Programa de Pós-Graduação em Microbiologia Agropecuária

Daniel Guariz Pinheiro

Possui graduação (Bacharelado) em Ciência da Computação pela Universidade Paulista (UNIP) (2001), pós-graduação (Doutorado) em Genética pela Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP) (2009), e Pós-Doutorado na área de Bioinformática aplicada à Biologia do Desenvolvimento de Abelhas na Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP-USP) (2012). Durante o doutorado atuou na área de Bioinformática aplicada à Genética Humana e Médica na Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (FMRP-USP) (2001-2010). Atualmente é Professor na Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV - Unesp) onde atua no Programa de Pós-Graduação em Microbiologia Agropecuária, particularmente, nas linhas de pesquisas em Genética e Biologia Molecular de Microrganismos e Ecologia Microbiana. A sua pesquisa tem como temática os estudos moleculares da fitomicrobiota em interação com a planta e o meio-ambiente. Tem experiência na área de Bioinformática, com destaque aos estudos que envolvem abordagens "ômicas" (Genômica, Transcritômica, Metagenômica, Metataxonômica, Epigenômica, etc.). (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/1127775073652502 (19/12/2024)

Rótulo/Grupo: Professor

Bolsa CNPq: Nível 2

Período de análise: 2014-HOJE

Endereço: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Departamento de Biotecnologia Agropecuária e Ambiental. Via de Acesso Prof. Paulo Donato Castellane, s/n Vila Industrial 14884900 - Jaboticabal, SP - Brasil Telefone: (16) 32097541 URL da Homepage: https://unesp.br/portaldocentes/docentes/244411

Grande área: Ciências Exatas e da Terra

Área: Ciência da Computação

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (68)
1. GIL, TATIANA ; ROMÃO, INÊS REBELO ; GOMES, JOANA DO CARMO ; VERGARA-DIAZ, OMAR ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; SOUSA, ANDRE ; KASA, FLAVIA ; TEIXEIRA, RAQUEL ; MATEUS, SARA ; KATAMADZE, ART'RS ; Pinheiro, Daniel Guariz ; VICENTE, RUBÉN ; VÍLCHEZ, JUAN IGNACIO. Comparing native and non-native seed-isolated strains for drought resilience in maize (Zea mays L.). Plant Stress. v. 12, p. 100462, issn: 2667-064X, 2024. Qualis: Não identificado (PLANT STRESS)
2. SANT?ANNA, GUSTAVO SOUZA LIMA ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; DA SILVA, MAURA SANTOS REIS DE ANDRADE ; GONÇALVES, JOÃO VITOR DA SILVA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; ZONTA, EVERALDO ; COELHO, IRENE DA SILVA. Short-Term Effects of Poultry Litter and Cattle Manure on Soil?s Chemical Properties and Bacterial Community. Agronomy-Basel. v. 14, p. 1382, issn: 2073-4395, 2024. Qualis: A2
3. FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; TEHERAN-SIERRA, LUIS GUILLERMO ; DIBELLI, SABRINA CUSTODIO ; LEMOS, ELIANA GERTRUDES DE MACEDO ; Pinheiro, Daniel Guariz. Unveiling genomic features linked to traits of plant growth-promoting bacterial communities from sugarcane. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT. v. 947, p. 174577, issn: 0048-9697, 2024. Qualis: A1
4. CASTELLANE, TEREZA CRISTINA L. ; FERNANDES, CAMILA C. ; Pinheiro, Daniel G. ; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO ; VARANI, ALESSANDRO M.. Exploratory comparative transcriptomic analysis reveals potential gene targets associated with Cry1A.105 and Cry2Ab2 resistance in fall armyworm (Spodoptera frugiperda). FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS. v. 24, p. 129, issn: 1438-793X, 2024. Qualis: A2
5. RIGOBELO, EVERLON CID ; DE ANDRADE, LUANA ALVES ; SANTOS, CARLOS HENRIQUE BARBOSA ; FREZARIN, EDVAN TECIANO ; SALES, LUZIANE RAMOS ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; GUARIZ PINHEIRO, DANIEL ; NICODEMO, DANIEL ; BABALOLA, OLUBUKOLA OLURANTI ; VERDI, MARIA CAROLINE QUECINE ; MONDIN, MATEUS ; DESOIGNIES, NICOLAS. Effects of Trichoderma harzianum and Bacillus subtilis on the root and soil microbiomes of the soybean plant INTACTA RR2 PRO-. Frontiers in Plant Science. v. 15, p. 1, issn: 1664-462X, 2024. Qualis: A1
6. RIGOBELO, E. C. ; CARVALHO, L. A. L. ; SANTOS, CARLOS HENRIQUE BARBOSA ; FREZARIN, E. T. ; PINHEIRO, D. G. ; NICODEMO, D. ; BABALOLA, OLUBUKOLA OLURANTI ; DESOIGNIES, NICOLAS. Growth promotion and modulation of the soybean microbiome INTACTA RR PRO with the application of the fungi Trichoderma harzianum and Purpureocillum lilacinum. Scientific Reports. v. 14, p. 21004, issn: 2045-2322, 2024. Qualis: A2
7. ROQUE, WELLINGTON FAVA ; DE MOURA, JAMES MORAES ; SANTOS-SILVA, LORHAINE ; DA SILVA, GILVAN FERREIRA ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; Pinheiro, Daniel Guariz ; WOBETO, CARMEN ; SOARES, MARCOS ANTÔNIO. Fungal community structure in bees: influence of biome and host species. SYMBIOSIS. v. 1, p. 1, issn: 0334-5114, 2024. Qualis: A2
8. SIQUEIRA, JOSIANE SOARES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; SANTOS, CARLOS HENRIQUE BARBOSA ; FREZARIN, EDVAN TECIANO ; Pinheiro, Daniel Guariz ; NICODEMO, DANIEL ; DESOIGNIES, NICOLAS ; RIGOBELO, EVERLON CID. Influence of Growth Support on the Diversity, Composition, and Functionality of Microbial Communities Associated with Tillandsia recurvata. MICROBIAL ECOLOGY. v. 87, p. 129, issn: 0095-3628, 2024. Qualis: A1
9. SANTOS-SILVA, LORHAINE ; ROQUE, WELLINGTON FAVA ; DE MOURA, JAMES MORAES ; MELLO, IVANI SOUZA ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; Pinheiro, Daniel Guariz ; BOUZAN, RODRIGO SALVADOR ; BRESCOVIT, ANTONIO DOMINGOS ; DE ANDRADE, RICARDO LOPES TORTORELA ; DA SILVA, GILVAN FERREIRA ; BATTIROLA, LEANDRO DÊNIS ; SOARES, MARCOS ANTÔNIO. Toxic metals in Amazonian soil modify the bacterial community associated with Diplopoda. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT. v. 955, p. 176915, issn: 0048-9697, 2024. Qualis: A1
10. CORVAL, AMANDA ROCHA DA COSTA ; CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES DE ; MESQUITA, EMILY ; FIOROTTI, JÉSSICA ; CORRÊA, THAÍS ALMEIDA ; BÓRIO, VICTÓRIA SILVESTRE ; CARNEIRO, ADRIANI DA SILVA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; COELHO, IRENE DA SILVA ; SANTOS, HUARRISSON AZEVEDO ; FERNANDES, EVERTON KORT KAMP ; ANGELO, ISABELE DA COSTA ; BITTENCOURT, VÂNIA R. E. P. ; GOLO, PATRÍCIA SILVA. Transcriptional responses of Metarhizium pingshaense blastospores after UV-B irradiation. Frontiers in Microbiology. v. 15, p. 1, issn: 1664-302X, 2024. Qualis: A1
11. BONALDI, DAIANE SILVA ; FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; FERNANDES, CAMILA CESÁRIO ; LAURITO, HENRIQUE FONTELLAS ; Pinheiro, Daniel Guariz ; ALVES, LUCIA MARIA CARARETO. Genetic and biochemical determinants in potentially toxic metals resistance and plant growth promotion in Rhizobium sp LBMP-C04. World Journal of Microbiology and Biotechnology (Online). v. 41, p. 7, issn: 1573-0972, 2024. Qualis: A4 (WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY)
12. UNÊDA-TREVISOLI, SANDRA HELENA ; DIRK, LYNNETTE M.A. ; CARLOS BEZERRA PEREIRA, FRANCISCO ELDER ; CHAKRABARTI, MANOHAR ; HAO, GUIJIE ; CAMPBELL, JAMES M. ; BASSETTI NAYAKWADI, SAI DEEPSHIKHA ; MORRISON, ASHLEY ; JOSHI, SANJAY ; PERRY, SHARYN E. ; SHARMA, VIJYESH ; MENSAH, CALEB ; WILLARD, BARBARA ; DE LORENZO, LAURA ; AFROZA, BASEERAT ; HUNT, ARTHUR G. ; KAWASHIMA, TOMOKAZU ; VAILLANCOURT, LISA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; DOWNIE, A. BRUCE ; et.al. Dehydrin client proteins identified using phage display affinity selected libraries processed with Paired-End PhAge Sequencing (PEPA-Seq). MOLECULAR & CELLULAR PROTEOMICS. v. 1, p. 100867, issn: 1535-9476, 2024. Qualis: A1
13. MARTINS, JULIANA R. ; Pinheiro, Daniel G. ; AHMED, AMY C. C. ; GIULIATTI, SILVANA ; MIZZEN, CRAIG A. ; BITONDI, MÁRCIA M. G.. Genome-wide analysis of the chromatin sites targeted by HEX 70a storage protein in the honeybee brain and fat body. INSECT MOLECULAR BIOLOGY. v. 1, p. 10.1111/imb.128, issn: 0962-1075, 2023. Qualis: A1
14. SILVA, SAURA R. ; F. O. MIRANDA, VITOR ; MICHAEL, TODD P. ; P'ACHNO, BARTOSZ J. ; MATOS, RAMON G. ; ADAMEC, LUBOMIR ; L. K. POND, SERGEI ; LUCACI, ALEXANDER G. ; PINHEIRO, DANIEL G. ; Varani, Alessandro M.. The phylogenomics and evolutionary dynamics of the organellar genomes in carnivorous Utricularia and Genlisea species (Lentibulariaceae). MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION. v. 181, p. 107711, issn: 1055-7903, 2023. Qualis: A1
15. GIMENES DE CASTRO, BÁRBARA ; MARI FREDI, BRUNO ; DOS SANTOS BEZERRA, RAFAEL ; ALCANTARA, QUEREN APUQUE ; MILANI NEME, CARLOS EDUARDO ; MASCARELLI, DANIELE ENRIQUETTO ; CARVALHO TAHYRA, ALINE SEIKO ; DOS-SANTOS, DOUGLAS ; NAPPI, CAMILLA RIZZO ; SANTOS DE OLIVEIRA, FERNANDA ; PEREIRA FREIRE, FLAVIA ; BALLESTERO, GIULIA ; MENUCI LIMA, JULIA BEATRIZ ; DE ANDRADE BOLSONI, JULIANA ; LOURENÇO GEBENLIAN, JULIANA ; LOPES BIBO, NAIRA ; SOARES SILVA, NATHÁLIA ; DE CARVALHO SANTOS, NILTON ; SIMIONATTO ZUCHERATO, VICTORIA ; PINHEIRO, D. G. ; et.al. Metabarcoding approach to identify bacterial community profiling related to nosocomial infection and bacterial trafficking-routes in hospital environments. Journal of Toxicology and Environmental Health, Part A. v. 1, p. 1-13, issn: 1087-2620, 2023. Qualis: Não identificado (JOURNAL OF TOXICOLOGY AND ENVIRONMENTAL HEALTH, PART A)
16. ANDRÉ, MARCOS ROGÉRIO ; IKEDA, PRISCILA ; LEE, DANIEL ANTÔNIO BRAGA ; DO AMARAL, RENAN BRESSIANINI ; CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; Pinheiro, Daniel Guariz ; TORRES, JAIRE MARINHO ; DE MELLO, VICTÓRIA VALENTE CALIFRE ; RICE, GREGORY K. ; CER, REGINA Z. ; LOURENÇO, ELIZABETE CAPTIVO ; OLIVEIRA, CARISA ELISEI ; HERRERA, HEITOR MIRAGLIA ; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES ; MACHADO, ROSANGELA ZACARIAS ; BISHOP-LILLY, KIMBERLY A. ; DALGARD, CLIFTON L. ; DUMLER, J. STEPHEN. Characterization of the bacterial microbiome of non-hematophagous bats and associated ectoparasites from Brazil. Frontiers in Microbiology. v. 14, p. 1, issn: 1664-302X, 2023. Qualis: A1
17. RESTAN, ALEJANDRO ZAMORA ; CAMACHO, APARECIDO ANTONIO ; ZACCHÉ, EVANDRO ; CANOLA, RAPHAELA ARANTES MARQUES ; SILVA, SAMARA BERETTA GOMES ; BRAZ, JAISLANE BASTOS ; SILVA-FILHO, JORGE CARDOSO DA ; CERQUEIRA, JULIANA APARECIDA ; LOUREIRO, BRUNA AGY ; FUNNICELLI, MICHELLI INACIO GONÇALVES ; Pinheiro, Daniel Guariz ; FERRAZ, GUILHERME CAMARGO. Conditioning Program Prescribed from the External Training Load Corresponding to the Lactate Threshold Improved Cardiac Function in Healthy Dogs. ANIMALS. v. 12, p. 73, issn: 2076-2615, 2022. Qualis: A3
18. FERRAZ, G.C. ; SGARBIERO, T. ; CARVALHO, J.R.G. ; ALMEIDA, M.L.M. ; PEREIRA, G.T. ; FUNNICELLI, M.I.G. ; PINHEIRO, D.G. ; RESTAN, A.Z.. Predicting maximal lactate steady state from lactate thresholds determined using methods based on an incremental exercise test in beagle dogs: A study using univariate and multivariate approaches. RESEARCH IN VETERINARY SCIENCE. v. 152, p. 289-299, issn: 0034-5288, 2022. Qualis: A1
19. BORGONOVI, TAIS FERNANDA ; SALGAÇO, MATEUS KAWATA ; OLIVEIRA, GISLANE LELIS VILELA DE ; CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES DE ; Pinheiro, Daniel Guariz ; TODOROV, SVETOSLAV DIMITROV ; SIVIERI, KÁTIA ; CASAROTTI, SABRINA NEVES ; PENNA, ANA LÚCIA BARRETTO. Functional Fermented Milk with Fruit Pulp Modulates the In Vitro Intestinal Microbiota. Foods. v. 11, p. 4113, issn: 2304-8158, 2022. Qualis: C
20. SUÁREZ-ACEVEDO, SARA ; CHAVES-BEDOYA, GIOVANNI ; GUARIZ-PINHEIRO, DANIEL ; CRISTINA-LOPES, ALINE ; MARI-MURATA, MAYARA ; HIROCHI-HERAI, ROBERTO ; APARECIDO-FERRO, JESUS ; RODAS-MENDOZA, ELKIN. Comparative transcriptional analyzes of Xanthomonas citri subsp. citri reveal mechanisms of adaptation and bacterial virulence in the early stage of citrus canker disease. EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY. v. 163, p. 557-572, issn: 0929-1873, 2022. Qualis: A2
21. FALQUETO, SILVIA ALTOÉ ; DE SOUSA, JANAÍNA ROSA ; DA SILVA, RAFAEL CORREIA ; DA SILVA, GILVAN FERREIRA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; SOARES, MARCOS ANTÔNIO. Larval gut microbiome of Pelidnota luridipes (Coleoptera: Scarabaeidae): high bacterial diversity, different metabolic profiles on gut chambers and species with probiotic potential. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY. v. 38, p. 210, issn: 0959-3993, 2022. Qualis: A4
22. DA SILVA, MAURA SANTOS REIS DE ANDRADE ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; BRAOS, LUCAS BOSCOV ; DE SOUSA ANTUNES, LUIZ FERNANDO ; DA SILVA, CAMILLA SANTOS REIS DE ANDRADE ; DA SILVA, CLEUDISON GABRIEL NASCIMENTO ; Pinheiro, Daniel Guariz ; CORREIA, MARIA ELIZABETH FERNANDES ; ARAÚJO, EDNALDO DA SILVA ; COLNAGO, LUIZ ALBERTO ; DESOIGNIES, NICOLAS ; ZONTA, EVERALDO ; RIGOBELO, EVERLON CID. Effect of the application of vermicompost and millicompost humic acids about the soybean microbiome under water restriction conditions. Frontiers in Microbiology. v. 13, p. 1, issn: 1664-302X, 2022. Qualis: A1
23. MONEDA, ANA PAULA CORRÊA ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; TEHERAN-SIERRA, LUIS GUILLERMO ; FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; Pinheiro, Daniel Guariz. Sugarcane cultivation practices modulate rhizosphere microbial community composition and structure. Scientific Reports. v. 12, p. 19174, issn: 2045-2322, 2022. Qualis: A2
24. MARTELLI, FELIPE ; FALCON, TIAGO ; Pinheiro, Daniel G. ; SIMÕES, ZILÁ L.P. ; NUNES, FRANCIS M.F.. Worker bees (Apis mellifera) deprived of pollen in the first week of adulthood exhibit signs of premature aging. INSECT BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY. v. 146, p. 103774, issn: 0965-1748, 2022. Qualis: A1
25. PELLIZONI, FELIPE PAPA ; LEITE, ALINE ZAZERI ; RODRIGUES, NATHÁLIA DE CAMPOS ; UBAIZ, MARCELO JORDÃO ; GONZAGA, MARINA IGNÁCIO ; TAKAOKA, NAUYTA NAOMI CAMPOS ; MARIANO, VÂNIA SAMMARTINO ; OMORI, WELLINGTON PINE ; Pinheiro, Daniel Guariz ; MATHEUCCI JUNIOR, EUCLIDES ; GOMES, ELENI ; DE OLIVEIRA, GISLANE LELIS VILELA. Detection of Dysbiosis and Increased Intestinal Permeability in Brazilian Patients with Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis. International Journal of Environmental Research and Public Health. v. 18, p. 4621, issn: 1660-4601, 2021. Qualis: A2
26. DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; TEHERAN-SIERRA, LUIS GUILLERMO ; FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; DA SILVA, RAFAEL CORREIA ; CAMPANARI, MARIA FERNANDA ZANELI ; DE SOUZA, RAFAEL SOARES CORREA ; ARRUDA, PAULO ; SOARES, MARCOS ANTÔNIO ; Pinheiro, Daniel Guariz. Farming systems influence the compositional, structural, and functional characteristics of the sugarcane-associated microbiome. MICROBIOLOGICAL RESEARCH. v. 252, p. 126866, issn: 0944-5013, 2021. Qualis: A3
27. FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; Pinheiro, Daniel Guariz ; GOMES-PEPE, ELISÂNGELA SOARES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; CAMPANHARO, JOÃO CARLOS ; FERNANDES, CAMILA CESÁRIO ; KISHI, LUCIANO TAKESHI ; CARARETO ALVES, LÚCIA MARIA ; DE MACEDO LEMOS, ELIANA GERTRUDES. Metagenome-assembled genome of a Chitinophaga sp. and its potential in plant biomass degradation, as well of affiliated Pandoraea and Labrys species. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY. v. 37, p. 162, issn: 0959-3993, 2021. Qualis: A4
28. SOARES, MICHELLE PRIOLI MIRANDA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; DE PAULA FREITAS, FLÁVIA CRISTINA ; SIMÕES, ZILÁ LUZ PAULINO ; BITONDI, MÁRCIA MARIA GENTILE. Transcriptome dynamics during metamorphosis of imaginal discs into wings and thoracic dorsum in Apis mellifera castes. BMC GENOMICS. v. 22, p. 756, issn: 1471-2164, 2021. Qualis: A2
29. LUZZI, MAYARA DE CASSIA ; CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES DE ; Pinheiro, Daniel Guariz ; LIMA-DUARTE, LEIDIANE ; CAMARGO, JAQUELINE VALÉRIA ; KISHI, LUCIANO TAKESHI ; FERNANDES, CAMILA CESÁRIO ; MACHADO, ROSANGELA ZACARIAS ; SOARES, JOÃO FÁBIO ; ANDRÉ, MARCOS ROGÉRIO ; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES. Analysis on the prokaryotic microbiome in females and embryonic cell cultures of Rhipicephalus sanguineus tropical and temperate lineages from two specific localities in Brazil. REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINARIA. v. 30, p. e005721, issn: 1984-2961, 2021. Qualis: A2 (REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA)
30. TEHERAN-SIERRA, LUIS GUILLERMO ; FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; FERRO, MARIA INÊS TIRABOSCHI ; SOARES, MARCOS ANTÔNIO ; Pinheiro, Daniel Guariz. Bacterial communities associated with sugarcane under different agricultural management exhibit a diversity of plant growth-promoting traits and evidence of synergistic effect. MICROBIOLOGICAL RESEARCH. v. 247, p. 126729, issn: 0944-5013, 2021. Qualis: A3
31. DA SILVA MACIEL, JONATHAM HERCULES ; MELLO, IVANI SOUZA ; VENDRUSCULO, SUZANA JUNGES ; SENABIO, JAQUELINE ALVES ; DA SILVA, RAFAEL CORREIA ; DE SIQUEIRA, ADRIANO BUZUTTI ; Pinheiro, Daniel Guariz ; SOARES, MARCOS ANTONIO. Endophytic and rhizospheric bacterial communities are affected differently by the host plant species and environmental contamination. SYMBIOSIS. v. 85, p. 191-206, issn: 0334-5114, 2021. Qualis: A2
32. CONDE, GABRIEL ; DE CARVALHO, JÚLIA RIBEIRO GARCIA ; DIAS, PAULA DO PATROCÍNIO ; MORANZA, HENRIETTE GELLERT ; MONTANHIM, GABRIEL LUIZ ; RIBEIRO, JULIANA DE OLIVEIRA ; CHINELATTO, MARCELO APARECIDO ; MORAES, PAOLA CASTRO ; TABOGA, SEBASTIÃO ROBERTO ; BERTOLO, PAULO HENRIQUE LEAL ; GONÇALVES FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO ; Pinheiro, Daniel Guariz ; FERRAZ, GUILHERME DE CAMARGO. In vivo biocompatibility and biodegradability of poly(lactic acid)/poly(ε-caprolactone) blend compatibilized with poly(ε-caprolactone-b-tetrahydrofuran) in Wistar rats. BIOMEDICAL PHYSICS & ENGINEERING EXPRESS. v. 7, p. 035005, issn: 2057-1976, 2021. Qualis: A4
33. VIEIRA, JOSEANA ; DE PAULA FREITAS, FLÁVIA CRISTINA ; SANTOS CRISTINO, ALEXANDRE ; GUARIZ PINHEIRO, DANIEL ; AGUIAR, LUIZ ROBERTO ; FRAMARTINO BEZERRA LAURE, MARCELA APARECIDA ; ROSATTO MODA, LÍVIA MARIA ; PAULINO SIMÕES, ZILÁ LUZ ; BARCHUK, ANGEL ROBERTO. Molecular underpinnings of the early brain developmental response to differential feeding in the honey bee Apis mellifera. Biochimica et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms. v. 1864, p. 194732, issn: 1874-9399, 2021. Qualis: A1
34. COSTA, ZIRLANE PORTUGAL ; VARANI, ALESSANDRO MELLO ; CAUZ'SANTOS, LUIZ AUGUSTO ; SADER, MARIELA ANALÍA ; GIOPATTO, HELENA AUGUSTO ; ZIRPOLI, BRUNA ; CALLOT, CAROLINE ; CAUET, STEPHANE ; MARANDE, WILLIAN ; SOUZA CARDOSO, JESSICA LUANA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; KITAJIMA, JOÃO PAULO ; DORNELAS, MARCELO CARNIER ; HARAND, ANDREA PEDROSA ; BERGES, HELENE ; MONTEIRO'VITORELLO, CLAUDIA BARROS ; CARNEIRO VIEIRA, MARIA LUCIA. A genome sequence resource for the genus Passiflora , the genome of the wild diploid species Passiflora organensis. Plant Genome. v. 14, p. e20117, issn: 1940-3372, 2021. Qualis: A1
35. DE AZEVEDO SILVA, FÁBIO ; DE OLIVEIRA VIEIRA, VANDINELMA ; CORREIA DA SILVA, RAFAEL ; GUARIZ PINHEIRO, DANIEL ; ANTÔNIO SOARES, MARCOS. Introduction of Trichoderma spp. biocontrol strains against Sclerotinia sclerotiorum (Lib.) de Bary change soil microbial community composition in common bean (Phaseolus vulgaris L.) cultivation. BIOLOGICAL CONTROL. v. 163, p. 104755, issn: 1049-9644, 2021. Qualis: A2
36. DE PAULA FREITAS, FLÁVIA C. ; LOURENÇO, ANETE P. ; NUNES, FRANCIS M. F. ; PASCHOAL, ALEXANDRE R. ; ABREU, FABIANO C. P. ; BARBIN, FÁBIO O. ; BATAGLIA, LUANA ; CARDOSO-JÚNIOR, CARLOS A. M. ; CERVONI, MÁRIO S. ; SILVA, SAURA R. ; DALARMI, FERNANDA ; DEL LAMA, MARCO A. ; DEPINTOR, THIAGO S. ; FERREIRA, KÁTIA M. ; GÓRIA, PAULA S. ; JASKOT, MICHAEL C. ; LAGO, DENYSE C. ; LUNA-LUCENA, DANIELLE ; MODA, LIVIA M. ; PINHEIRO, D. G. ; et.al. The nuclear and mitochondrial genomes of Frieseomelitta varia - a highly eusocial stingless bee (Meliponini) with a permanently sterile worker caste. BMC GENOMICS. v. 21, p. 1, issn: 1471-2164, 2020. Qualis: A2
37. DIRK, LYNNETTE M.A. ; ABDEL, CASER GHAAFAR ; AHMAD, IMRAN ; NETA, IZABEL COSTA SILVA ; PEREIRA, CRISTIANE CARVALHO ; PEREIRA, FRANCISCO ELDER CARLOS BEZERRA ; UNÊDA-TREVISOLI, SANDRA HELENA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; DOWNIE, ALLAN BRUCE. Late Embryogenesis Abundant Protein-Client Protein Interactions. PLANTS. v. 9, p. 814, issn: 2223-7747, 2020. Qualis: A2
38. SILVA, DANIELLY B. S. ; FONSECA, LARISSA F. S. ; Pinheiro, Daniel G. ; MAGALHÃES, ANA F. B. ; MUNIZ, MARIA M. M. ; FERRO, JESUS A. ; BALDI, FERNANDO ; CHARDULO, LUIS A. L. ; SCHNABEL, ROBERT D. ; TAYLOR, JEREMY F. ; ALBUQUERQUE, LUCIA G.. Spliced genes in muscle from Nelore Cattle and their association with carcass and meat quality. Scientific Reports. v. 10, p. 14701, issn: 2045-2322, 2020. Qualis: A2
39. MASTROCHIRICO-FILHO, VITO ANTONIO ; HATA, MILENE ELISSA ; KURADOMI, RAFAEL YUTAKA ; DE FREITAS, MILENA VIEIRA ; ARIEDE, RAQUEL BELINI ; Pinheiro, Daniel Guariz ; ROBLEDO, DIEGO ; HOUSTON, ROSS ; HASHIMOTO, DIOGO TERUO. Transcriptome Profiling of Pacu (Piaractus mesopotamicus) Challenged With Pathogenic Aeromonas hydrophila: Inference on Immune Gene Response. Frontiers in Genetics. v. 11, p. 1, issn: 1664-8021, 2020. Qualis: A2
40. PAULA JUNIOR, D. E. ; OLIVEIRA, M. T. ; BRUSCADIN, J. J. ; PINHEIRO, D. G. ; BOMTORIN, A. D. ; COELHO JÚNIOR, V. G. ; MODA, L. M. R. ; SIMÕES, Z. L. P. ; BARCHUK, A. R.. Caste-specific gene expression underlying the differential adult brain development in the honeybee Apis mellifera . INSECT MOLECULAR BIOLOGY. v. 30, p. 42-56, issn: 0962-1075, 2020. Qualis: A1
41. SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO DOS ; FONSECA, LARISSA FERNANDA SIMIELLI ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; MUNIZ, MARIA MALANE MAGALHÃES ; BALDI, FERNANDO ; FERRO, JESUS APARECIDO ; CHARDULO, LUIS ARTUR LOYOLA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO DE. Transcriptome profiling of muscle in Nelore cattle phenotypically divergent for the ribeye muscle area. GENOMICS. v. 112, p. 1257-1263, issn: 0888-7543, 2020. Qualis: A3
42. OMORI, WELLINGTON P. ; Pinheiro, Daniel G. ; KISHI, LUCIANO T. ; FERNANDES, CAMILA C. ; FERNANDES, GABRIELA C. ; GOMES-PEPE, ELISÂNGELA S. ; PAVANI, CLAUDIO D. ; LEMOS, ELIANA G. DE M. ; SOUZA, JACKSON A. M. DE. Draft genome of Thermomonospora sp. CIT 1 (Thermomonosporaceae) and in silico evidence of its functional role in filter cake biomass deconstruction. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION). v. 42, p. 145-150, issn: 1678-4685, 2019. Qualis: A4
43. FALCON, TIAGO ; Pinheiro, Daniel G. ; FERREIRA-CALIMAN, MARIA JULIANA ; TURATTI, IZABEL C. C. ; ABREU, FABIANO C. PINTO DE ; GALASCHI-TEIXEIRA, JULIANA S. ; MARTINS, JULIANA R. ; ELIAS-NETO, MOYSÉS ; SOARES, MICHELLE P. M. ; LAURE, MARCELA B. ; FIGUEIREDO, VERA L. C. ; LOPES, NORBERTO PEPORINE ; SIMÕES, ZILÁ L. P. ; GARÓFALO, CARLOS A. ; BITONDI, MÁRCIA M. G.. Exploring integument transcriptomes, cuticle ultrastructure, and cuticular hydrocarbons profiles in eusocial and solitary bee species displaying heterochronic adult cuticle maturation. PLoS One. v. 14, p. e0213796, issn: 1932-6203, 2019. Qualis: A1
44. DOS SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO ; FONSECA, LARISSA FERNANDA SIMIELLI ; Pinheiro, Daniel Guariz ; MUNIZ, MARIA MALANE MAGALHÃES ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; BALDI, FERNANDO ; FERRO, JESUS APARECIDO ; CHARDULO, LUIS ARTUR LOYOLA ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO. Prediction of hub genes associated with intramuscular fat content in Nelore cattle. BMC GENOMICS. v. 20, p. 520, issn: 1471-2164, 2019. Qualis: A2
45. LIOTTI, RHAVENA GRAZIELA ; DA SILVA, RAFAEL CORREIA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; DA SILVA, JOAQUIM MANOEL ; DA SILVA, GILVAN FERREIRA ; DE MENDONÇA, ELISABETH APARECIDA FURTADO ; SOARES, MARCOS ANTÔNIO. Characterization and comprehensive analysis of the ecological interaction networks of bacterial communities in Paullinia cupana var. sorbilis by 16S rRNA gene metabarcoding. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY. v. 35, p. 182, issn: 0959-3993, 2019. Qualis: A4
46. SILVA, SAURA R. ; Pinheiro, Daniel G. ; PENHA, HELEN A. ; P'ACHNO, BARTOSZ J. ; MICHAEL, TODD P. ; MEER, ELLIOTT J. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, ALESSANDRO M.. Intraspecific Variation within the Utricularia amethystina Species Morphotypes Based on Chloroplast Genomes. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 20, p. 6130, issn: 1422-0067, 2019. Qualis: A2
47. MASSARO, JULIANA DOBLAS ; POLLI, CLAUDIA DANELLA ; COSTA E SILVA, MATHEUS ; ALVES, CINTHIA CAROLINE ; PASSOS, GERALDO ALEIXO ; SAKAMOTO-HOJO, ELZA TIEMI ; RODRIGUES DE HOLANDA MIRANDA, WALLACE ; BISPO CEZAR, NATHALIA JOANNE ; RASSI, DIANE MEYRE ; CRISPIM, FELIPE ; DIB, SERGIO ATALA ; FOSS-FREITAS, MARIA CRISTINA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; DONADI, EDUARDO ANTÔNIO. Post-transcriptional markers associated with clinical complications in Type 1 and Type 2 diabetes mellitus. MOLECULAR AND CELLULAR ENDOCRINOLOGY. v. 490, p. 1-14, issn: 0303-7207, 2019. Qualis: A2
48. MELLO, T. R. P. ; ALEIXO, A. C. ; PINHEIRO, D. G. ; NUNES, F. M. F. ; CRISTINO, A. S. ; BITONDI, M. M. G. ; BARCHUK, A. R. ; SIMÕES, Z. L. P.. Hormonal control and target genes of ftz-f1 expression in the honeybee Apis mellifera : a positive loop linking juvenile hormone, ftz-f1 , and vitellogenin. INSECT MOLECULAR BIOLOGY. v. 28, p. 145-159, issn: 0962-1075, 2019. Qualis: A1
49. SILVA, SAURA R. ; MICHAEL, TODD P. ; MEER, ELLIOTT J. ; Pinheiro, Daniel G. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; MIRANDA, VITOR F. O.. Comparative genomic analysis of Genlisea (corkscrew plants-Lentibulariaceae) chloroplast genomes reveals an increasing loss of the ndh genes. PLoS One. v. 13, p. e0190321, issn: 1932-6203, 2018. Qualis: A1
50. VIDAL, DANIEL ONOFRE ; RAMÃO, ANELISA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; MUYS, BRUNA RODRIGUES ; CETRULO LORENZI, JULIO CESAR ; DE PÁDUA ALVES, CLEIDSON ; LUCIOLA ZANETTE, DALILA ; DE MOLFETTA, GREICE ANDREOTTI ; DUARTE, GERALDO ; SILVA JR, WILSON ARAÚJO. Highly expressed placental miRNAs control key biological processes in human cancer cell lines. Oncotarget. v. 9, p. 23554-23563, issn: 1949-2553, 2018. Qualis: A2
51. HIGUCHI, B. S. ; RODRIGUES, NATHÁLIA DE CAMPOS ; GONZAGA, MARINA IGNÁCIO ; PAIOLO, J. C. C. ; STEFANUTTO, N. A. V. ; OMORI, WELLINGTON PINE ; BRISOTTI, JOÃO LUIZ ; PINHEIRO, D. G. ; MATHEUCCI JUNIOR, EUCLIDES ; MARIANO, VÂNIA SAMMARTINO ; DE OLIVEIRA, GISLANE LELIS VILELA. Intestinal Dysbiosis in Autoimmune Diabetes Is Correlated With Poor Glycemic Control and Increased Interleukin-6: A Pilot Study. Frontiers in Immunology. v. 9, p. 1, issn: 1664-3224, 2018. Qualis: A1
52. ROBIATI TELLES, BRUNA ; DE SOUZA CARVALHO, FLÁVIA MARIA ; DA SILVA VANTINI, JULIANA ; ANDRUCIOLI BELESINI, ALINE ; MARQUES DE CASTRO, GIOVANNI ; GIACHETTO, POLIANA FERNANDA ; DOMINGUES CARLIN, SAMIRA ; RAMOS DA SILVA, THAIS ; GUARIZ PINHEIRO, DANIEL ; CAZETTA, JAIRO OSVALDO ; TIRABOSCHI FERRO, MARIA INÊS. Prolonged Water Deficit Reveals New Profile of Sugarcane Gene Expression and Metabolic Pathway Related to Tolerance. SUGAR TECH. v. 21, p. 451-461, issn: 0974-0740, 2018. Qualis: A4
53. BELESINI, A.A. ; CARVALHO, F.M.S. ; TELLES, B.R. ; DE CASTRO, G.M. ; GIACHETTO, P.F. ; VANTINI, J.S. ; CARLIN, S.D. ; CAZETTA, J.O. ; PINHEIRO, D.G. ; FERRO, M.I.T.. De novo transcriptome assembly of sugarcane leaves submitted to prolonged water-deficit stress. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH. v. 16, p. 1, issn: 1676-5680, 2017. Qualis: B3
54. SARAN, L. M. ; MENEGHINE, A. K. ; CELICO, A. S. ; PINHEIRO, D. G. ; ALVES, L. M. C.. Freshwater quality of a stream in agricultural area where organic compost from animal and vegetable wastes is used. CIENCIA E AGROTECNOLOGIA. v. 41, p. 263-278, issn: 1413-7054, 2017. Qualis: C (CIÊNCIA E AGROTECNOLOGIA)
55. SILVA, SAURA R. ; ALVARENGA, DANILLO O. ; ARANGUREN, YANI ; PENHA, HELEN A. ; FERNANDES, CAMILA C. ; Pinheiro, Daniel G. ; OLIVEIRA, MARCOS T. ; MICHAEL, TODD P. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, ALESSANDRO M.. The mitochondrial genome of the terrestrial carnivorous plant Utricularia reniformis (Lentibulariaceae): Structure, comparative analysis and evolutionary landmarks. PLoS One. v. 12, p. e0180484, issn: 1932-6203, 2017. Qualis: A1
56. LEITE, ALINE ZAZERI ; RODRIGUES, NATHÁLIA DE CAMPOS ; GONZAGA, MARINA IGNÁCIO ; PAIOLO, JOÃO CARLOS CICOGNA ; DE SOUZA, CAROLINA ARANTES ; STEFANUTTO, NADINE APARECIDA VICENTINI ; OMORI, WELLINGTON PINE ; Pinheiro, Daniel Guariz ; BRISOTTI, JOÃO LUIZ ; MATHEUCCI JUNIOR, EUCLIDES ; MARIANO, VÂNIA SAMMARTINO ; DE OLIVEIRA, GISLANE LELIS VILELA. Detection of Increased Plasma Interleukin-6 Levels and Prevalence of Prevotella copri and Bacteroides vulgatus in the Feces of Type 2 Diabetes Patients. Frontiers in Immunology. v. 8, p. 1, issn: 1664-3224, 2017. Qualis: A1
57. MOREIRA, EDITH C. O. ; Pinheiro, Daniel G. ; GORDO, SHEILA M. C. ; RODRIGUES, SIMONE M. ; PESSOA, ELAINE ; SCHALLER, HUBERT ; DE LEMOS, ORIEL F. ; Silva, Artur ; Schneider, Horacio ; Silva, Wilson A. ; Sampaio, Iracilda ; Darnet, Sylvain. Transcriptional profiling by RNA sequencing of black pepper (Piper nigrum L.) roots infected by Fusarium solani f. sp. piperis. ACTA PHYSIOLOGIAE PLANTARUM. v. 39, p. 1, issn: 0137-5881, 2017. Qualis: A3
58. DE LIMA, KALIL A. ; DE OLIVEIRA, GISLANE L. V. ; YAOCHITE, JULIANA N. U. ; Pinheiro, Daniel G. ; DE AZEVEDO, JÚLIA T. C. ; SILVA JR, WILSON ARAUJO ; COVAS, DIMAS T. ; COURI, CARLOS E. B. ; SIMÕES, BELINDA P. ; VOLTARELLI, JULIO C. ; OLIVEIRA, MARIA C. ; MALMEGRIM, KELEN C. R.. Transcriptional profiling reveals intrinsic mRNA alterations in multipotent mesenchymal stromal cells isolated from bone marrow of newly-diagnosed type 1 diabetes patients. Stem cell research & therapy. v. 7, p. 92, issn: 1757-6512, 2016. Qualis: A1
59. SILVA, SAURA R. ; DIAZ, YANI C. A. ; PENHA, HELEN ALVES ; Pinheiro, Daniel G. ; FERNANDES, CAMILA C. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; MICHAEL, TODD P. ; VARANI, ALESSANDRO M.. The Chloroplast Genome of Utricularia reniformis Sheds Light on the Evolution of the ndh Gene Complex of Terrestrial Carnivorous Plants from the Lentibulariaceae Family. Plos One. v. 11, p. e0165176, issn: 1932-6203, 2016. Qualis: A1
60. SILVA, SAURA R. ; Pinheiro, Daniel G. ; MEER, ELLIOTT J. ; MICHAEL, TODD P. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; MIRANDA, VITOR F. O.. The complete chloroplast genome sequence of the leafy bladderwort, Utricularia foliosa L. (Lentibulariaceae). Conservation Genetics Resources (Online). v. ?, p. 1-4, issn: 1877-7260, 2016. Qualis: B2
61. MACEDO, L. M. F. ; NUNES, F. M. F. ; FREITAS, F. C. P. ; PIRES, C. V. ; TANAKA, E. D. ; MARTINS, J. R. ; PIULACHS, M.-D. ; CRISTINO, A. S. ; PINHEIRO, D. G. ; SIMÕES, Z. L. P.. MicroRNA signatures characterizing caste-independent ovarian activity in queen and worker honeybees ( A pis mellifera L.). INSECT MOLECULAR BIOLOGY. v. 25, p. n/a-n/a, issn: 0962-1075, 2016. Qualis: A1
62. DE BARROS E LIMA BUENO, RAFAELA ; RAMÃO, ANELISA ; PINHEIRO, D. G. ; ALVES, CLEIDSON PADUA ; KANNEN, VINICIUS ; JUNGBLUTH, ACHIM A ; DE ARAÚJO, LUIZA FERREIRA ; MUYS, BRUNA RODRIGUES ; FONSECA, ALINE SIMONETI ; PLAÇA, JESSICA RODRIGUES ; PANEPUCCI, RODRIGO ALEXANDRE ; Neder, Luciano ; Saggioro, Fabiano P ; MAMEDE, RUI CELSO M. ; FIGUEIREDO, David Livingstone Alves ; SILVA, WILSON ARAÚJO. HOX genes: potential candidates for the progression of laryngeal squamous cell carcinoma. Tumor Biology. v. 37, p. 15087-15096, issn: 1423-0380, 2016. Qualis: A4
63. OLIVEIRA, G. L. V. ; LIMA, K. W. A. ; COLOMBINI, A. M. ; PINHEIRO, D. G. ; PANEPUCCI, R. A. ; PALMA, P. V. B. ; BRUM, D. G. ; COVAS, D. T. ; SIMOES, B. P. ; OLIVEIRA, M. C. ; DONADI, E. A. ; MALMEGRIM, K. C. R.. Bone Marrow Mesenchymal Stromal Cells Isolated From Multiple Sclerosis Patients Have Distinct Gene Expression Profile and Decreased Suppressive Function Compared With Healthy Counterparts. Cell Transplantation. v. 24, p. 151-165, issn: 0963-6897, 2015. Qualis: A2
64. SADD, BEN M ; BARRIBEAU, SETH M ; BLOCH, GUY ; DE GRAAF, DIRK C ; DEARDEN, PETER ; ELSIK, CHRISTINE G ; GADAU, JÜRGEN ; GRIMMELIKHUIJZEN, CORNELIS JP ; HASSELMANN, MARTIN ; LOZIER, JEFFREY D ; ROBERTSON, HUGH M ; SMAGGHE, GUY ; STOLLE, ECKART ; VAN VAERENBERGH, MATTHIAS ; WATERHOUSE, ROBERT M ; BORNBERG-BAUER, ERICH ; KLASBERG, STEFFEN ; BENNETT, ANNA K ; CÂMARA, FRANCISCO ; PINHEIRO, D. G. ; et.al. The genomes of two key bumblebee species with primitive eusocial organization. Genome Biology. v. 16, p. 76, issn: 1465-6906, 2015. Qualis: Não identificado (GENOME BIOLOGY)
65. PLAÇA, JESSICA RODRIGUES ; BUENO, RAFAELA DE BARROS E LIMA ; Pinheiro, Daniel Guariz ; PANEPUCCI, RODRIGO ALEXANDRE ; DE ARAÚJO, LUIZA FERREIRA ; MAMEDE, RUI CELSO MARTINS ; FIGUEIREDO, DAVID LIVINGSTONE ALVES ; SILVA, WILSON ARAÚJO. Gene expression analysis of laryngeal squamous cell carcinoma. Genomics Data. p. 9-12, issn: 2213-5960, 2015. Qualis: B1
66. KAPHEIM, K. M. ; PAN, H. ; LI, C. ; SALZBERG, S. L. ; PUIU, D. ; MAGOC, T. ; ROBERTSON, H. M. ; HUDSON, M. E. ; VENKAT, A. ; FISCHMAN, B. J. ; HERNANDEZ, A. ; YANDELL, M. ; ENCE, D. ; HOLT, C. ; YOCUM, G. D. ; KEMP, W. P. ; BOSCH, J. ; WATERHOUSE, R. M. ; ZDOBNOV, E. M. ; PINHEIRO, D. G. ; et.al. Genomic signatures of evolutionary transitions from solitary to group living. Science (New York, N.Y.). v. ., p. ., issn: 0036-8075, 2015. Qualis: A1
67. SALGADO, LEONARDO RIPPEL ; KOOP, DANIELA MARTINS ; Pinheiro, Daniel Guariz ; RIVALLAN, RONAN ; LE GUEN, VINCENT ; NICOLÁS, MARISA FABIANA ; DE ALMEIDA, LUIZ GONZAGA ; ROCHA, VIVIANI RIBEIRO ; MAGALHÃES, MILENA ; GERBER, ALEXANDRA LEHMKUHL ; FIGUEIRA, ANTONIO ; CASCARDO, JÚLIO CÉZAR ; DE VASCONCELOS, ANATEREZA RIBEIRO ; SILVA, WILSON ARAÚJO ; COUTINHO, LUIZ LEHMANN ; GARCIA, DOMINIQUE. De novo transcriptome analysis of Hevea brasiliensis tissues by RNA-seq and screening for molecular markers. BMC Genomics. v. 15, p. 236, issn: 1471-2164, 2014. Qualis: A2
68. MELLO, TATHYANA R. P. ; ALEIXO, ALINE C. ; Pinheiro, Daniel G. ; NUNES, FRANCIS M. F. ; BITONDI, MÃ¡RCIA M. G. ; Hartfelder, Klaus ; BARCHUK, ANGEL R. ; SIMÃµES, ZILÃ¡ L. P.. Developmental regulation of ecdysone receptor (EcR) and EcR-controlled gene expression during pharate-adult development of honeybees (Apis mellifera). Frontiers in Genetics. v. 5, p. 445, issn: 1664-8021, 2014. Qualis: A2
Livros publicados/organizados ou edições (0)
Capítulos de livros publicados (3)
1. FUNNICELLI, M. I. G. ; CARVALHO, L. A. L. ; FERRAO, C. D. N. ; CABRERA, J. M. ; PINHEIRO, D. G.. Metataxonômica: análise de diversidade taxonômica de microbiomas. Em: VARANI, A. M.; RODRIGUES, J. D. B.. (Org.). Tópicos Especiais em Genética Aplicada. 1ed.Jaboticabal. : Funep. 2023.v. 8, p. 33-53.
2. CARVALHO, L. A. L. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; DIBELLI, S. C. ; PINHEIRO, D. G.. Metataxonômica: Análise de diversidade taxonômica de microbiomas. Em: RODRIGUES, J. D. B.; MOREIRA, R. O.; DE-SOUZA, J. A. M.; DESIDÉRIO, J. A.. (Org.). Tópicos Especiais em Genética Aplicada. 1ed.Jaboticabal/SP. : Funep. 2022.v. 7, p. 7-13.
3. OMORI, W. P. ; SIERRA, L. G. T. ; PINHEIRO, D. G. ; MIRANDA, V. F. O. ; SOUZA, J. A. M.. Minireview sobre abordagens, métodos e conceitos para análise de um microbioma. Em: Janete Apparecida Desidério (Coordenador); Carla Resende Bastos (Coordenador); Maria Laura Viola Augusto (Coordenador); Nestor Darío Franco (Autor); Paula Castanho Borges (Autor). (Org.). Tópicos especiais em genética aplicada. 1ed.Jaboticabal/SP. : Funep. 2017.v. 4, p. 122-129.
Textos em jornais de notícias/revistas (0)
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (1)
1. CANCELADO, S. V. ; CEPEDA, J. C. C. ; PINHEIRO, D. G. ; ALVES, L. M. C.. Identificação de Genes Bacterianos Produtores de Fenazinas em Solos Suplementados com Adubo Orgânico. Em: I Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, 2016, Jaboticabal. Revista Ciência & Tecnologia. Jaboticabal/SP: Fatec - Faculdade de Tecnologia de Jaboticabal, v. 8, 2016. Qualis: Não identificado (I CONGRESSO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA AGROPECUÁRIA, AGRÍCOLA E AMBIENTAL, 2016, JABOTICABAL. REVISTA CIÊNCIA & TECNOLOGIA. JABOTICABAL/SP: FATEC - FACULDADE DE TECNOLOGIA DE JABOTICABAL)
Resumos publicados em anais de congressos (33)
1. BUZO, F. S. ; CARVALHO, L. A. L. ; GARE, L. M. ; GARCIA, N. F. S. ; PINHEIRO, D.G. ; RIGOBELO, E. C. ; ARF, O. ; NOGALES, A.. Impact of Rhizophagus clarus and Plant Growth-Promoting Bacteria inoculation on the arbuscular mycorrhizal fungal community of bean roots in Brazil. Em: 12th International Conference on Mycorriza, 2024, Manchester, UK. 12th International Conference on Mycorriza, 2024.
2. FERRAO, C. D. N. ; CARVALHO, L. A. L. ; CAMPANARI, M. F. Z. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; TEHERAN-SIERRA, LUIS GUILLERMO ; PINHEIRO, D. G.. Metagenomics unveils shifts on microbial assemblages on sugarcane rhizospheres under contrasting farming systems. Em: V Simpósio de Microbiologia Agrícola (SMAGRO): Aplicações e perspectivas para a agricultura do futuro, 2023, Piracicaba/SP. V Simpósio de Microbiologia Agrícola, 2023.
3. DIBELLI, S. C. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; CARVALHO, L. A. L. ; SIERRA, L. G. T. ; PINHEIRO, D. G.. Evidence Of Multiple Plant Growth-Promoting Traits Of Isolates From Sugarcane Associated Bacterial Communities. Em: V Simpósio de Microbiologia Agrícola (SMAGRO), 2023, Piracicaba/SP. V Simpósio de Microbiologia Agrícola, 2023.
4. FUNNICELLI, M. I. G. ; CARVALHO, L. A. L. ; SIERRA, L. G. T. ; DIBELLI, S. C. ; LEMOS, E. G. M. ; PINHEIRO, D. G.. Unveiling genomic features linked to traits of plant-growth-promoting bacterial communities from sugarcane. Em: International Symbosium on Agricultural Microbiology, 2022, Lavras/MG. Annals of International Symbosium on Agricultural Microbiology 2022, 2022.
5. SANTOS, B. D. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; PINHEIRO, D. G.. Investigação de uma putativa nova espécie do gênero Labrys como promotora de crescimento em planta. Em: XXXIV Congresso de Iniciação Científica da Unesp, 2022, Jaboticabal/SP. 1ª Fase do XXXIV Congresso de Iniciação Científica da Unesp, 2022.
6. BIASI, J. S. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; PINHEIRO, D. G.. Modulação da expressão gênica emu ma comunidade de bactérias em resposta aos metais cobre e cromo. Em: XXXIV Congresso de Iniciação Científica da Unesp, 2022, Jaboticabal/SP. 1ª Fase do XXXIV Congresso de Iniciação Científica da Unesp, 2022.
7. SILVA, S. R. ; ARANGUREN, Y. ; Varani, Alessandro M. ; JAN P'ACHNO, BARTOSZ ; PINHEIRO, D. G. ; SIERRA, E. M. ; MATOS, R. G. ; MICHAEL, T. P. ; MIRANDA, V. F. O.. Phylogenomics of Utricularia (sect. Utricularia: Lentibulariaceae): a possible tale of reticulation of a complex carnivorous plant group. Em: 67th Brazilian Congress of Genetics, 2022, Natal/RN. 67th Brazilian Congress of Genetics, 2022.
8. SOUZA CARDOSO, JESSICA LUANA ; CARVALHO, L. A. L. ; PINHEIRO, D. G. ; CARNEIRO VIEIRA, MARIA LUCIA. de novo transcriptome assembly, functional annotation and expression profiling in passion fruit infected with Xanthomonas axonopodis. Em: International Plant & Animal Genome Conference XXIX, 2022, San Diego/CA. International Plant & Animal Genome Conference XXIX, p. 174, 2022.
9. SILVA, SAURA R. ; MIRANDA, V. F. O. ; PINHEIRO, D. G. ; MICHAEL, TODD P. ; M. VARANI, ALESSANDRO. Evolution of expansin gene family in carnivorous plants Genlisea and Utricularia. Em: 66º Congresso Brasileiro de Genética, 2021, Online. 66º Congresso Brasileiro de Genética, v. 1, p. 481, 2021.
10. CARVALHO, B. B. ; TULINI, F. L. ; CARVALHO, L. A. L. ; VANTINI, J. S. ; GIMENEZ, D. J. ; PINHEIRO, D. G. ; FERRO, M. I. T.. Identification of candidate SNPs related to water stress tolerance in sugarcane. Em: 11th Brazilian Congress of Plant Breeding, 2021, Online. 11th Brazilian Congress of Plant Breeding, 2021.
11. FREITAS, F. C. P. ; LOURENCO, A. P. ; PINHEIRO, D. G. ; NUNES, F. M. F. ; BITONDI, MÁRCIA MARIA GENTILE ; SIMOES, Z. L. P. ; BARCHUK, A. R. ; Hartfelder, Klaus ; PASCHOAL, A. R.. The nuclear and mitochondrial genomes of Frieseomelitta varia ? a highly eusocial stingless bee (Meliponini) with a permanently sterile worker caste. Em: XMeeting eXperience 2020, 2020. Proceedings X-Meeting eXperience 2020, v. 1, 2020.
12. FONTES, A. M. ; Dias-Neto, Emmanuel ; PINHEIRO, D.G. ; GASPAR, G. G. ; SILVEIRA, V. S. ; MARTINEZ-ROSSI, N. M. ; SILVA JUNIOR, W. A. ; BOLLELA, V. R.. Aprendizagem baseada em projetos: ensinar e formar pela pesquisa. Em: 5º Congresso de Graduação da USP, 2019, Ribeirão Preto. I Congresso de Graduação 2015, 2019.
13. AQUINO, A. L. R. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; PINHEIRO, D. G.. Prospecção in silico de genes envolvidos na degradação de HPAs em solo contaminado. Em: XXXI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2019, Jaboticabal-SP. XXXI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2019.
14. NEME, C. E. M. ; CASTRO, B. G. ; TAHYRA, A. S. C. ; FREDI, B. M. ; NAPPI, C. R. ; MASCARELLI, D. E. ; SANTOS, D. ; OLIVEIRA, F. S. ; FREIRE, F. P. ; BALLESTERO, G. ; LIMA, J. B. M. ; BOLSONI, J. A. ; GEBENLIAN, J. L. ; BIBO, N. L. ; SILVA, N. S. ; SANTOS, N. C. ; ALCANTARA, Q. A. ; ZUCHERATO, V. S. ; GASPAR, G. G. ; PINHEIRO, D. G. ; et.al. The microbial diversity among internal and external hospital environments: What?s our role?. Em: XXII International Congress of Genetics, 2018, Foz do Iguaçu/PR. Annals of XXII International Congress of Genetics, 2018.
15. SIERRA, L. G. T. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; CAMPANARI, M. F. Z. ; SILVA, R. C. ; SOARES, M. A. ; PINHEIRO, D. G.. Análisis metagenómico y bioprospección de comunidades microbianas asociadas a caña de azúcar en condiciones de cultivo convencional y orgánico. Em: III Congreso Colombiano de Bioquímica y Biología Molecular, 2018, Bogotá, Colombia. Memorias Tercer Congreso Colombiano de Bioquímica y Biología Molecular, p. 311, 2018.
16. SIERRA, L. G. T. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; CAMPANARI, M. F. Z. ; SILVA, R. C. ; SOARES, M. A. ; FERRO, M. I. T. ; PINHEIRO, D. G.. Perfil metagenômico de comunidades endofíticas e epifíticas associadas à cana-de-açúcar e prospecção de microrganismos promotores de crescimento em plantas. Em: XII Fórum de Microbiologia da UNESP, 2018, Jaboticabal. XII Fórum de Microbiologia da UNESP, 2018.
17. SIERRA, L. G. T. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; FERRO, M. I. T. ; SOARES, M. A. ; PINHEIRO, D. G.. Constructing a library of bacteria and yeast communities from organic and conventional sugarcane. Em: II Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, 2018, Viçosa. Anais do II Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, p. 185, 2018.
18. CAMPANARI, M. F. Z. ; SILVA, R. C. ; SIERRA, L. G. T. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; PINHEIRO, D. G.. Análise exploratória das comunidades microbianas da rizosfera da cana-de-açúcar em manejo orgânico. Em: XII Fórum de Microbiologia Agropecuária da UNESP, 2018, Jaboticabal. XII Fórum de Microbiologia Agropecuária da UNESP, 2018.
19. PINHEIRO, D. G.; SILVA, S. R. ; MENEZES, C. G. ; PENHA, H. A. ; SOUZA, J. A. M. ; DESIDERIO, J. A. ; CARVALHO, R. F. ; VARANI, A. M. ; MIRANDA, V. F. O.. de novo transcriptome assembly and gene expression for anthocyanin pathway in Utricularia flower variants. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.
20. DEPINTOR, T. S. ; FREITAS, F. C. P. ; LOPES, T. F. ; PINHEIRO, D. G. ; BITONDI, M. M. G. ; SIMOES, Z. L. P.. In silico analyses of miRNA-mRNA interactions during development of the honeybee, Apis mellifera. Em: 62º Congresso Brasileiro de Genética, 2016, Caxambu/MG. 62º Congresso Brasileiro de Genética, 2016.
21. SILVA, S. R. ; ARANGUREN, Y. ; PENHA, H. A. ; PINHEIRO, D. G. ; FERNANDES, CAMILA C. ; MORAES, A. P. ; DE MIRANDA, VITOR FERNANDES O. ; MICHAEL, T. P. ; VARANI, A. M.. Unraveling the genome sequence of the Utricularia reniformis a.st.-hil. (Lentibulariaceae): insights into the evolution of a terrestrial carnivorous plant. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.
22. MARTINS, J. R. ; PINHEIRO, D. G. ; AHMED, A. C. ; ROBINSON, G. E. ; MIZZEN, C. ; BITONDI, M. M. G.. Genome-wide analysis of Hex 110 and Hex 70a binding sites in the fat body of adult honey bee workers. Em: XI Encontro sobre Abelhas, 2015, Ribeirão Preto-SP. XI Encontro sobre Abelhas, 2015.
23. CACHETA, A. K. S. ; OMORI, W. P. ; FERNANDES, C. C. ; LEMOS, E. G. M. ; PINHEIRO, D. G.. Análise metagenômica de solos no quadrilátero ferrífero. Em: XXVII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2015, Jaboticabal-SP. XXVII Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2015.
24. SILVA, S. R. ; MIRANDA, V. F. O. ; MICHAEL, T. P. ; PINHEIRO, D. G.. Long non-coding RNAs in carnivorous plants: predicting lncRNAs in family Lentibulariaceae. Em: 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015, São Paulo-SP. 11th International Conference of the AB3C + Brazilian Symposium of Bioinformatics, 2015.
25. LOPES, E. M. ; CASTELLANE, T. C. L. ; LIMA, M. T. ; OMORI, W. P. ; KISHI, L. T. ; PINHEIRO, D. G. ; SOUZA, J. A. M. ; LEMOS, E. G. M.. Estrutura metabólica de comunidades bacterianas em solo de cinco biomas do centro de biodiversidade (CEBIO). Em: I Workshop de Bioenergia - UNESP, 2015, Jaboticabal-SP. Workshop de Bioenergia - UNESP, 2015.
26. DONADI, E. A. ; MASSARO, J. D. ; POLLI, C. D. ; FOSS, M. C. ; FOSS-FREITAS, M. C. ; PASSOS, G. A. ; SAKAMOTO-HOJO, E. T. ; MIRANDA, W. R. H. ; ALVES, C. C. ; ALONSO, M. L. S. ; RASSI, D. M. ; EVANGELISTA, A. F. ; PINHEIRO, D. G. ; DONADI, E. A.. Post-transcriptional markers targeting HLA genes in type 1 diabetes mellitus (T1D) patients exhibiting or not exhibiting clinical complications. Em: European Federation for Immunogenetics Conference, 2015, Genebra. Tissue Antigens. Nova Iorque: Wiley-Blackwell, v. 85, p. 33-33, 2015.
27. SANTOS, S. P. ; PINHEIRO, D. G. ; SIMOES, A. L.. Sequencing of complete human mtDNA improves population genetic study. Em: 61º Congresso Brasileiro de Genética, 2015, Águas de Lindóia/SP. 61º Congresso Brasileiro de Genética, 2015.
28. SOARES, MICHELLE PM ; PINHEIRO, D. G. ; LOPES, T. F. ; LAURE, M. A. F. B. ; SIMOES, Z. L. P. ; BITONDI, M. M. G.. High-throughput mRNA sequencing analysis of the metamorphosis in Apis melífera workers. Em: 61º Congresso Brasileiro de Genética, 2015, Águas de Lindóia/SP. 61º Congresso Brasileiro de Genética, 2015.
29. SOARES, M. P. M. ; PINHEIRO, D. G. ; LOPES, T. F. ; LAURE, M. A. F. B. ; SIMOES, Z. L. P. ; BITONDI, M. M. G.. Next-generation mRNA sequencing for high-throughput analysis of the metamorphosis in Apis mellifera workers. Em: Biology and Genomics of Social Insects, 2015, New York/NY/USA. Biology and Genomics of Social Insects, 2015.
30. MARTELLI, F. S. ; LOPES, T. F. ; PINHEIRO, D. G. ; SIMOES, Z. L. P. ; NUNES, F. M. F.. Nutrition and aging: lessons from Apis mellifera, an idiosyncratic model. Em: 60º Congresso Brasileiro de Genética, 2014, Guarujá/SP. 60º Congresso Brasileiro de Genética, 2014.
31. FELIPE, J. C. ; PINHEIRO, D. G. ; SIMOES, Z. L. P. ; NUNES, F. M. F.. Identificação de marcadores de envelhecimento em abelhas. Em: II Workshop sobre Insetos Sociais, 2014, Ribeirão Preto. Livro de Resumos do II Workshop sobre Insetos Sociais, 2014.
32. BELESINI, A. A. ; TELLES, B. R. ; PINHEIRO, D. G. ; GIACHETTO, P. F. ; CAVALLARI, S. D. C. ; CAZETTA, J. O. ; FERRO, M. I. T.. Sequenciamento e análise de genótipos de cana-de-açúcar submetidas à prolongada limitação hídrica. Em: XVII Simpósio de Genética, 2014, São José do Rio Preto. Anais Eletrônicos do XVII Simpósio de Genética, 2014.
33. TELLES, B. R. ; FERRO, M. I. T. ; BELESINI, A. A. ; PINHEIRO, D. G. ; CAVALLARI, S. D. C.. Sequenciamento de genótipos de cana-de-açúcar submetidos ao estresse hídrico prolongado. Em: XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014, JABOTICABAL-SP. XXVI Congresso de Iniciação Científica da UNESP, 2014.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (4)
1. PINHEIRO, D. G. Abordagens metagenômicas: Desvendando a biodiversidade invisível. 2023. Apresentação de Trabalho/Outra
2. SANTOS, S. P. ; PINHEIRO, D. G. ; SIMOES, A. L.. Identificação de linhagens de mtDNA por sequenciamento completo em população brasileira. 2014. Apresentação de Trabalho/Outra
3. TELLES, B. R. ; FERRO, M. I. T. ; BELESINI, A. A. ; PINHEIRO, D. G. ; CAVALLARI, S. D. C.. Sequenciamento de genótipos de cana-de-açúcar submetidos ao estresse hídrico prolongado. 2014. Apresentação de Trabalho/Congresso
4. PINHEIRO, D. G. Análise de perfis transcricionais no processo de ativação dos ovários em abelhas Apis mellifera. 2014. Apresentação de Trabalho/Seminário
Demais tipos de produção bibliográfica (3)
1. SANTOS-SILVA, L. ; ROQUE, W. F. ; MOURA, J. M. ; MELLO, I. S. ; CARVALHO, L. A. L. ; PINHEIRO, D. G. ; BOUZAN, R. S. ; ANDRADE, R. L. T. ; DA SILVA, GILVAN FERREIRA ; BATTIROLA, L. D. ; SOARES, M. A.. Toxic Metals in Amazonian Soil Modify the Bacterial Community Associated with Diplopoda. Amsterdam: SSRN-Elsevier. 2024. Preprint
2. CAMARGO, A. F. ; SAARI, S. ; GARCIA, G. S. ; CHIODA, M. M. ; OTHONICAR, M. F. ; MARTINS, A. A. ; HAYASHI, G. ; HOEVE, J. T. ; JACOBS, H. T. ; PINHEIRO, D. G. ; DUFOUR, E. ; OLIVEIRA, MARCOS T.. Systemic impact of the expression of the mitochondrial alternative oxidase on Drosophila development. Cold Spring Harbor Laboratory: bioRxiv. 2021. Preprint
3. LOPES, T. F. ; PINHEIRO, D. G. ; FERREIRA-CALIMAN, MARIA JULIANA ; TURATTI, IZABEL C. C. ; ABREU, FABIANO C. P. ; GALASCHI-TEIXEIRA, JULIANA S. ; MARTINS, JULIANA R. ; ELIAS-NETO, MOYSÉS ; SOARES, MICHELLE P. M. ; LAURE, MARCELA B. ; FIGUEIREDO, VERA L. C. ; LOPES, NORBERTO PEPORINE ; SIMOES, Z. L. P. ; GARÓFALO, CARLOS A. ; BITONDI, MÁRCIA M. G.. Exploring integument transcriptomes, cuticle ultrastructure, and cuticular hydrocarbons profiles in eusocial and solitary bee species displaying heterochronic adult cuticle maturation. Cold Spring Harbor Laboratory: bioRxiv. 2018. Preprint

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (8)
1. PINHEIRO, D. G. bioinfoutilities: Scripts utilitários para o processamento de dados biológicos. 2017.
2. PINHEIRO, D. G. cuffpipe.sh: Processamento automatizado de dados de RNA-Seq (Paired-End e Single-End). 2017.
3. PINHEIRO, D. G. pipe_wgs_preproc.sh*, pipe_wgs_asm.sh* e pipe_wgs_map.sh*: Processamento automatizado para montagem e anotação de dados de Whole Genome Sequences (WGS) a partir de amostras metagenômicas [* Nomes provisórios]. 2016.
4. PINHEIRO, D. G. cuffpipePE.sh* e cuffpipeSE.sh*: Processamento automatizado de dados de RNA-Seq (Paired-End e Single-End) [* Nomes provisórios]. 2015.
5. PINHEIRO, D. G. smallRNAspipe.sh* - Processamento de dados de small RNA-Seq [* Nome provisório]. 2015.
6. PINHEIRO, D. G.; ARAUJO, W. L. ; VERDI, M. C. Q. ; MUI, T. S.. A influência dos microbiomas no desenvolvimento, adaptabilidade e saúde das plantas. 2023. (Programa de rádio ou TV/Mesa. 2023.
7. ALVES, L. M. C. ; SALES, C. R. ; SOUZA, J. A. M. ; LEMOS, E. G. M. ; VARANI, A. M. ; ZIED, D. C. ; OLIVEIRA, R. A. ; SARAN, L. M. ; ANDRE, M. R. ; FERRO, J. A. ; DUDA, R. M. ; RIGOBELO, E. C. ; PINHEIRO, D. G.. Pós-Graduação em Microbiologia Agropecuária (UNESP). 2023. (Programa de rádio ou. 2023.
8. PINHEIRO, D. G. BioInfoDB: A repository of notes and experiences in Bioinformatics and Computational Biology. 2015; Tema: Anotações úteis relacionadas aos temas: administração de sistemas linux, Bioinformática e Biologia Molecular. 2015.
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (0)
Demais tipos de produção técnica (19)
1. CARVALHO, L. A. L. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; CABRERA, J. M. ; FERRAO, C. D. N. ; PINHEIRO, D. G.. Bioinformática aplicada ao estudo de microbiomas. 0. XVII Curso de Verão em Genética
2. CARVALHO, L. A. L. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; DIBELLI, S. C. ; PINHEIRO, D. G.. Bioinformática aplicada ao estudo de microbiomas. 0. I Escola de Verão em Microbiologia Agropecuária
3. FUNNICELLI, M. I. G. ; CARVALHO, L. A. L. ; FERRAO, C. D. N. ; CABRERA, J. M. ; PINHEIRO, D. G.. Minicurso no XVII Curso de Inverno em Genética: Bioinformática aplicada ao estudo de microbiomas. 2023. 2023.
4. CARVALHO, L. A. L. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; PINHEIRO, D. G.. Minicurso na I Escola de Verão em Microbiologia Agropecuária: Bioinformática aplicada a estudos de microbiomas. 2023. 2023.
5. FUNNICELLI, M. I. G. ; CARVALHO, L. A. L. ; FERRAO, C. D. N. ; CABRERA, J. M. ; PINHEIRO, D. G.. Apostila do minicurso Bioinformática aplicada ao estudo de microbiomas. 2023. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - apostila
6. CARVALHO, L. A. L. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; DIBELLI, S. C. ; PINHEIRO, D. G.. Bioinformática aplicada ao estudo de microbiomas. 0. XVI Curso de Verão em Genética
7. PINHEIRO, D. G. Tarde de palestras sobre inovação e empreendedorismo. 2022. Curso de curta duração ministrado/Outra
8. CARVALHO, L. A. L. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; DIBELLI, S. C. ; PINHEIRO, D. G.. Apostila do minicurso Bioinformática aplicada ao estudo de microbiomas. 2022. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - apostila
9. SOARES, M. A. ; PINHEIRO, D. G.. Tópicos especiais em Biotecnologia: montagem e anotação de genoma. 2019. Curso de curta duração ministrado/Outra
10. PINHEIRO, D. G. Tutorial para Montagem, Avaliação e Anotação de Genomas. 2019. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Tutorial
11. PINHEIRO, D. G. Tutorial para Análise de Transcriptomas. 2019. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Tutorial
12. AQUINO, A. L. R. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; PINHEIRO, D. G.. Prospecção in silico de genes envolvidos na degradação de HPAs em solo contaminado. 2019. Relatório de pesquisa
13. PINHEIRO, D. G. Montagem de novo de transcriptomas a partir de dados de sequências de cDNA. 2017. Curso de curta duração ministrado/Outra
14. PINHEIRO, D. G. II Curso de Verão em Bioinformática: Metagenômica: da aquisição à mineração de dados. 2017. Curso de curta duração ministrado/Extensão
15. PINHEIRO, D. G. Montagem de novo de transcriptomas a partir de dados de sequências de cDNA. 2016. Curso de curta duração ministrado/Outra
16. PINHEIRO, D. G. I Curso de Verão em Bioinformática: Metagenômica: conceitos e aplicações. 2016. Curso de curta duração ministrado/Extensão
17. PINHEIRO, D. G. Montagem de novo de transcriptomas a partir de dados de sequências de cDNA. 2015. Curso de curta duração ministrado/Outra
18. PINHEIRO, D. G. Montagem de transcriptomas a partir de dados de sequências de cDNA. 2014. Curso de curta duração ministrado/Outra
19. PINHEIRO, D. G.; SIMOES, Z. L. P.. Relatório Científico do Projeto: Abordagem integrativa in silico na análise causal do desenvolvimento de Apis mellifera. 2014. Relatório de pesquisa

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (2)
1. Gabriella Linhares de Andrade. Microbiota associada aos solos em Sistemas de Integração Lavoura Pecuária Floresta na região nordeste do Brasil. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2024.
  Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
2. Lucas Amoroso Lopes de Carvalho. Dinâmica temporal da composição e expressão gênica do microbioma de um consórcio degradador de biomassa lignocelulósica em diferentes estágios de adaptação. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
  Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Dissertação de mestrado (3)
1. Andrea Cecilia Romero Coronado. Influência de extratos de microalgas verdes no microbioma do solo e seu impacto no desenvolvimento de plantas. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . Início: 2024.
  Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
2. Felipe Casaletti Teixeira. Investigação dos efeitos na microbiota do solo observados em resposta ao tratamento com biocarvão ou plahada. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . Início: 2024.
  Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
3. Carlos Daniel Nazareno Ferrão. Aplicação de extratos de cianobactéria como biofertilizante na microbiota associada às plantas. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2023.
  Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (2)
1. Giovanna Santos Rodrigues Silva. Identificação molecular de microalga clorofícea e seu efeito na promoção do crescimento de plantas. Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2024.
  Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
2. Julia Araujo Tomazeli. Potencial de Serratia surfactantfaciens no controle biológico de fungos fitopatógenos e promoção do crescimento de plantas. Iniciação científica (Graduando em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. Início: 2024.
  Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (1)
1. Marcos Antônio Soares. . Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2018.
  Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Tese de doutorado (7)

Michelli Inácio Gonçalves Funnicelli. Traços genômicos característicos de gêneros bacterianos associados à cana-de-açúcar. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2023.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Fabio de Azevedo Silva. Impacto da introdução de Trichoderma spp. como agente de biocontrole na comunidade de fungos edáficos. Tese (Doutorado em Ecologia e Conservação da Biodiversidade) - Universidade Federal de Mato Grosso, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2021.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Daiane Silva Bonaldi. Genômica aplicada à predição dos mecanismos moleculares de resistência a metais potencialmente tóxicos e promoção de crescimento vegetal em Rhizobium sp. LBMP-C04. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2021.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Luis Guillermo Teheran Sierra. Comunidades de bactérias endofíticas e epifíticas associadas à cana-de-açúcar e prospecção de promotores de crescimento em plantas. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Centro de Estudios Interdisciplinarios Básicos y Aplicados. 2020.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Danielly Beraldo dos Santos Silva. Expressão diferencial de genes relacionados com características de carcaça e carne em bovinos da raça Nelore. Tese (Doutorado em Genética e Melhoramento Animal) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2019.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Wellington Pine Omori. Composição funcional e taxonômica de enzimas carbohidrases que atuam na desconstrução da lignocelulose de torta de filtro. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2018.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Sonia Villamizar Cancelado. Metagenoma para prospecção de enzimas e produtos de interesse no biocontrole de fitopatogenos. Tese (Doutorado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2017.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Dissertação de mestrado (9)

Sabrina Custódio Dibelli. Evidenciação de múltiplos traços de promoção de crescimento vegetal em isolados de comunidades bacterianas associadas a cana-de-açúcar. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2023.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Ana Paula Corrêa Moneda. Análise metataxonômica de comunidades microbianas da rizosfera de cana-de-açúcar em cultivo orgânico e convencional. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2022.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Rafael Correia da Silva. Acesso ao microbioma de cana-de-açúcar por análise de seu transcriptoma e possíveis fatores moduladores. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Lucas Amoroso Lopes de Carvalho. Investigação sobre o efeito do Sistema de Cultivo na Composição da Microbiota da Cana-de-Açúcar. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Francini Ludmila Tulini. Identificação de SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) na região codificadora entre duas cultivares de cana-de-açúcar contrastantes submetidas à prolongada limitação hídrica. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Jonatham Hercules da Silva Maciel. Influência do mercúrio na dinâmica de bactérias rizosféricas e endofíticas revelada por metabarcoding. Dissertação (Mestrado em Ecologia e Conservação da Biodiversidade) - Universidade Federal de Mato Grosso, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Daniela Konrad. Dinâmica do perfil transcricional de duas cultivares de cana-de-açúcar contrastantes à seca e submetidas ao déficit hídrico prolongado. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2019.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Maria Fernanda Zaneli Campanari. Acessando o microbioma da rizosfera da cana-de-açúcar em cultivo orgânico comparado ao convencional. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Agropecuária) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2019.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Aline Andrucioli Belesini. Análise do transcriptoma de folhas de cana-de-açúcar submetidas à prolongada limitação hídrica usando RNA-Seq. Dissertação (Mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2015.
Supervisor: Daniel Guariz Pinheiro.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (2)

Julia Sandrini de Biasi. Modulação da expressão gênica em uma comunidade de bactérias em resposta aos metais cobre e cromo. (Graduação em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2022.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
André Luís Rodrigues de Aquino. Prospecção in silico de genes envolvidos na degradação de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos em sedimento. (Graduação em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, . 2021.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Iniciação científica (4)

Bianca Dias dos Santos. Investigação de uma putativa nova espécie do gênero Labrys como promotora de crescimento em plantas. (Graduando em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2022.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Julia Sandrini de Biasi. Modulação da expressão gênica em uma comunidade de bactérias em resposta aos metais Cobre e Cromo. (Graduando em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2022.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
André Luís Rodrigues de Aquino. Prospecção in silico de genes envolvidos na degradação de HPAs em solo contaminado. (Graduando em Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2019.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Ana Katariny de Souza Cacheta. Análise metagenômica de solos no entorno de áreas de mineração desativada. (Graduando em Informática Biomédica) - Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto (USP), Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Orientações de outra natureza (2)

Julia Sandrini De Biasi. Treinamento em Bioinformática aplicada à Genômica e Transcriptômica. (Ciências Biológicas) - Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias, . 2021.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.
Rafael Correia da Silva. Estágio supervisionado no Laboratório de Bioinformática: Análise de interações entre microrganismos e plantas. (Biotecnologia) - Universidade Federal da Grande Dourados, . 2019.
Orientador: Daniel Guariz Pinheiro.

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (19)

2023-Atual. Centro de Pesquisa em Biodiversidade e Mudanças do Clima
Descrição: Este é um Centro único e inovador que reúne especialistas em ciência, difusão e inovação para produzir pesquisas e soluções de classe global e de ponta visando a atual perda de biodiversidade, seu sinergismo com as mudanças climáticas e suas consequências para o bem-estar humano. Alinhado aos Objetivos de Desenvolvimento Sustentável das Nações Unidas (ODS), a missão deste CEPID é a criação de um observatório de pesquisa em biodiversidade e mudanças climáticas, promovendo a inovação com foco em soluções baseadas na natureza e acelerando a difusão.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Alessandro de Mello Varani - Integrante / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Integrante / Todd P Michael - Integrante / Ana Paula de Moraes - Integrante / Mauricio Bacci Junior - Integrante / Douglas Silva Domingues - Integrante / Fábio Pinheiro - Integrante / Leonor Patricia Cerdeira Morellato - Coordenador / Célio Fernando Baptista Haddad - Integrante / Mauro Galetti Rodrigues - Integrante / Milton Cezar Ribeiro - Integrante / Clarisse Palma da Silva - Integrante / Leonardo Fernandes Fraceto - Integrante / Newton La Scala Júnior - Integrante / Cyntia Peralta de Almeida Prado - Integrante / Rouverson Pereira da Silva - Integrante / Alfredo Huete - Integrante / Ana Carolina Oliveira de Queiroz Carnaval - Integrante / André Luiz Martinez de Oliveira - Integrante / Antonio Maria Garcia Tommaselli - Integrante / André Rodrigues - Integrante / Antonio Leão Castilho - Integrante / Bartosz Jan Plachno - Integrante / Boris Leonardo Blotto Acuña - Integrante / Bruna de Costa Alberton - Integrante / Carlos Guilherme Becker - Integrante / Casey Ryan - Integrante / Claudette Marta Hahn - Integrante / Clinton N. Jenkins - Integrante / Claudio José Von Zuben - Integrante / Cláudia Pio Ferreira - Integrante / Ellen G. Denny - Integrante / Elza Maria Guimarães Santos - Integrante / Felipe Wanderley de Amorim - Integrante / Fernando Augusto de Oliveira e Silveira - Integrante / Geraldo Wilson Fernandes - Integrante / Guilherme Wolf Bueno - Integrante / Halley Caixeta de Oliveira - Integrante / Jens Christian Svenning - Integrante / Jin Wu - Integrante / Juan Arroyo - Integrante / Julián Faivovich - Integrante / Kelly Raquel Zamudio - Integrante / Kyle Graham Dexter - Integrante / Laurence Marianne Vincianne Culot - Integrante / Levi Pompermayer Machado - Integrante / Lilian Patricia Sales Macedo - Integrante / Luciana Bolsoni Lourenço - Integrante / Magna Soelma Beserra de Moura - Integrante / Márcio Silva Araújo - Integrante / Marco Aurelio Pizo Ferreira - Integrante / Maria de Lourdes Bueno Trindade Galo - Integrante / Mariana Lúcio Lyra - Integrante / Marina Corrêa Côrtes - Integrante / Marta Pereira Llopart - Integrante / Mathew Williams - Integrante / Mathias Mistretta Pires - Integrante / Montserrat Arista Palmero - Integrante / Pablo Forlan Vargas - Integrante / Patrícia Pasquali Parise Maltempi - Integrante / Paulo Roberto Guimarães Junior - Integrante / Pedro Jordano - Integrante / Pedro Luis Ortiz Ballesteros - Integrante / Qiaoyun Xie - Integrante / Rafael Barreiro Chaves - Integrante / Renata de Lima - Integrante / Ricardo da Silva Torres - Integrante / Rodolfo Luiz Bezerra Nóbrega - Integrante / Rosane Garcia Collevatti - Integrante / Tadeu de Siqueira Barros - Integrante / Tatiana Garabini Cornelissen - Integrante / Wesley Francisco Dáttilo da Cruz - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2023-Atual. Caracterização da microbiota oral e intestinal em pacientes submetidos ao transplante alogênico e com Doença do Enxerto contra o Hospedeiro aguda
Descrição: Este estudo multicêntrico, de coorte prospectivo, possui o objetivo de identificar as diferenças na composição e diversidade da microbiota oral e intestinal em pacientes submetidos ao alo-TMO e que desenvolvem a DECH e mucosite em relação àqueles que não desenvolvem. A intenção é a de encontrar marcadores de resposta clínica ao alo-TMO, possibilitando elaborar estratégias de avaliação e monitoramento pré e pós transplante e intervenções voltadas para a modulação da microbiota, almejando melhorar a resposta e os dados de morbi-mortalidade associados ao alo-TMO.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Gislane Lelis Vilela de Oliveira - Coordenador / Eduardo Antonio Donadi - Integrante / Alessio Fasano - Integrante / Maria Carolina de Oliveira Rodrigues - Integrante / Nelson Jen An Chao - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2023-Atual. Investigação da relação entre Bartonella spp. e artrópodes vetores por meio de técnicas omics e de cultivo em linhagens celulares de carrapatos
Descrição: Este estudo objetiva investigar a relação entre Bartonella e artrópodes (pulgas, carrapatos, piolhos e ácaros) por meio de abordagens independentes e dependendentes de cultivo em linhagens celulares de carrapatos, a fim de verificar o possível papel desses invertebrados na transmissão de Bartonella spp. De forma mais específica, o projeto em tela objetiva investigar os microbiomas e transcriptomas dos tratos digestivos dos artrópodes vetores de Bartonella em diferentes condições, além de investigar a competência vetorial na transmissão de B. henselae entre gatos e a capacidade de linhagens de células embrionárias de carrapatos na manutenção e propagação de B. henselae. A presente proposta contribuirá para o entendimento do possível papel de artrópodes na epidemiologia das bartoneloses no Brasil.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Marcos Rogério André - Coordenador / Darci Moraes Barros-Battesti - Integrante / Rosangela Zacarias Machado - Integrante / Fabio Barbour Scott - Integrante / Fernando de Castro Jacinavicius - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2022-Atual. Avaliação da resposta imune, metabólica e da quimiossensibilidade de frangos após alteração da microbiota in ovo
Descrição: No presente estudo serão avaliados os efeitos da inoculação com probiótico ou antibiótico no 16 dia de incubação, sobre o metabolismo, a quimiossensibilidade (resposta hipóxia e hipercapnia), a resposta imune ao desafio com lipopolissacarídeo (LPS) considerando o eixo microbiota-intestino-encéfalo, e microbiota de pintinhos juvenis. Para isto, ovos férteis de matrizes da linhagem Cobb, serão submetidos aos tratamentos. Após a eclosão, os pintinhos serão sexados e os seguintes parâmetros serão avaliados: eclodibilidade, ventilação, temperatura corporal; consumo de O2, desafio ao LPS-, e metagenômica da microbiota intestinal de pintinhos juvenis.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Marcos Macari - Coordenador / Luciane Helena Gargaglioni Batalhão - Integrante.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2022-Atual. Assinaturas moleculares -genômica, epigenômica e transcriptômica- e morfológicas da mudança de hospedeiros no besouro do feijão Zabrotes subfasciatus
Descrição: Os carunchos Bruchinae são os responsáveis pela perda de 20 do valor dos grãos de leguminosas. Porém, não são conhecidos os aspectos moleculares que governam a capacidade reprodutiva destes insetos, característica determinante para a infestação. Propomos avaliar as variações moleculares e morfológicas associadas com a mudança de hospedeiro de oviposição utilizando como modelo o caruncho do feijão, Zabrotes subfasciatus.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Francis de Morais Franco Nunes - Integrante / Lívia Maria Rosatto Moda - Integrante / Flávia Cristina de Paula Freitas - Integrante / Alexandre dos Santos Cristino - Integrante / Zilá Luz Paulino Simões - Integrante / Angel Roberto Barchuk - Coordenador / Juliana Ramos Martins - Integrante / Alexandre Rossi Paschoal - Integrante / Talita Sarah Mazzoni - Integrante / Gerardo Domingo Lucio Cervigni - Integrante / Isabel Ribeiro do Valle Teixeira - Integrante / Pedro Augusto da Pos Rodrigues - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2021-2023. Prospecção, manipulação e utilização de microrganismos para a geração de tecnologias e produtos para a agropecuária sustentável e a mitigação de impactos ambientais
Descrição: O projeto do Programa de Pós-Graduação em Microbiologia Agropecuária está alinhado aos objetivos de desenvolvimento sustentável da Organização das Nações Unidas (ONU). Ou seja, a exploração de fontes de energia e de matérias-primas renováveis, o aproveitamento de resíduos e subprodutos da agroindústria, a sanidade animal e à aplicação de microrganismos para a geração de tecnologias e produtos sustentáveis para a agropecuária e mitigação de impactos ambientais.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) . Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Jesus Aparecido Ferro - Integrante / Lúcia Maria Carareto Alves - Integrante / Luciana Maria Saran - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Integrante / Maria Inês Tiraboschi Ferro - Integrante / Camila Cesário Fernandes - Integrante / Roberto Alves de Oliveira - Coordenador / Rose Maria Duda - Integrante / Marita Vedovelli Cardozo - Integrante / Luis Guillermo Teheran Sierra - Integrante / Michelli Inácio Gonçalves Funnicelli - Integrante / João Carlos Campanharo - Integrante / Lucas Amoroso Lopes de Carvalho - Integrante / Márcia Justino Rossini Mutton - Integrante / Lidyane Aline de Freita - Integrante / Fernando Antonio de Ávila - Integrante / Milena Tavares Lima Constancio - Integrante / Sabrina Custódio Dibelli - Integrante / Bianca Dias dos Santos - Integrante / Julia Sandrini De Biasi - Integrante / Luan Affonso Motandon Pompeu - Integrante / Bruno Bachega - Integrante / Jorge Otávio Silva Nunes - Integrante / Michel Santi Caraça - Integrante / Wallynson Eduardo Silva Almeida - Integrante / Iashilei Cassieli Pasquini - Integrante / Luana Cristina Amista - Integrante / Felipe Pereira de Matos - Integrante / Vivian de Oliveira Lima - Integrante / Stella Rubin de Sousa - Integrante / Eliane Cristine Soares da Costa - Integrante / Agda Paula Facincani - Integrante / Valciney Gomes de Barros - Integrante / Daiane Silva Bonaldi - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2021-2022. Filogenômica de Utricularia (seção Utricularia: Lentibulariaceae): uma possível história de evolução reticulada e estado de conservação de um grupo de plantas carnívoras
Descrição: As espécies de plantas da seção Utricularia, que estão amplamente distribuídas pelo mundo, constituem um grupo controverso do ponto de vista taxonômico. Este estudo pretende a partir de dados genômicos, morfológicos e geográficos, avaliar hipóteses filogenéticas e filogeográficas com o objetivo de inferir as relações entre as espécies e populações e sua diversidade genética, o que poderá trazer subsídios para propostas de conservação.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Alessandro de Mello Varani - Integrante / Saura Rodrigues da Silva - Integrante / Vitor Fernandes Oliveira de Miranda - Coordenador / Yani Cristina Aranguren Díaz - Integrante / Elwi Guillermo Machado Sierra - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2021-2022. Avaliação do impacto do fogo sobre a biodiversidade e o solo, contribuições para o estabelecimento do Manejo Integrado do Fogo no Pantanal
Descrição: O estudo analisará a distribuição temporal das espécies identificadas por DNA ambiental de acordo com a época de ocorrência de fogo para compreender a dinâmica ocupacional da biodiversidade e orientar decisões de manejo do fogo, além de implementar o banco de metabarcodings de mamíferos, répteis, anfíbios, artrópodes do solo e microbiota edáfica para que futuras avaliações de impacto possam ser realizadas de forma rápida, objetiva e escalonada.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Marcos Antônio Soares - Integrante / Ricardo Lopes Tortorela de Andrade - Integrante / Leandro Denis Battirola - Coordenador / Catia Nunes da Cunha - Integrante / Eduardo Guimarães Couto - Integrante / Gustavo Manzon Nunes - Integrante / Christine Strüssmann - Integrante / Gabriela do Valle Alvarenga - Integrante / Eliana Celestino da Paixão Rodrigues dos Santos - Integrante / Carla Martins Lopes - Integrante / Joisiane Karoline Mendes Araujo - Integrante / Paulo André da Silva Barroso - Integrante / Marcos Antônio Camargo Ferreira - Integrante / Alexandre Ebert - Integrante / Christian Niel Berlinck - Integrante / Ronaldo Gonçalves Morato - Integrante / Luanne Helena Augusto Lima - Integrante / Gilvan Ferreira da Silva - Integrante / Bruno Henrique Saranholi - Integrante / James Moraes de Moura - Integrante / Fillipe Tamiozzo Pereira Torres - Integrante / Erica Cezarine de Arruda - Integrante / Tainã Rapp Py-Daniel - Integrante / Higo José Dalmagro - Integrante / Daniel Kumazawa Morais - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Mato Grosso - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2021-Atual. Bases moleculares da plasticidade de comportamento e das estratégias reprodutivas na evolução das histórias de vida em abelhas sem ferrão neotropicais (Meliponini)
Descrição: Considerando três espécies de abelhas neotropicais sem ferrão, que diferem nas características de biologia reprodutiva e agressividade das operárias, serão realizadas análises comparativas dos transcriptomas de três fases fundamentais do ciclo de vida adulta e de três tecidos com funções divergentes. O objetivo será incrementar o conhecimento acerca da evolução da socialidade em insetos e das bases moleculares de reconfiguração do balanço entre longevidade e reprodução.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Francis de Morais Franco Nunes - Integrante / Hartfelder, Klaus - Coordenador / Flávia Cristina de Paula Freitas - Integrante / Zilá Luz Paulino Simões - Integrante / Anete Pedro Lourenço - Integrante / Alexandre Rossi Paschoal - Integrante / Carolina Gonçalves Santos - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2020-2022. Caracterização de linhagens de células de carrapatos e sua utilização como substrato para o crescimento, manutenção e perfil de expressão proteica de Anaplasma marginale
Descrição: Esse estudo tem por objetivo caracterizar linhagens de células de carrapatos e utilizá-las como substrato para o crescimento, manutenção e obtenção do perfil de expressão proteica de Anaplasma marginale. No estudo serão utilizadas culturas primárias e linhagens estabelecidas de células de carrapatos provenientes de ovos de três espécies, infectadas ou não com A. marginale a fim de prospectar proteínas que poderão ser utilizadas como antígenos vacinais no futuro.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Tiago Santana Balbuena - Integrante / Marcos Rogério André - Integrante / Darci Moraes Barros-Battesti - Coordenador / Rosangela Zacarias Machado - Integrante / Diogo Cavalcanti Cabral de Mello - Integrante / Diva Denelle Spadacci Morena - Integrante / João Fabio Soares - Integrante / Pablo Henrique Nunes - Integrante / Maria Izabel Camargo-Mathias - Integrante / Luís Adriano Anholeto - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2018-Atual. Aspectos genéticos da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de carne em animais da raça Nelore
Descrição: O projeto visa criar um banco de dados de emissão de metano entérico e utilizar um conjunto de informações de características de eficiência alimentar, qualidade de carne e carcaça bem como de reprodução, para realizar estudos genômicos com base em sequência completa do DNA, visando desenvolver tecnologias que permitam o melhor conhecimento biológico e o melhoramento da qualidade, eficiência e sustentabilidade da produção de bovinos da raça Nelore.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Jesus Aparecido Ferro - Integrante / Henrique Nunes de Oliveira - Integrante / Humberto Tonhati - Integrante / Lúcia Galvão de Albuquerque - Coordenador / Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva - Integrante / Maria Eugênia Zerlotti Mercadante - Integrante / Roberto Carvalheiro - Integrante / Alexandre Berndt - Integrante / Ana Fabrícia Braga Magalhães - Integrante / Diercles Francisco Cardoso - Integrante / Gerardo Alves Fernandes Júnior - Integrante / Joslaine Noely dos Santos Gonçalves Cyrillo - Integrante / Larissa Fernanda Simielli Fonseca Noronha - Integrante / Roberta Carrilho Canesin - Integrante / Rosa Toyoko Shiraishi Frighetto - Integrante / Guilherme Jordão de Magalhães Rosa - Integrante / Luis Artur Loyola Chardulo - Integrante / Fernando Sebastián Baldi Rey - Integrante / Camila Urbano Braz - Integrante / Daiane Cristina Becker Scalez - Integrante / Rafael Espigolan - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2018-Atual. Sistema para processamento e exploração de dados de sequenciamento de genes inseridos em fagos que expressam peptídeos de interesse (phage-displayed peptide libraries)
Descrição: Desenvolvimento de um sistema computacional para realizar o processamento de dados de sequenciamento de genes em fagos que expressam peptídeos de interesse (phage-displayed peptide libraries), afim de explorar as funções desses peptídeos.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Coordenador / Sandra Helena Unêda-Trevisoli - Integrante / Lynnette Dirk - Integrante / Allan Bruce Downie - Integrante.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2017-2020. Perfis metagenômicos de comunidades microbianas associadas a cana-de-açúcar sob cultivo orgânico versus convencional e prospecção de microrganismos promotores de crescimento em plantas
Descrição: Nos últimos anos, a agricultura industrial de cana-de-açúcar tem sido caracterizada por uma intensificação do uso de insumos agrícolas e expansão da monocultura. Por outro lado, há um aumento da demanda por produtos naturais mais saudáveis e sustentáveis. Nesse sentido, o cultivo orgânico tem sido considerado. Contudo, para suprir a demanda esse agroecossistema deve ser também produtivo e isso requer a adoção de práticas de manejo adequadas e que devem ser aprimoradas com maior conhecimento dos processos biogeoquímicos. Dentro desses processos, os microrganismos são os protagonistas, atuando em especial no solo e em associação com as plantas. Dessa forma, propomos a utilização de sequenciamento de DNA de alto rendimento para o estudo das comunidades de microrganismos associados à cana-de-açúcar, a fim de avaliar a diversidade de microrganismos e a estruturação dessa colonização nos tecidos e na rizosfera de plantas sob dois modos de cultivo (orgânico x convencional). Serão sequenciados amplicons (16S e ITS) de amostras da superfície ou no interior das raízes, colmos e folhas. Os dados serão analisados via abordagem de identificação taxonômica e predição de perfis funcionais, necessárias para a avaliação de diversidade e redes de co-ocorrências das Unidades Taxonômicas Operacionais encontradas. Também será realizado sequenciamento dos metagenomas das rizosferas, os quais serão analisados via abordagem de montagem e anotação taxonômica e gênica funcional. Além disso, pretendemos prospectar microrganismos promotores de crescimento em plantas por meio do cultivo de comunidades microbianas e avaliações bioquímicas e experimentais de inoculação em planta modelo (Setaria viridis). Dessa forma, pretendemos expandir o conhecimento a respeito da complexa relação entre microrganismos, planta e ambiente e, com isso, contribuir para o desenvolvimento de soluções para o problema de aumento de rendimento na produção sem prejuízos aos ecossistemas. Esse deve ser o caminho para obter sustentabilidade na agricultura. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Graduação: (1) / Mestrado acadêmico: (2) / Doutorado: (2) . Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Coordenador / Lúcia Maria Carareto Alves - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Integrante / Jairo Osvaldo Cazetta - Integrante / Maria Inês Tiraboschi Ferro - Integrante / Luis Guillermo Teheran Sierra - Integrante / Rafael Correia da Silva - Integrante / Michelli Inácio Gonçalves Funnicelli - Integrante / Maria Fernanda Zaneli Campanari - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro. Número de produções C, T & A: 3
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2017-2019. Nova vertente para descoberta de biomoléculas, lacases, com aplicação biotecnológica (LBMPMetaDB)
Descrição: Mineração de dados metagenômicos e genômicos tem crescido exponencialmente nos últimos anos, devido a grande quantidade de dados gerados pelo sequenciamento de nova geração entretanto há uma sobrecarga nas bases de dados utilizada para a análise. A estruturação de uma base de dados que permita entender analisar e possivelmente prospectar genes e organismos dentro do grupo de pesquisa daria mais velocidade para as pesquisas com a facilidade no acesso a grande informação contida nos genomas e metagenomas e assim auxiliar os grupos de pesquisa a explorar os resultados já obtidos em diversos estudos, com o objetivo de desvendar o inexplorado, tanto em nível de organismos como genes e metabolitos secundários. Assim, o objetivo desse projeto é implementar um sistema WEB para montagem e anotação de Metagenomas, através de pipelines testados pelo grupo, servindo como um sistema que possa ser utilizado para qualquer tipo de metagenoma de um banco local de genes a partir do resultado da mineração daqueles com interesse biotecnológico, e assim prospectar enzimas importantes e versáteis tais como as lacases para aplicação biotecnológica por exemplo em biorremediação e bioenergia entre outros, e ainda avaliar a diferença quanto as diferentes funções e estruturas. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Coordenador / Camila Cesário Fernandes - Integrante / Erica Mendes Lopes - Integrante / Elisângela Soares Gomes - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2017-2018. Genoma e mecanismos de resistência ao mercúrio em microrganismos endofíticos como estratégia para desenvolvimento de processos de biorremediação
Descrição: Em diversos ambientes, plantas são hospedeiras de uma grande quantidade de microrganismos mutualísticos, sendo os endófitos um importante grupo. A introdução no ambiente de produtos químicos antropogênicos, tais como o mercúrio, influenciam comunidades microbianas. O mercúrio e todas as suas formas químicas têm ampla utilidade no setor industrial, entretanto são tóxicos para a saúde humana e meio ambiente. Nessa perspectiva, espécies de microrganismos que apresentam mecanismos de resistência e/ou tolerância a metais revelam vantagens seletivas sob condições tóxicas em comparação a espécies mais sensíveis. A contaminação do solo com mercúrios é relatada em várias localidades, incluindo o Pantanal brasileiro. Dessa forma, será realizada análise de dados de sequenciamento de alta eficiência para caracterização e identificação de táxons presentes nas comunidades microbianas endofíticas de plantas em área do Pantanal contaminada com mercúrio, incluindo a avaliação de expressão gênica de dois isolados para elucidação de vias de resistência, além das descrições de seus genomas. Os resultados dessa análise e o consequente conhecimento adquirido, poderão subsidiar o desenvolvimento de processos de descontaminação in loco, contribuindo com o planejamento ambiental, manejo e conservação do bioma Pantanal, bem como com a qualidade de vida e segurança para as populações que vivem em áreas contaminadas por mercúrio.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Marcos Antônio Soares - Coordenador. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2016-2018. Composição funcional e taxonômica de enzimas carbohidrases que atuam na desconstrução da lignocelulose de torta de filtro
Descrição: A torta de filtro apresenta bagaço residual oriundo do processo deextração do caldo de cana-de-açúcar e quando armazenada por longos períodos, setorna um habitat ideal para o desenvolvimento de comunidades microbianas queatuam na desconstrução da lignocelulose. Dessa forma, a fim de revelar características funcionais e ecológicas que podem distingui-lo de outros ambientes com elevada disposição de material lignocelulósico, análises de dados de sequenciamento de DNA metagenômico serão realizadas a partir da torta de filtro armazenada. O objetivo portanto será determinar, além da composição taxonômica, os genes que codificam enzimas capazes de atuar na desconstrução da biomassa lignocelulósica e na liberação de açúcares menores, ácidos orgânicos e outros nutrientes. A presença de microrganismos reconhecidamente patogênicos também deve ser investigada para indicar se há riscos envolvidos na utilização desse material (torta de filtro) como fertilizante. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Eliana Gertrudes de Macedo Lemos - Integrante / Jackson Antonio Marcondes de Souza - Coordenador / Wellington Pine Omori - Integrante / Camila Cesário Fernandes - Integrante / Luciano Takeshi Kishi - Integrante / Claudio Damasceno Pavani - Integrante / Elisângela Soares Gomes - Integrante. Financiador(es): Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Bolsa. Número de produções C, T & A: 1
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2016-2017. Identificação e análise funcional de proteínas LEA dehidrinas ortólogas de Arabidopsis e soja
Descrição: Os mecanismos de proteção em sementes ortodoxas previnem as células de danos abióticos, preservando o meio celular durante períodos prolongados de estresse. As proteínas LEA desempenham um importante papel, permitindo que as células das sementes ortodoxas reduzam ou evitem, o dano causado pela perda de água durante o processo de maturação e na preservação dos constituintes celulares durante a anidrobiose. O complemento total de proteínas LEA em soja (Glycine max) e Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) foi catalogado, sendo os pares de ortólogos identificados. As LEA dehidrinas são uma das nove diferentes famílias LEA, encontradas nestas e em outras espécies. A pesquisa proposta será conduzida utilizando-se proteínas recombinantes e o sistema de expressão em fagos (Phage display) para desvendar as interações proteína: proteína entre proteínas LEA dehidrinas e suas proteínas "clientes" em soja e Arabidopsis. Técnicas avançadas de biologia molecular (RT-PCR, síntese de proteínas recombinantes, Phage Display, Paired-End PhageSeq) serão utilizadas na identificação, ou seja, para os ortólogos de proteínas LEA dehidrinas selecionadas de cada espécie, serão identificadas aquelas proteínas clientes com as quais as LEAs interagem. Os resultados esperados deste projeto consistem em expandir o conhecimento sobre a função das LEAs em proteger as células dos danos de dessecação letais. Tais informações, quando aplicadas às sementes de soja, podem auxiliar os esforços para melhorar a longevidade no armazenamento da soja, potencialmente fornecendo protocolos de tecnologia de sementes, permitindo ao mesmo tempo a intervenção para a melhoria da qualidade das sementes produzidas nos programas de melhoramento genético. O conhecimento das proteínas LEAs pode também fornecer meios de proteger estas proteínas "clientes" em células vegetativas em condições de estresse, durante as fases de florescimento, polinização e enchimento de grãos, proporcionando formas de melhorar a resistência aos estresses nos períodos críticos de desenvolvimento da cultura, sem contudo provocar queda nos rendimentos.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Sandra Helena Unêda-Trevisoli - Coordenador / Lynnette Dirk - Integrante / Allan Bruce Downie - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo - Bolsa.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2015-Atual. Biorremediação e mecanismos de resistência ao mercúrio por microbiota presente em áreas contaminadas no estado de Mato Grosso
Descrição: O projeto visa avaliar o efeito da contaminação do mercúrio na microbiota, combinando abordagens baseadas em cultivo e sequenciamento de DNA, da microbiota associada a plantas em áreas contaminadas, e, de RNA dos microrganismos tolerantes isolados. Dessa forma, será possível avaliar a diversidade da microbiota, o potencial de biorremediação e reconhecer os mecanismos moleculares envolvidos. Os resultados subsidiarão futuros processos de biorremediação.. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Marcos Antônio Soares - Coordenador / Euziclei Gonzaga de Almeida - Integrante / Gilvan Ferreira da Silva - Integrante / Eduardo Beraldo de Morais - Integrante / Zoraidy Marques de Lima - Integrante / Danila Soares Caixeta - Integrante / Marilza Castilho Terezo - Integrante / Joaquim Manoel da Silva - Integrante / Tiago Antônio de Oliveira Mendes - Integrante / James Francis White - Integrante / Haiyan Li - Integrante. Financiador(es): Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Mato Grosso - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.
2014-2017. Sequenciamento e análise do genoma de Frieseomelitta varia: em busca de assinaturas moleculares da evolução das abelhas e inserção do Brasil no i5K
Descrição: O Consórcio Internacional i5K tem a meta de sequenciar o genoma de 5.000 espécies de insetos e outros artrópodes nos próximos 5 anos. Esse volume de dados e o conhecimento gerado nos ajudará a compreender melhor a história evolutiva das espécies e os níveis de complexidade biológica. As abelhas são, de longe, os mais importantes polinizadores em ecossistemas agrícolas e naturais. No entanto, o recente colapso das populações de abelhas, ameaça este equilíbrio. Uma estratégia promissora para contornar este risco é a criação em larga escala destes polinizadores. Contudo esta ferramenta é altamente dependente do profundo conhecimento dos sistemas biológicos em questão. Embora algumas abelhas tenham sido, por décadas, importantes organismos para estudos de plasticidade de comportamento, comunicação, aprendizado e memória, muitos aspectos da biologia destes importantes insetos são ainda desconhecidos. Nosso Grupo de Pesquisa tem por objetivo sequenciar e analisar o genoma de uma abelha nativa sem ferrão, Frieseomelitta varia. A espécie F. varia possui ampla distribuição, com ninhos abundantes em diferentes biomas no Brasil. Devido à sua fácil criação em ninhos racionais de meliponicultura, F. varia possui grande potencial polinizador tanto para agri- e horticulturas, como também para plantas nativas em áreas de proteção. Pelo sequenciamento dessa espécie também estaremos inseridos oficialmente na iniciativa i5K. Além de gerar informações genômicas para F. varia, que será uma das primeiras espécies de meliponídeos incluída em projetos genoma de abelhas, vamos comparar este genoma com o da abelha Apis mellifera em busca de semelhanças e diferenças que justifiquem as modificações na morfologia, fisiologia e comportamento destas abelhas. O amplo conhecimento da biologia das abelhas sem ferrão terá como consequência natural contribuições práticas e tecnológicas com repercussões econômicas e ecológicas.O estudo genômico de Frieseomelitta varia dará acesso a informações de caráter mais aplicado,especialmente relacionadas à capacidade de polinização. A médio e longo prazos, essas informações poderão ser aplicadas para o desenvolvimento de programas de melhoramento genético, produção agrícola e conservação ambiental.Os dados de sequenciamento de Frieseomelitta varia nos permitirão identificar: (i) genes relacionados à origem e manutenção da socialidade, (ii) redes de interação gênica que conduzem a vias de desenvolvimento casta-específicas, (iii) a base genética da infertilidade em abelhas operárias, (iv) alvos moleculares relacionados à regulação de comportamentos, especialmente de polinização, e (v) substâncias de interesse econômico (mel, própolis), farmacológico e terapêutico. Além disto, análises de genômica comparativa com a abelha Apis mellifera permitirão identificar semelhanças e diferenças que justifiquem as modificações na morfologia, fisiologia e comportamento destas abelhas. Não menos importante, pretendemos avançar nas análises "in silico" de tal maneira que possamos contribuir efetivamente para o avanço no conhecimento destas espécies tão importantes para nosso ecossistema.. Situação: Concluído; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Mestrado acadêmico: (3) Doutorado: (1) . Integrantes: Daniel Guariz Pinheiro - Integrante / Francis de Morais Franco Nunes - Integrante / K Hartfelder - Integrante / Lívia Maria Rosatto Moda - Integrante / Alexandre dos Santos Cristino - Integrante / Zilá Luz Paulino Simões - Integrante / BARCHUK, ANGEL R. - Integrante / BITONDI, MÁRCIA MG - Coordenador / Anete Pedro Lourenço - Integrante / Carlos Gustavo Nunes da Silva - Integrante / Marco Antonio Del Lama - Integrante / Spartaco Astolfi Filho - Integrante / Alexandre Rossi Paschoal - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Auxílio financeiro.
Membro: Daniel Guariz Pinheiro.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (0)

Participação em eventos

Total de participação em eventos (14)

Integração da Pesquisa Pública com Cana-de-açúcar no Brasil. 2018. (Simpósio).
Ferramentas de bioinformática para análise de dados de RNA-seq.Montagem de transcriptomas a partir de dados de sequências de cDNA. 2017. (Oficina).
II Curso em Biossegurança - Organismos Geneticamente Modificados (OGM). 2017. (Outra).
Simpósio Internacional Fronteiras de Conhecimento em RNA e microRNA.Genômica e Tecnologia em RNA: Estratégia in silico para montagem de novo de transcriptomas e análise de expressão gênica. 2017. (Simpósio).
X Curso de Verão em Bioinformática.Análise de Expressão Gênica com RNA-Seq. 2017. (Oficina).
Brazilian-International Congress of Genetics. DE NOVO TRANSCRIPTOME ASSEMBLY AND GENE EXPRESSION FOR ANTHOCYANIN PATHWAY IN UTRICULARIA FLOWER VARIANTS. 2016. (Congresso).
Ferramentas de Bioinformática Aplicadas as Análises de Sequências de RNA-SEQ.Montagem de transcriptomas a partir de dados de sequências de cDNA. 2016. (Oficina).
I Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. Abordagens atuais em análises genômicas de micro-organismos. 2016. (Congresso).
I Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. Sessão de apresentação oral de trabalhos científicos. 2016. (Congresso).
Ferramentas de bioinformática aplicadas às análises de sequências de RNA-Seq.Montagem de transcriptomas a partir de dados de sequências de cDNA. 2015. (Oficina).
XIV Jornada Anual Biológica da UNESP - JABU.Bioinformática Aplicada à Genética Humana. 2015. (Encontro).
10º Fórum de Microbiologia Agropecuária.Comissão Avaliadora de Pôsteres. 2014. (Outra).
Ferramentas de bioinformática aplicadas às análises de sequências transcriptômicas.Montagem de novo de transcriptomas a partir de dados de sequências de cDNA. 2014. (Oficina).
Seminários CREBIO - 1º CICLO.Análise de perfis transcricionais no processo de ativação dos ovários em abelhas Apis mellifera. 2014. (Seminário).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (17)

SARAN, L. M. ; ALVES, L. M. C. ; ZIED, D. C. ; RIGOBELO, E. C. ; DUDA, R. M. ; PINHEIRO, D. G.. I Escola de Verão em Microbiologia Agropecuária. 2023. Outro
PINHEIRO, D. G.; CAMPANARI, M. F. Z. ; SILVA, R. C. ; CARVALHO, L. A. L. ; SIERRA, L. G. T. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; JULIAO, M. H. M. ; SILVA, S. R.. IV Curso de Bioinformática (FCAV). 2019. Outro
PINHEIRO, D. G.; VARANI, A. M. ; MIRANDA, V. F. O. ; KISHI, L. T. ; SIERRA, L. G. T. ; SILVA, S. R. ; SILVA, R. C. ; FUNNICELLI, M. I. G.. III Curso de Verão em Bioinformática (FCAV). 2018. Outro
SILVA, R. C. ; CAMPANARI, M. F. Z. ; SIERRA, L. G. T. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; PINHEIRO, D. G.. Minicurso do XIV Curso de Inverno de Genética: Explorando ferramentas de Bioinformática. 2018. Outro
PINHEIRO, D. G.; VARANI, A. M. ; MIRANDA, V. F. O. ; KISHI, L. T. ; OMORI, W. P. ; SILVA, S. R. ; RODRIGUES, F. G. ; PAVANI, C. D. ; LOPES, E. M.. II Curso de Verão em Bioinformática (FCAV). 2017. Outro
PINHEIRO, D. G.; VARANI, A. M. ; MIRANDA, V. F. O. ; KISHI, L. T. ; OMORI, W. P. ; SILVA, S. R. ; NOCITI, R. P.. I Curso de Verão em Bioinformática (FCAV). 2016. Outro
OLIVEIRA, R. A. ; FERRO, M. I. T. ; PINHEIRO, D. G. ; VARANI, A. M. ; SOUZA, J. A. M. ; MONTASSIER, H. J. ; DUDA, R. M. ; PENHA, H. A. ; CARVALHO, F. M. S. ; VANTINI, J. S. ; GIMENEZ, D. J. ; CASTELLANE, T. C. L. ; MACHADO, A. C. R. ; COZENTINO, N. C. B. ; CARDOZO, M. V. ; MOCHI, D. A. ; MARIGUELA, V. C. ; BORZI, M. M. ; PAVANI, C. D. ; BUZINARI, A. C. ; et.al. I Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental. 2016. Congresso
PINHEIRO, D. G.. 9º Curso de Verão em Bioinformática. 2013. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. I Escola de estudos avançados em Genômica. 2013. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. 8º Curso de Verão em Bioinformática. 2012. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. 7º Curso de Verão em Bioinfomática. 2011. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. I Oficina de Bioinformática. 2011. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. 6º Curso de Verão em Bioinformática. 2010. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. 5º Curso de Verão em Bioinformática. 2009. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. 4º Curso de Verão em Bioinformática. 2008. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. 3º Curso de Verão em Bioinformática. 2007. (Outro).. . 0.
PINHEIRO, D. G.. 1º Curso de Verão em Bioinformática. 2005. (Outro).. . 0.

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (9)

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Alessandro de Mello Varani (11.0)
CASTELLANE, TEREZA CRISTINA L. ; FERNANDES, CAMILA C. ; Pinheiro, Daniel G. ; LEMOS, MANOEL VICTOR FRANCO ; VARANI, ALESSANDRO M.. Exploratory comparative transcriptomic analysis reveals potential gene targets associated with Cry1A.105 and Cry2Ab2 resistance in fall armyworm (Spodoptera frugiperda). FUNCTIONAL & INTEGRATIVE GENOMICS. v. 24, p. 129, issn: 1438-793X, 2024. Qualis: A2
SILVA, SAURA R. ; F. O. MIRANDA, VITOR ; MICHAEL, TODD P. ; P'ACHNO, BARTOSZ J. ; MATOS, RAMON G. ; ADAMEC, LUBOMIR ; L. K. POND, SERGEI ; LUCACI, ALEXANDER G. ; PINHEIRO, DANIEL G. ; Varani, Alessandro M.. The phylogenomics and evolutionary dynamics of the organellar genomes in carnivorous Utricularia and Genlisea species (Lentibulariaceae). MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION. v. 181, p. 107711, issn: 1055-7903, 2023. Qualis: A1
SILVA, SAURA R. ; Pinheiro, Daniel G. ; PENHA, HELEN A. ; P'ACHNO, BARTOSZ J. ; MICHAEL, TODD P. ; MEER, ELLIOTT J. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, ALESSANDRO M.. Intraspecific Variation within the Utricularia amethystina Species Morphotypes Based on Chloroplast Genomes. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES. v. 20, p. 6130, issn: 1422-0067, 2019. Qualis: A2
SILVA, SAURA R. ; MICHAEL, TODD P. ; MEER, ELLIOTT J. ; Pinheiro, Daniel G. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; MIRANDA, VITOR F. O.. Comparative genomic analysis of Genlisea (corkscrew plants-Lentibulariaceae) chloroplast genomes reveals an increasing loss of the ndh genes. PLoS One. v. 13, p. e0190321, issn: 1932-6203, 2018. Qualis: A1
SILVA, SAURA R. ; ALVARENGA, DANILLO O. ; ARANGUREN, YANI ; PENHA, HELEN A. ; FERNANDES, CAMILA C. ; Pinheiro, Daniel G. ; OLIVEIRA, MARCOS T. ; MICHAEL, TODD P. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; VARANI, ALESSANDRO M.. The mitochondrial genome of the terrestrial carnivorous plant Utricularia reniformis (Lentibulariaceae): Structure, comparative analysis and evolutionary landmarks. PLoS One. v. 12, p. e0180484, issn: 1932-6203, 2017. Qualis: A1
SILVA, SAURA R. ; DIAZ, YANI C. A. ; PENHA, HELEN ALVES ; Pinheiro, Daniel G. ; FERNANDES, CAMILA C. ; MIRANDA, VITOR F. O. ; MICHAEL, TODD P. ; VARANI, ALESSANDRO M.. The Chloroplast Genome of Utricularia reniformis Sheds Light on the Evolution of the ndh Gene Complex of Terrestrial Carnivorous Plants from the Lentibulariaceae Family. Plos One. v. 11, p. e0165176, issn: 1932-6203, 2016. Qualis: A1
SILVA, SAURA R. ; Pinheiro, Daniel G. ; MEER, ELLIOTT J. ; MICHAEL, TODD P. ; VARANI, ALESSANDRO M. ; MIRANDA, VITOR F. O.. The complete chloroplast genome sequence of the leafy bladderwort, Utricularia foliosa L. (Lentibulariaceae). Conservation Genetics Resources (Online). v. ?, p. 1-4, issn: 1877-7260, 2016. Qualis: B2
SILVA, S. R. ; ARANGUREN, Y. ; Varani, Alessandro M. ; JAN P'ACHNO, BARTOSZ ; PINHEIRO, D. G. ; SIERRA, E. M. ; MATOS, R. G. ; MICHAEL, T. P. ; MIRANDA, V. F. O.. Phylogenomics of Utricularia (sect. Utricularia: Lentibulariaceae): a possible tale of reticulation of a complex carnivorous plant group. Em: 67th Brazilian Congress of Genetics, 2022, Natal/RN. 67th Brazilian Congress of Genetics, 2022.
SILVA, SAURA R. ; MIRANDA, V. F. O. ; PINHEIRO, D. G. ; MICHAEL, TODD P. ; M. VARANI, ALESSANDRO. Evolution of expansin gene family in carnivorous plants Genlisea and Utricularia. Em: 66º Congresso Brasileiro de Genética, 2021, Online. 66º Congresso Brasileiro de Genética, v. 1, p. 481, 2021.
SILVA, S. R. ; ARANGUREN, Y. ; PENHA, H. A. ; PINHEIRO, D. G. ; FERNANDES, CAMILA C. ; MORAES, A. P. ; DE MIRANDA, VITOR FERNANDES O. ; MICHAEL, T. P. ; VARANI, A. M.. Unraveling the genome sequence of the Utricularia reniformis a.st.-hil. (Lentibulariaceae): insights into the evolution of a terrestrial carnivorous plant. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.
Pinheiro, D.G. ; SILVA, S. R. ; MENEZES, C. G. ; PENHA, H. A. ; de Souza, Jackson Antônio Marcondes ; DESIDERIO, J. A. ; CARVALHO, R. F. ; VARANI, A. M. ; MIRANDA, V. F. O.. De novo transcriptome assembly and gene expression for anthocyanin pathway in Utricularia flower variants. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Maria Ines Tiraboschi Ferro (5.0)
TEHERAN-SIERRA, LUIS GUILLERMO ; FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; Ferro, Maria Inês Tiraboschi ; SOARES, MARCOS ANTÔNIO ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ. Bacterial communities associated with sugarcane under different agricultural management exhibit a diversity of plant growth-promoting traits and evidence of synergistic effect. MICROBIOLOGICAL RESEARCH. v. 247, p. 126729, issn: 0944-5013, 2021. Qualis: A3
ROBIATI TELLES, BRUNA ; DE SOUZA CARVALHO, FLÁVIA MARIA ; DA SILVA VANTINI, JULIANA ; ANDRUCIOLI BELESINI, ALINE ; MARQUES DE CASTRO, GIOVANNI ; GIACHETTO, Poliana Fernanda ; DOMINGUES CARLIN, SAMIRA ; RAMOS DA SILVA, THAIS ; GUARIZ PINHEIRO, DANIEL ; CAZETTA, Jairo Osvaldo ; TIRABOSCHI FERRO, MARIA INÊS. Prolonged Water Deficit Reveals New Profile of Sugarcane Gene Expression and Metabolic Pathway Related to Tolerance. Sugar Tech. v. 21, p. 451-461, issn: 0972-1525, 2018. Qualis: A4
BELESINI, A.A. ; CARVALHO, F.M.S. ; TELLES, B.R. ; DE CASTRO, G.M. ; GIACHETTO, P.F. ; VANTINI, J.S. ; CARLIN, S.D. ; CAZETTA, J.O. ; PINHEIRO, D.G. ; FERRO, M.I.T.. De novo transcriptome assembly of sugarcane leaves submitted to prolonged water-deficit stress. GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH. v. 16, p. 1, issn: 1676-5680, 2017. Qualis: B3
SIERRA, L. G. T. ; FUNNICELLI, M. I. G. ; FERRO, M. I. T. ; SOARES, M. A. ; PINHEIRO, D. G.. Constructing a library of bacteria and yeast communities from organic and conventional sugarcane. Em: II Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, 2018, Viçosa. Anais do II Congresso Brasileiro de Microbiologia Agropecuária, Agrícola e Ambiental, p. 185, 2018.
BELESINI, A. A. ; TELLES, B. R. ; PINHEIRO, D. ; GIACHETO, Poliana Fernanda ; CAVALLARI, S. D. C. ; CAZETTA, Jairo Osvaldo ; FERRO, M.I.T.. Sequenciamento e análise de genótipos de cana-de-açúcar submetidas à prolongada limitação hídrica. Em: XVII Simpósio de Genética, 2014, São José do Rio Preto. Anais Eletrônicos do XVII Simpósio de Genética, 2014.

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Eliana Gertrudes de Macedo Lemos (4.0)
FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; TEHERAN-SIERRA, LUIS GUILLERMO ; DIBELLI, SABRINA CUSTODIO ; Lemos, Eliana Gertrudes de Macedo ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ. Unveiling genomic features linked to traits of plant growth-promoting bacterial communities from sugarcane. SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT. v. 947, p. 174577, issn: 0048-9697, 2024. Qualis: A1
FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; GOMES-PEPE, ELISÂNGELA SOARES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; CAMPANHARO, João Carlos ; FERNANDES, CAMILA CESÁRIO ; KISHI, LUCIANO TAKESHI ; CARARETO ALVES, LÚCIA MARIA ; de Macedo Lemos, Eliana Gertrudes. Metagenome-assembled genome of a Chitinophaga sp. and its potential in plant biomass degradation, as well of affiliated Pandoraea and Labrys species. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY. v. 37, p. 162, issn: 0959-3993, 2021. Qualis: A4
OMORI, WELLINGTON P. ; PINHEIRO, DANIEL G. ; KISHI, Luciano T. ; FERNANDES, CAMILA C. ; FERNANDES, GABRIELA C. ; GOMES-PEPE, ELISÂNGELA S. ; PAVANI, CLAUDIO D. ; LEMOS, ELIANA G. DE M. ; SOUZA, JACKSON A. M. DE. Draft genome of Thermomonospora sp. CIT 1 (Thermomonosporaceae) and in silico evidence of its functional role in filter cake biomass deconstruction. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION). v. 42, p. 145-150, issn: 1415-4757, 2019. Qualis: A4
FUNICELLI, M. I. ; CARVALHO, L. A. L. ; SIERRA, L. G. T. ; Dibelli, S. C. ; LEMOS, ELIANA G. DE M. ; PINHEIRO, D. G.. Unveiling genomic features linked to traits of plant- growth-promoting bacterial communities from sugarcane. Em: International Symbosium on Agricultural Microbiology, 2022, Lavras/MG. Annals of International Symbosium on Agricultural Microbiology 2022, 2022.

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Everlon Cid Rigobelo (4.0)
RIGOBELO, EVERLON CID ; DE ANDRADE, LUANA ALVES ; SANTOS, CARLOS HENRIQUE BARBOSA ; FREZARIN, EDVAN TECIANO ; SALES, LUZIANE RAMOS ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; GUARIZ PINHEIRO, DANIEL ; NICODEMO, DANIEL ; BABALOLA, OLUBUKOLA OLURANTI ; VERDI, MARIA CAROLINE QUECINE ; MONDIN, MATEUS ; DESOIGNIES, NICOLAS. Effects of Trichoderma harzianum and Bacillus subtilis on the root and soil microbiomes of the soybean plant INTACTA RR2 PRO-. Frontiers in Plant Science. v. 15, p. 1-14, issn: 1664-462X, 2024. Qualis: A1
Rigobelo, Everlon Cid; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; SANTOS, CARLOS HENRIQUE BARBOSA ; FREZARIN, EDVAN TECIANO ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; Nicodemo, Daniel ; BABALOLA, OLUBUKOLA OLURANTI ; DESOIGNIES, NICOLAS. Growth promotion and modulation of the soybean microbiome INTACTA RR PRO with the application of the fungi Trichoderma harzianum and Purpureocillum lilacinum. Scientific Reports. v. 14, p. 21004, issn: 2045-2322, 2024. Qualis: A2
SIQUEIRA, JOSIANE SOARES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; SANTOS, CARLOS HENRIQUE BARBOSA ; FREZARIN, EDVAN TECIANO ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; Nicodemo, Daniel ; DESOIGNIES, NICOLAS ; Rigobelo, Everlon Cid. Influence of Growth Support on the Diversity, Composition, and Functionality of Microbial Communities Associated with Tillandsia recurvata. MICROBIAL ECOLOGY. v. 87, p. 1-15, issn: 0095-3628, 2024. Qualis: A1
DA SILVA, MAURA SANTOS REIS DE ANDRADE ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; BRAOS, LUCAS BOSCOV ; DE SOUSA ANTUNES, LUIZ FERNANDO ; DA SILVA, CAMILLA SANTOS REIS DE ANDRADE ; DA SILVA, CLEUDISON GABRIEL NASCIMENTO ; Pinheiro, Daniel Guariz ; CORREIA, MARIA ELIZABETH FERNANDES ; ARAÚJO, EDNALDO DA SILVA ; COLNAGO, LUIZ ALBERTO ; DESOIGNIES, NICOLAS ; ZONTA, EVERALDO ; RIGOBELO, EVERLON CID. Effect of the application of vermicompost and millicompost humic acids about the soybean microbiome under water restriction conditions. Frontiers in Microbiology. v. 13, p. 1-15, issn: 1664-302X, 2022. Qualis: A1

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Jackson Antônio Marcondes de Souza (3.0)
OMORI, WELLINGTON P. ; PINHEIRO, DANIEL G. ; KISHI, Luciano T. ; FERNANDES, CAMILA C. ; FERNANDES, GABRIELA C. ; GOMES-PEPE, ELISÂNGELA S. ; PAVANI, CLAUDIO D. ; LEMOS, ELIANA G. DE M. ; SOUZA, JACKSON A. M. DE. Draft genome of Thermomonospora sp. CIT 1 (Thermomonosporaceae) and in silico evidence of its functional role in filter cake biomass deconstruction. GENETICS AND MOLECULAR BIOLOGY (ONLINE VERSION). v. 42, p. 145-150, issn: 1415-4757, 2019. Qualis: A4
OMORI, W. P. ; SIERRA, L. G. T. ; PINHEIRO, D. G. ; MIRANDA, V. F. O. ; SOUZA, J. A. M.. Minireview sobre abordagens, métodos e conceitos para análise de um microbioma. Tópicos Especiais em Genética Aplicada. 4ed.Jaboticabal. Em: Janete Apparecida Desidério (Coordenador); Carla Resende Bastos (Coordenador); Maria Laura Viola Augusto (Coordenador); Nestor Darío Franco (Autor); Paula Castanho Borges (Autor). (Org.). Tópicos especiais em genética aplicada. 1ed.Jaboticabal/SP. : FUNEP. 2017.v. 4, p. 122-129.
Pinheiro, D.G. ; SILVA, S. R. ; MENEZES, C. G. ; PENHA, H. A. ; de Souza, Jackson Antônio Marcondes ; DESIDERIO, J. A. ; CARVALHO, R. F. ; VARANI, A. M. ; MIRANDA, V. F. O.. De novo transcriptome assembly and gene expression for anthocyanin pathway in Utricularia flower variants. Em: 62 Brazilian-International Congress of Genetics, 2016, Caxambu, MG. 62 Brazilian-International Congress of Genetics. Ribeirão Preto,SP: Sociedade Brasileira de Genética, v. 1, p. 1-1, 2016.

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Jesus Aparecido Ferro (3.0)
SUÁREZ-ACEVEDO, SARA ; CHAVES-BEDOYA, GIOVANNI ; GUARIZ-PINHEIRO, DANIEL ; CRISTINA-LOPES, ALINE ; MARI-MURATA, MAYARA ; HIROCHI-HERAI, ROBERTO ; APARECIDO-FERRO, JESUS ; RODAS-MENDOZA, ELKIN. Comparative transcriptional analyzes of Xanthomonas citri subsp. citri reveal mechanisms of adaptation and bacterial virulence in the early stage of citrus canker disease. EUROPEAN JOURNAL OF PLANT PATHOLOGY. v. 163, p. 557-572, issn: 0929-1873, 2022. Qualis: A2
SILVA, DANIELLY B. S. ; FONSECA, LARISSA F. S. ; PINHEIRO, DANIEL G. ; MAGALHÃES, ANA F. B. ; MUNIZ, MARIA M. M. ; Ferro, Jesus A. ; BALDI, FERNANDO ; CHARDULO, LUIS A. L. ; SCHNABEL, ROBERT D. ; TAYLOR, JEREMY F. ; ALBUQUERQUE, LUCIA G.. Spliced genes in muscle from Nelore Cattle and their association with carcass and meat quality. Scientific Reports. v. 10, p. 14701, issn: 2045-2322, 2020. Qualis: A2
DOS SANTOS SILVA, DANIELLY BERALDO ; FONSECA, LARISSA FERNANDA SIMIELLI ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; MUNIZ, MARIA MALANE MAGALHÃES ; MAGALHÃES, ANA FABRÍCIA BRAGA ; BALDI, FERNANDO ; Ferro, Jesus Aparecido ; CHARDULO, LUIS ARTUR LOYOLA ; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVÃO. Prediction of hub genes associated with intramuscular fat content in Nelore cattle. BMC GENOMICS. v. 20, p. 520, issn: 1471-2164, 2019. Qualis: A2

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Lúcia Maria Carareto Alves (3.0)
BONALDI, DAIANE SILVA ; FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; FERNANDES, CAMILA CESÁRIO ; LAURITO, HENRIQUE FONTELLAS ; Pinheiro, Daniel Guariz ; ALVES, LUCIA MARIA CARARETO. Genetic and biochemical determinants in potentially toxic metals resistance and plant growth promotion in Rhizobium sp LBMP-C04. World Journal of Microbiology and Biotechnology (Online). v. 41, p. 7-17, issn: 0959-3993, 2024. Qualis: A4
FUNNICELLI, MICHELLI INÁCIO GONÇALVES ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; GOMES-PEPE, ELISÂNGELA SOARES ; DE CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; CAMPANHARO, João Carlos ; FERNANDES, CAMILA CESÁRIO ; KISHI, LUCIANO TAKESHI ; CARARETO ALVES, LÚCIA MARIA ; de Macedo Lemos, Eliana Gertrudes. Metagenome-assembled genome of a Chitinophaga sp. and its potential in plant biomass degradation, as well of affiliated Pandoraea and Labrys species. WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY. v. 37, p. 162, issn: 0959-3993, 2021. Qualis: A4
SARAN, L.M. ; MENEGHINE, A. K. ; CELICO, A. S. ; PINHEIRO, D. G. ; CARARETO ALVES, LUCIA M.. Freshwater quality of a stream in agricultural area where organic compost from animal and vegetable wastes is used. CIENCIA E AGROTECNOLOGIA. v. 41, p. 263-278, issn: 1413-7054, 2017. Qualis: C (CIÊNCIA E AGROTECNOLOGIA)

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Marcos Rogério André (2.0)
ANDRÉ, Marcos Rogério ; IKEDA, PRISCILA ; LEE, DANIEL ANTÔNIO BRAGA ; DO AMARAL, RENAN BRESSIANINI ; CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; TORRES, JAIRE MARINHO ; DE MELLO, VICTÓRIA VALENTE CALIFRE ; RICE, GREGORY K. ; CER, REGINA Z. ; LOURENÇO, ELIZABETE CAPTIVO ; OLIVEIRA, CARISA ELISEI ; HERRERA, HEITOR MIRAGLIA ; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES ; Machado, Rosangela Zacarias ; BISHOP-LILLY, KIMBERLY A. ; DALGARD, CLIFTON L. ; DUMLER, J. STEPHEN. Characterization of the bacterial microbiome of non-hematophagous bats and associated ectoparasites from Brazil. Frontiers in Microbiology. v. 14, p. 1261156, issn: 1664-302X, 2023. Qualis: A1
LUZZI, MAYARA DE CASSIA ; CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES DE ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; LIMA-DUARTE, LEIDIANE ; CAMARGO, JAQUELINE VALÉRIA ; KISHI, LUCIANO TAKESHI ; FERNANDES, CAMILA CESÁRIO ; Machado, Rosangela Zacarias ; SOARES, JOÃO FÁBIO ; André, Marcos Rogério ; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES. Analysis on the prokaryotic microbiome in females and embryonic cell cultures of Rhipicephalus sanguineus tropical and temperate lineages from two specific localities in Brazil. REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINARIA. v. 30, p. e005721, issn: 1984-2961, 2021. Qualis: A2 (REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA)

Daniel Guariz Pinheiro ⇔ Rosangela Zacarias Machado (2.0)
ANDRÉ, Marcos Rogério ; IKEDA, PRISCILA ; LEE, DANIEL ANTÔNIO BRAGA ; DO AMARAL, RENAN BRESSIANINI ; CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; TORRES, JAIRE MARINHO ; DE MELLO, VICTÓRIA VALENTE CALIFRE ; RICE, GREGORY K. ; CER, REGINA Z. ; LOURENÇO, ELIZABETE CAPTIVO ; OLIVEIRA, CARISA ELISEI ; HERRERA, HEITOR MIRAGLIA ; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES ; Machado, Rosangela Zacarias ; BISHOP-LILLY, KIMBERLY A. ; DALGARD, CLIFTON L. ; DUMLER, J. STEPHEN. Characterization of the bacterial microbiome of non-hematophagous bats and associated ectoparasites from Brazil. Frontiers in Microbiology. v. 14, p. 1261156, issn: 1664-302X, 2023. Qualis: A1
LUZZI, MAYARA DE CASSIA ; CARVALHO, LUCAS AMOROSO LOPES DE ; PINHEIRO, DANIEL GUARIZ ; LIMA-DUARTE, LEIDIANE ; CAMARGO, JAQUELINE VALÉRIA ; KISHI, LUCIANO TAKESHI ; FERNANDES, CAMILA CESÁRIO ; Machado, Rosangela Zacarias ; SOARES, JOÃO FÁBIO ; André, Marcos Rogério ; BARROS-BATTESTI, DARCI MORAES. Analysis on the prokaryotic microbiome in females and embryonic cell cultures of Rhipicephalus sanguineus tropical and temperate lineages from two specific localities in Brazil. REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINARIA. v. 30, p. e005721, issn: 1984-2961, 2021. Qualis: A2 (REVISTA BRASILEIRA DE PARASITOLOGIA VETERINÁRIA)

(*) Relatório criado com produções desde 2004 até 2024
Data de processamento: 14/01/2025 17:22:59

Relatório gerado por scriptLattes V9. Os resultados podem ser afetados por possíveis falhas decorrentes de inconsistências no preenchimento dos Currículos Lattes. E-mail de contato: daniel.pinheiro@unesp.br