Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM) and the VIII International Conference on Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8), 2014, Cape Town. Joint 8th International Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8) and 12th Biennial Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM) Conference. Cape Town, v. 1, p. 68-68, 2014.
BARBOSA DA SILVA, JENEVALDO ; GONÇALVES, LUIZ RICARDO ; André, Marcos R. ; VARANI, A. M. ; Machado, R.Z.. Genetic diversity and multiple infections with Anaplasma marginale in naturally infected cattle in Rio de Janeiro state, Brazil. Em: 12th Biennial Conference of the Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM) and the VIII International Conference on Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8), 2014, Cape Town. Joint 8th International Ticks and Tick-borne Pathogens (TTP-8) and 12th Biennial Society for Tropical Veterinary Medicine (STVM) Conference. Cape Town, v. 1, p. 93-93, 2014.

Alessandro de Mello Varani ⇔ Angelo Berchieri Junior (2.0)
SARAIVA, MAURO DE MESQUITA SOUSA ; BENEVIDES, VALDINETE PEREIRA ; SILVA, NÚBIA MICHELLE VIEIRA DA ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; FREITAS NETO, OLIVEIRO CAETANO DE ; BERCHIERI, ÂNGELO ; DELGADO-SUÁREZ, ENRIQUE JESÚS ; ROCHA, ALAN DOUGLAS DE LIMA ; EGUALE, TADESSE ; MUNYALO, JANET AGNES ; KARIUKI, SAMUEL ; GEBREYES, WONDWOSSEN ABEBE ; OLIVEIRA, CELSO JOSÉ BRUNO DE. Genomic and Evolutionary Analysis of Salmonella enterica Serovar Kentucky Sequence Type 198 Isolated From Livestock In East Africa. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. v. 12, p. 1-12, issn: 2235-2988, 2022. Qualis: A1
BATISTA, D. F. A. ; FREITAS NETO, O. C. ; LEITE, L. R. ; VARANI, A. M. ; ARAUJO, F. M. G. ; SALIM, A. ; ALMEIDA, A. M. ; RIBEIRO, S. A. M. ; OLIVEIRA, G. C. ; BARROW, P. A. ; BERCHIERI JUNIOR, A.. Draft Genome Sequence of Salmonella enterica subsp. enterica Serovar Gallinarum Biovar Pullorum Strain FCAV198, a Brazilian Chicken Pathogen. Genome Announcements. v. 2, p. e00028-14-e00028-14, issn: 2169-8287, 2014. Qualis: B3

Alessandro de Mello Varani ⇔ Manoel Victor Franco Lemos (2.0)
DUDA, Rose Maria ; VANTINI, JULIANA DA SILVA ; MARTINS, LARISSA SCATTOLIN ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO ; FERRO, MARIA INÊS TIRABOSCHI ; OLIVEIRA, ROBERTO ALVES DE. A balanced microbiota efficiently produces methane in a novel high-rate horizontal anaerobic reactor for the treatment of swine wastewater. Bioresource Technology. v. 197, p. 152-160, issn: 0960-8524, 2015. Qualis: A1
VARANI, A. M. ; LEMOS, M. V. F. ; FERNANDES, C. C. ; LEMOS, E. G. M. ; ALVES, E. C. C. ; DESIDERIO, J. A.. Draft Genome Sequence of Bacillus thuringiensis var. thuringiensis Strain T01-328, a Brazilian Isolate That Produces a Soluble Pesticide Protein, Cry1Ia. Genome Announcements. v. 1, p. e00817-13-e00817-13, issn: 2169-8287, 2013. Qualis: B3

Alessandro de Mello Varani ⇔ Diego Cunha Zied (1.0)
DE ABREU, CARLOS GODINHO ; WURDIG ROESCH, LUIZ FERNANDO ; ANDREOTE, FERNANDO DINI ; SILVA, SAURA RODRIGUES ; JUNQUEIRA DE MORAES, TATIANA SILVEIRA ; ZIED, DIEGO CUNHA ; DE SIQUEIRA, FÉLIX GONÇALVES ; DIAS, EUSTÁQUIO SOUZA ; VARANI, ALESSANDRO M. ; PYLRO, VICTOR SATLER. Decoding the chromosome-scale genome of the nutrient-rich Agaricus subrufescens: A Resource for fungal biology and biotechnology. RESEARCH IN MICROBIOLOGY. v. 8, p. 104116, issn: 0923-2508, 2023. Qualis: A4

Alessandro de Mello Varani ⇔ Fernando Antonio de Avila (1.0)
RODRIGUES, ROMÁRIO ALVES ; PIZAURO, LUCAS JOSÉ LUDUVERIO ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; DE ALMEIDA, CAMILA CHIODA ; SILVA, SAURA RODRIGUES ; CARDOZO, MARITA VEDOVELLI ; MACINNES, JANET I. ; KROPINSKI, ANDREW M. ; MELO, POLIANA DE CASTRO ; ÁVILA, FERNANDO ANTONIO. Comparative genomics study of Staphylococcus aureus isolated from cattle and humans reveals virulence patterns exclusively associated with bovine clinical mastitis strains. Frontiers in Microbiology. v. 13, p. 1, issn: 1664-302X, 2022. Qualis: A1

Alessandro de Mello Varani ⇔ Helio Jose Montassier (1.0)
Fernandes, Camila C. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; LEMOS, ELIANA G.M. ; DE MIRANDA, VITOR FERNANDES O. ; SILVA, KETHERSON R. ; FERNANDO, FILIPE S. ; MONTASSIER, MARIA F.S. ; Montassier, Helio J.. Molecular and phylogenetic characterization based on the complete genome of a virulent pathotype of Newcastle disease virus isolated in the 1970s in Brazil. Infection, Genetics and Evolution (Print). v. 26, p. 160-167, issn: 1567-1348, 2014. Qualis: A2

Alessandro de Mello Varani ⇔ Jackson Antônio Marcondes de Souza (1.0)
Pinheiro, D.G. ; SILVA, S. R. ; MENEZES, C. G. ; PENHA, H. A. ; de Souza, Jackson Antônio Marcondes ; DESIDERIO, J. A. ; CARVALHO, R. F. ; VARANI, A. M. ; MIRANDA, V. F. O.. De novo transcriptome assembly and gene expression for anthocyanin pathway in Utricularia flower variants. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.

Alessandro de Mello Varani ⇔ Roberto Alves de Oliveira (1.0)
DUDA, Rose Maria ; VANTINI, JULIANA DA SILVA ; MARTINS, LARISSA SCATTOLIN ; VARANI, ALESSANDRO DE MELLO ; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO ; FERRO, MARIA INÊS TIRABOSCHI ; OLIVEIRA, ROBERTO ALVES DE. A balanced microbiota efficiently produces methane in a novel high-rate horizontal anaerobic reactor for the treatment of swine wastewater. Bioresource Technology. v. 197, p. 152-160, issn: 0960-8524, 2015. Qualis: A1

(*) Relatório criado com produções desde 2004 até 2024
Data de processamento: 14/01/2025 17:22:59

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